它支持各种各样的数据类型,包括基于芯片测序.二代测序数据和基因组注释数据等.整合基因组浏览器(IGV,Integrative Genomics Viewer)进行可视化浏览,它支持各种各式的数据类型,包括基于芯片测序.二代测序数据和基因.IGV具有以下特点: (1) 能在不同尺度下显示单个或多个Reads在参考基因组上的位置,包括Reads在各个染色体上的分布情况和在注释的外显子.内含子.剪接接合区.基因间区的分布情况等: (2) 能在不同尺度下显示不同区域的Reads丰度,以反映不同区域的转录…

整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据类型,包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释. IGV这个工具很牛,发了NB: James T. Robinson, Helga Thorvaldsdóttir, Wendy Winckler, Mitchell Guttman, Eric S. Lander, Gad Getz, Jill P. Mesirov. Integrative Genomics Viewer. Na…

integrative genomics viewer 下载: http://www.broadinstitute.org/igv/download 下载前要注册 导入参考基因组:http://www.broadinstitute.org/software/igv/LoadGenome Genomes, load a fasta or .genome file 注意fasta文件必须有index 查看vcf文件,直接将vcf文件拖入界面即可 http://www.broadinstitute.o…

RGV.AGV.IGV是什么 智能化物流仓储设备迅速崛起的时代,RGV.AGV.IGV,这三种看似有血缘关系的智能设备,到底有什么不同呢? RGV RGV即“有轨制导车辆”,又叫有轨穿梭小车,是与地面导轨接触式的运输车. 目前应用广泛,具有速度快.可靠性高.成本低等特点.可以十分方便地与其他物流系统实现自动对接,如出/入库站台.各种缓冲站.输送机.升降机和机器人等,按照计划进行物料的输送. AGV AGV即“自动导引运输车”,属于轮式移动机器人(WMR)的范畴. 在AGV管理.监控系统的管理和监…

复制于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/5603481.html 整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据类型,包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释.IGV这个工具很牛,发了NB: James T. Robinson, Helga Thorvaldsdóttir, Wendy Winckler, Mitchell Guttman, Eric S. Lander, Gad Getz,…

生物信息学软件: NCBI:BLAST,设定k-mer 默认是全局比对,Blastn是局部比对. PSI-BLAST最灵敏的BLAST,选中部分矩阵后在数据库中查找相应蛋白. PHI-BLAST找氨基酸motif ,参数有-db 数据库,-query 输入文件,-cut输出文件 Ensembl模式生物数据库:biomark UCSC genome browser,各种基因组参数:CG content等可以展开. Ebi:ensembl也在其中. 一个gene: DNA水平:基因名字UCSC找位置…

现在研究一下编译器优化会对生成的指令产生什么影响,在此基础上介绍C语言的volatile限定符.首先看下面的C程序: /* artificial device registers */ unsigned char recv; unsigned char send; /* memory buffer */ unsigned ]; int main(void) { buf[] = recv; buf[] = recv; buf[] = recv; send = ~buf[]; send = ~buf…

下周就去办理离职手续了,之前没有使用过NHibernate,只知道NHibernate是一种ORM框架,但是听说新公司是使用NHibernate在做项目,所以,我就网上找资料学习一下NHibernate,在此以笔记的形式,记录自己的学习过程,一来供自己以后备忘用,而来希望对同样准备学习NHibernate的同行门有所帮助或提供借鉴. 什么是Nhibernate? NHibernate是一个面向.NET环境的对象/关系数据库映射工具.对象/关系数据库映射(object/relational map…

tintColor属性是iOS7之后新加的一个属性,这个属性定义了一个非默认的着色颜色值,其值的设置会影响到以视图为根视图的整个视图层次结构.它主要是改变控件的颜色,以获取一些有意思的视觉效果. tintColor属性-  默认情况下,tintColor属性是默认为nil的,当我们设置一个视图的tintColor属性时,他会自动传播到他的子视图的,因此,要设置一个控件的颜色,即就要设置他的父视图的tintColor,当你没有设置tintColor时,系统默认为蓝色. 与tintColor属性相关…

=================================版权声明================================= 版权声明:原创文章 谢绝转载  啥说的,鄙视那些无视版权随意抓取博文的爬虫小网站,祝你们早升极乐. 请通过右侧公告中的“联系邮箱(wlsandwho@foxmail.com)”联系我 勿用于学术性引用. 勿用于商业出版.商业印刷.商业引用以及其他商业用途. 本文不定期修正完善. 本文链接:http://www.cnblogs.com/wlsandwho/p…

UML建模部分 70. 什么是UML: 答: Unified Modeling Language, 统一建模语言,是一种标准的图形化建模语言.是面向对象分析和设计的标准表示. 71. UML有哪些图: 答: 类图.对象图,用例图,序列图.协作图,状态图.活动图,构件图和部署图. 72. UML图中的符号: 答: 类图 - 三个部分, 类名,属性和方法,三个符号+public - private #protected…

参见Node入门 做出node应用的第一个例子 图片上传浏览.…

从网上看了一些资料,为了方便自己理解,于是把它的编码原理,自己放在excel表格中清晰列出来,方便以后查阅.做的图如下:…

1. 下载对应操作系统和机器的版本 网址: https://www.mongodb.com/download-center?jmp=docs 我的系统为CentOS-6.6 ,64位,所以选择红帽子版,因为它们之间有不得不说的渊源.…

Spring 是什么 •Spring 为简化企业级应用开发而生. 使用 Spring 可以使简单的 JavaBean 实现以前只有 EJB 才能实现的功能. •Spring 是一个 IOC(DI) 和 AOP 容器框架. –轻量级:Spring 是非侵入性的 - 基于 Spring 开发的应用中的对象可以不依赖于 Spring 的 API –依赖注入(DI --- dependency injection.IOC) –面向切面编程(AOP --- aspect oriented programm…

Reference Genome Components 1. GRCh38 is special because it has alternate contigs that represent population haplotypes. Don't know alternate contig from alternate dimension? Spend five minutes now to review terminology in our Dictionary entryReferenc…

RabbitMQ是一个消息代理,核心原理:发送消息,接收消息. RabbitMQ主要用于组件之间的解耦,消息发送者无需知道消息使用者的存在,反之亦然.   单向解耦                                        双向解耦(如:RPC) 例如一个日志系统,很容易使用RabbitMQ简化工作量,一个Consumer进行消息的正常处理,另一个Consumer复制对消息进行日志记录,只要在程序中指定两个Consumer所监听的queue以相同的方式绑定到同一个exchan…

第一步建表:…

aaarticlea/png;base64,iVBORw0KGgoAAAANSUhEUgAAAnoAAAPCCAYAAADvRHWgAAAAAXNSR0IArs4c6QAAAZ1pVFh0WE1MOm…

catalogue . 蜜罐基本概念 . Kippo: SSH低交互蜜罐安装.使用 . Dionaea: 低交互式蜜罐框架部署 . Thug . Amun malware honeypots . Glastopf web honeypot . Wordpot . Conpot SCADA/ICS honeypot . phoneyc . shockpot . MHN(Modern Honey Network) . Database Honeypots . awesome-honeypots .…

play的一大优势是可以将HTTP映射到JAVA API代码(Type-safe mapping from HTTP to an idiomatic Scala or Java API),完美的实现了RestFul架构. Play使用 Controllers来实现MVC结构,如下图所示,Controller是用来连接服务器业务逻辑(business logic)和前台浏览器HTTP请求(HTTP requests)的桥梁.…

详细的使用说明:http://bedtools.readthedocs.org/en/latest/ Collectively, the bedtools utilities are a swiss-army knife of tools for a wide-range of genomics analysis tasks. The most widely-used tools enable genome arithmetic: that is, set theory on the genom…

首先得深入了解协程的原理.如果还没有完全理解,建议看这篇: http://wiki.unity3d.com/index.php/CoroutineScheduler 另外还要对 JavaScript 的 yield 有所了解,可以看 Mozilla 这篇文档: https://developer.mozilla.org/en-US/docs/Web/JavaScript/Reference/Operators/yield -------------------------------------…

[javascript]html5中使用canvas编写头像上传截取功能 本人对canvas很是喜欢,于是想仿照新浪微博头像上传功能(前端使用canvas) 本程序目前在谷歌浏览器和火狐浏览器测试可用,ie浏览器无法支持. 因为ie的安全机制不允许img使用本地路径,所以若想ie支持本程序,必须先将图片上传,然后给img对象上传后的图片地址.我在这里没写,是因为暂时没写上传功能的后端代码,并且还不确定有没有更好的解决办法. 一.如下是新浪的头像截取功能预览图:…

预览生成的项目结构: ying-yue-parent // 顶级总编译控制模块 ying-yue-lib // jar模块 ying-yue-model // 模型对象模块 ying-yue-dao // 持久化层模块 ying-yue-service // 业务 层 模 块 ying-yue-web   // 控制 层 模 块 包名:com.zjx.lollipop 1.准备工作 安装jdk和maven 从apache官网下载maven https://www.apache.org/ 解压即安…

我们使用ActiveMQ为大家实现一种点对点的消息模型. 开发时候,要将apache-activemq-5.12.0-bin.zip解压缩后里面的activemq-all-5.12.0.jar包加入到classpath下面,这个包包含了所有jms接口api的实现. maven依赖 <dependencies> <dependency> <groupId>org.apache.activemq</groupId> <artifactId>activ…

app store 安装软件时发生错误 解决办法: 1. 进入如下目录: sh-3.2# cd Library/Application\ Support/App\ Store/ sh-3.2# pwd /Users/osxlinux/Library/Application Support/App Store sh-3.2# 2. 删除目录下所有文件 sh-3.2# rm -fr * sh-3.2# 3.重启app store 找到相应得软件下载安装即可 -------------------分割…

RCurl作者:…

spring security 默认登录方式都是用户名+密码登录,项目中使用手机+ 短信验证码登录, 没办法,只能实现修改: 需要修改的地方: 1 .自定义 AuthenticationProvider 配置: package com.ycmedia.security; import java.util.ArrayList; import java.util.Collection; import java.util.List; import org.springframework.beans.f…

Unix/Linux版本众多,我们推荐Unix/Linux初学者选用几款典型的Unix/Linux操作系统进行学习. 本文就带大家来安装Solaris 11 64位并且配置好C/C++开发环境 本文所需软件下载地址 33.  F2 开始安装 34.待安装完成 按F8重启…