1:  最长DNA重复序列长度,并输出该序列. 例如  ATCGTAGATCG,它的最大长度为4,序列为 ATCG. package com.li.huawei; import java.util.Scanner; /** * @program: GradleTestUseSubModule * @author: Yafei Li * @create: 2018-08-22 19:37 **/ public class Main { public static void main(String[…

开个新坑,leetcode上面做题目.下面是题目描述: <!-- 给定一个字符串,请你找出其中不含有重复字符的最长子串的长度. 示例 1: 输入: "abcabcbb" 输出: 3 解释: 因为无重复字符的最长子串是 "abc",所以其长度为 3. 示例 2: 输入: "bbbbb" 输出: 1 解释: 因为无重复字符的最长子串是 "b",所以其长度为 1. 示例 3: 输入: "pwwkew" 输出…

最长不下降子序列实现: 利用序列的单调性. 对于任意一个单调序列,如 1 2 3 4 5(是单增的),若这时向序列尾部增添一个数 x,我们只会在意 x 和 5 的大小,若 x>5,增添成功,反之则失败.由于普通代码是从头开始比较,而 x 和 1,2,3,4 的大小比较是没有用处的,这种操作只会造成时间的浪费,所以效率极低.对于单调序列,只需要记录每个序列的最后一个数,每增添一个数 x,直接比较 x 和末尾数的大小.只有最后一个数才是有用的,它表示该序列的最大限度值. 实现方法就是新开一个数组 d…

题目: Given a . For . 解题思路: 这个题让找一个字符串中具有不重复单词的最长子串的长度,如:ababc,子串为abc,长度为3.有这么几个方法: 方法一: 依赖字符串本身的一些特有函数,进行相应操作来完成.我们可以维护一个子串,来保存最长的无重复的子串,并记录当前子串的长度,如果遇到重复的字符,则去掉子串中重复的字符,一次进行下去,最终就能找到最长无重复子串.如str = ababc, substr = a, ab, ba, ab, abc....类似这样的思路.如下代码: /…

Common Subsequence Problem Description A subsequence of a given sequence is the given sequence with some elements (possible none) left out. Given a sequence X = <x1, x2, ..., xm> another sequence Z = <z1, z2, ..., zk> is a subsequence of X if…

题目链接:https://cn.vjudge.net/contest/283743#problem/D 题目大意:给你n个数,然后问你出现m次的最长子串的长度. 具体思路:和上一篇博客的内容差不多,这个是可重复的,就不需要考虑sa的问题了,每一次还是二分答案,判断出现的最长前缀就可以了.注意二分的时候,每一次的寻找,初始值为1,因为这个字符串就已经出现过一次了. AC代码: #include<iostream> #include<stack> #include<cstring…

def incSeq(seq): start = 0 for i in xrange(1, len(seq)): if seq[i] < seq[i-1]: yield start, i - start start = i maxIncSeq = reduce(lambda x,y: x if x[1]>y[1] else y, incSeq(seq)) 得到最长递增子串长度及起始位置,时间复杂度O(n).…

下载地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/agarwala/windowmasker/ 在这个目录下 其中windowmasker 为linux 平台的可执行文件 windowmasker 只需要根据基因组序列本身,就可以识别并标记高重复序列和低复杂度序列, 其有两种工作模式, 第一种为WinMasker模式, 用于识别重复序列:第二种为DUST模式,用于识别低复杂度序列: windowsmasker 的处理过程分为两步: 第一步先生成一个count文件,通过指定 …

例子 "abmadsefadd"  最长长度为7 "avoaid"           最长长度为3 思路 空间换时间hashTable,起始位置设为beg.初始化全局最大值0.开辟字符数组,起初标为0. 访问数组时 如果该字符在hashTable对应的哈希值为1,则计算当前位置到beg的距离,并且把beg赋值为beg+1.如果大于全局最大值,则替换全局最大值 如果该字符在hashTable对应的哈希值为0,则置1 参考代码 #include <iostrea…

题目描述 Description 字符序列的子序列是指从给定字符序列中随意地(不一定连续)去掉若干个字符(可能一个也不去掉)后所形成的字符序列.令给定的字符序列X=“x0,x1,…,xm-1”,序列Y=“y0,y1,…,yk-1”是X的子序列,存在X的一个严格递增下标序列<i0,i1,…,ik-1>,使得对所有的j=0,1,…,k-1,有xij = yj.例如,X=“ABCBDAB”,Y=“BCDB”是X的一个子序列. 对给定的两个字符序列,求出他们最长的公共子序列长度,以及最长公共子序列个数…