CSE301 – Bio-Computation】的更多相关文章

IO操作可以分为3类:同步阻塞(BIO).同步非阻塞(NIO).异步(AIO). 同步阻塞(BIO):在此种方式下,用户线程发起一个IO操作以后,必须等待IO操作的完成,只有当真正完成了IO操作以后,用户线程才能做后续的事情. 同步非阻塞(NIO): 在此种方式下,用户线程发起一个IO操作以后,可返回做其它事情,但是用户线程需要时不时的询问IO操作是否完成,从而引入了不必要的CPU资源浪费.Java中的Netty使用的是NIO. 异步(AIO):在此种方式下,用户线程发起一个IO操作以后,可返回…
原文地址: https://my.oschina.net/bluesky0leon/blog/132361 关于BIO | NIO | AIO的讨论一直存在,有时候也很容易让人混淆,就我的理解,给出一个解释: BIO | NIO | AIO,本身的描述都是在Java语言的基础上的.而描述IO,我们需要从两个层面: 编程语言 实现原理 底层基础 从编程语言层面 BIO | NIO | AIO 以Java的角度,理解,linux c里也有AIO的概念(库),这些概念不知道什么原因被炒火起来,这里只从…
最近在做socket通信,最开始是基于Bio开发(其实开发的时候也不知道这种是基于BIO).但是问题来了,客户端发的报文,服务端接收会少,为了解决问题,只能恶补一下相关知识. 服务端: import java.io.BufferedReader; import java.io.IOException; import java.io.InputStream; import java.io.InputStreamReader; import java.io.OutputStream; import…
这里,我将做一个简单的通信程序,分别使用三种原始的通信工具:BIO,NIO,AIO. 功能就是一个服务器,一个客户端.服务器就是处理请求,返回响应.而客户端就是连接服务器,发送请求,接收响应. 第一步:建立通信接口 import java.util.Date; public class Test { public static void main(String[] args) { new Test().test(); } private static final long time = new…
COMPUTER OR GANIZATION AND ARCHITECTURE DESIGNING FOR PERFORMANCE NINTH EDITION Although the performance of mainframe general-purpose computers continues to improve relentlessly, there continue to be applications that are beyond the reach of the cont…
转载地址:http://www.oschina.net/question/54100_16195   tomcat的运行模式有3种.修改他们的运行模式.3种模式的运行是否成功,可以看他的启动控制台,或者启动日志.或者登录他们的默认页面http://localhost:8080/查看其中的服务器状态. 1)bio 默认的模式,性能非常低下,没有经过任何优化处理和支持. 2)nio  利用java的异步io护理技术,no blocking IO技术. 想运行在该模式下,直接修改server.xml里…
http://oldblog.antirez.com/post/fsync-different-thread-useless.html 这是原文作者的博客 把他翻译下 带上自己的一些理解 看看作者引入fdatasync和bio技术上的一些探讨:[非常有用的磁盘持久化技术] 对于从kernel buffers写入到磁盘中这点是非常重要的,fdatasync就是做这个工作,当然本身磁盘本省也有cache层 这层对于我们来讲可以暂时不用考虑, 对于fsync() 把文件数据和文件元信息写入强刷到磁盘中…
转自 http://stevex.blog.51cto.com/4300375/1284437 先来个例子理解一下概念,以银行取款为例: 同步 : 自己亲自出马持银行卡到银行取钱(使用同步IO时,Java自己处理IO读写). 异步 : 委托一小弟拿银行卡到银行取钱,然后给你(使用异步IO时,Java将IO读写委托给OS处理,需要将数据缓冲区地址和大小传给OS(银行卡和密码),OS需要支持异步IO操作API). 阻塞 : ATM排队取款,你只能等待(使用阻塞IO时,Java调用会一直阻塞到读写完成…
Tomcat Connector的三种不同的运行模式性能相差很大,有人测试过的结果如下: 这三种模式的不同之处如下: BIO: 一个线程处理一个请求.缺点:并发量高时,线程数较多,浪费资源. Tomcat7或以下,在Linux系统中默认使用这种方式. NIO: 利用Java的异步IO处理,可以通过少量的线程处理大量的请求. Tomcat8在Linux系统中默认使用这种方式. Tomcat7必须修改Connector配置来启动: <Connector port="8080" pro…
同步阻塞IO(JAVA BIO):     同步并阻塞,服务器实现模式为一个连接一个线程,即客户端有连接请求时服务器端就需要启动一个线程进行处理,如果这个连接不做任何事情会造成不必要的线程开销,当然可以通过线程池机制改善. 异步阻塞IO(Java NIO):     异步阻塞,应用程序发起一个IO操作以后,不等待内核IO操作的完成,等内核完成IO操作以后会通知应用程序,(服务器SELECT程序监听是否有IO就绪,有就绪的就启动线程就绪处理)这其实就是同步和异步最关键的区别,同步必须等待或者主动的…
性能测试 BIO -- Blocking IO 即阻塞式IO NIO -- Non-Blocking IO, 即非阻塞式IO或异步IO 性能 -- 所谓的性能是指服务器响应客户端的能力,对于服务器我们通常用并发客户连接数+系统响应时间来衡量服务器性能,例如,我们说这个服务器在10000个并发下响应时间是100ms,就是高性能,而另一个服务器在10个并发下响应时间是500ms,性能一般.所以提升性能就是提升服务器的并发处理能力,和缩短系统的响应时间. 测试方法 用同一个Java Socket Cl…
BIO  由Acceptor接收Socket,将其转交给Worker来处理. NIO 由Acceptor接收Socket,将其转交给Poller来轮询处理.Poller再将可处理的Socket交给Worker来处理. 不论采用BIO.还是NIO,处理请求的线程数就是worker的数量.Handler是用于协议解析,处理请求的.…
Java目前有三种IO相关的API了,下面简单的说一下: BIO,阻塞IO,最常用的Java IO API,提供一般的流的读写功能.相信学习Java的人,都用过. NIO,非阻塞IO,在JDK1.4中开始出现,大量应用与服务器端编程,用于提高并发访问的性能,常用的NIO框架有Netty,Mina. AIO,异步IO,在JDK1.7开始出现.还没有了解过,等以后了解了再说. 阻塞.非阻塞,同步.异步 在写这篇文章前,在网上了解了一下,其中争议最的问题要数阻塞.非阻塞怎么理解,异步.同步怎么理解.…
[转自]http://qindongliang.iteye.com/blog/2018539 在高性能的IO体系设计中,有几个名词概念常常会使我们感到迷惑不解.具体如下: 序号 问题 1 什么是同步? 2 什么是异步? 3 什么是阻塞? 4 什么是非阻塞? 5 什么是同步阻塞? 6 什么是同步非阻塞? 7 什么是异步阻塞? 8 什么是异步非阻塞? 散仙不才,在查了一部分资料后,愿试着以通俗易懂的方式解释下这几个名词.如有不足之处,还望告知. 在弄清楚上面的几个问题之前,我们首先得明白什么是同步,…
转: http://www.oschina.net/question/54100_16195omcat的运行模式有3种.修改他们的运行模式.3种模式的运行是否成功,可以看他的启动控制台,或者启动日志.或者登录他们的默认页面http://localhost:8080/查看其中的服务器状态. 1)bio 默认的模式,性能非常低下,没有经过任何优化处理和支持. 2)nio  利用java的异步io护理技术,no blocking IO技术. 想运行在该模式下,直接修改server.xml里的Conne…
网络编程的基本模型是Client/Server模型,也就是两个进程之间进行相互通信,其中服务端提供位置信息(绑定的IP地址和监听端口),客户端通过连接操作向服务端监听的地址发起连接请求,通过三次握手建立连接,如果连接建立成功,双方就可以通过网络套接字(Socket)进行通信. 在基于传统同步阻塞模型开发中,ServerSocket负责绑定IP地址,启动监听端口:Socket负责发起连接操作.连接成功之后,双方通过输入和输出流进行同步阻塞式通信. 传统的BIO通信 采用BIO通信模型的服务端,通常…
前面已经讲解了BIO通道的整体流程,对于SSL的流程是插在通道中的,在BIO通道的初始化的时候,根据Connector配置的SSLEnabled属性进行SSL的逻辑. 主要集中的位置在JIOEndpoint的bind方法中: ' 这个特殊的ServerSocketFactory是SSLServerSocketFactory,我们看看其工厂创建之前做了什么内容,具体分解一下上述的这一行的代码: 左侧是Tomcat的类,Tomcat类中有两套SSL的实现,一套就是JSSEImplement,也就是基…
前面在Tomcat中讲解了两个通道,BIO和NIO,我们这里来通过两端程序,简单模拟两个通道,找找异同点: BIO: 1. public class SocketServer {    public SocketServer() {     try {     int clientcount = 0; // 统计客户端总数      boolean listening = true; // 是否对客户端进行监听     ServerSocket server = null; // 服务器端Soc…
前面两节,我们分别看了BIO和NIO的两种模式Tomcat的实现方式. BIO的方式,就是传统的一线程,一请求的模式,也就是说,当同时又1000个请求过来,如果Tomcat设置了最大Accept线程数为500,那么第一批的500个线程直接进入线程池中进行执行,而其余500个根据Accept的限制的数量在服务器端的操作系统的内核位置的socket缓冲区进行阻塞,一直到前面500个线程处理完了之后,Acceptor组件再逐步的放进来. 分析一下,这种模式的BIO的好处,可以让一个请求在cpu轮转时间…
BIO.NIO.NIO.2之间的区别主要是通过同步/异步.阻塞/非阻塞来进行区分的 同步: 程序与操作系统进行交互的时候采取的是问答的形式 异步: 程序与操作系统取得连接后,操作系统会主动通知程序消息 阻塞: 程序在执行一个操作的时候,在执行完毕前会一直等待 非阻塞: 程序在执行的时候,不会停止 举例: 对于Socket监听程序而言 BIO:同步阻塞 JDK1.4之前 不停地监听是否有新的连接,如果有新的连接,就使用流进行读写操作,在读写过程中程序是不能做其他事情的 对机器的性能要求较高 并发局…
[转自]http://qindongliang.iteye.com/blog/2018539 ?????????????????????在高性能的IO体系设计中,有几个名词概念常常会使我们感到迷惑不解.具体如下: 1 什么是同步? 2 什么是异步? 3 什么是阻塞? 4 什么是非阻塞? 5 什么是同步阻塞? 6 什么是同步非阻塞? 7 什么是异步阻塞? 8 什么是异步非阻塞? 简单总结,如有不足之处,还望告知. 在弄清楚上面的几个问题之前,我们首先得明白什么是同步,异步,阻塞,非阻塞,只有这几个…
同步阻塞io(BIO).伪异步io(PIO).非阻塞io(NIO).异步io(AIO)的概念及区别? 同步阻塞io(BIO):服务器端与客户端通过三次握手后建立连接,连接成功,双方通过I/O进行同步阻塞式通信. 弊端:1,读和写操作是同步阻塞的,任何一端出现网络性能问题,都会影响另一方.2,一个链路建立一个线程,无法满足高并发,高性能需求. 伪异步io(PIO):为了解决同步阻塞式IO一个链路建立一个线程的弊端,出现了伪异步IO,伪异步IO其实就是通过线程池/队列来处理多个客户端的接入,通过线程…
一.io方式 Linux网络编程 五种I/O 模式及select.epoll方法的理解 web优化必须了解的原理之I/o的五种模型和web的三种工作模式 五种I/O 模式——阻塞(默认IO模式),非阻塞(常用语管道),I/O多路复用(IO多路复用的应用场景),信号I/O,异步I/O 二.java nio Java nio 入门教程详解(一)   JavaNIO 入门教程详解 NIO入门 NIO.2 入门,第 1 部分: 异步通道 API JAVA 中BIO,NIO,AIO的理解 也谈BIO |…
先来个例子理解一下概念,以银行取款为例: 同步 : 自己亲自出马持银行卡到银行取钱(使用同步IO时,Java自己处理IO读写). 异步 : 委托一小弟拿银行卡到银行取钱,然后给你(使用异步IO时,Java将IO读写委托给OS处理,需要将数据缓冲区地址和大小传给OS(银行卡和密码),OS需要支持异步IO操作API). 阻塞 : ATM排队取款,你只能等待(使用阻塞IO时,Java调用会一直阻塞到读写完成才返回). 非阻塞 : 柜台取款,取个号,然后坐在椅子上做其它事,等号广播会通知你办理,没到号你…
上一讲讲解过NIO的框图,可以看来,NIO通道是目前Tomcat7以后的默认的通道的推荐配置,在Tomcat6和以前的配置中,BIO是主流的配置: 只需要修改protocol协议部分即可,而后续还有APR协议,NIO2.0的协议,都是修改这个字段. 对于BIO的整体框图,基本和NIO保持类似,整体流程变化不大: 1.Http11Protocol 与NIO一样,这个Http11Protocol是默认的BIO的http1.1协议的处理类,Tomcat除了有NIO,BIO,其实还有两个通道: APR是…
AIO:异步非阻塞 NIO:同步非阻塞 BIO:同步阻塞 (1)同步 指的是用户进程触发IO操作并等待或者轮询的去查看IO操作是否就绪 (2)异步 指用户进程触发IO操作以后便开始做自己的事情,而当IO操作已经完成的时候会得到IO完成的通知 (3)阻塞 指当试图对该文件描述符进行读写时, 如果当时没有东西可读,或者暂时不可写, 程序就进入等待状态, 直到有东西可读或者可写为止 (4)非阻塞 指如果没有东西可读, 或者不可写, 读写函数马上返回, 而不会等待 同步/异步新理解: 是否持续等待解决并…
在高性能的IO体系设计中,有几个名词概念常常会使我们感到迷惑不解.具体如下: 序号 问题 1 什么是同步? 2 什么是异步? 3 什么是阻塞? 4 什么是非阻塞? 5 什么是同步阻塞? 6 什么是同步非阻塞? 7 什么是异步阻塞? 8 什么是异步非阻塞? 在弄清楚上面的几个问题之前,我们首先得明白什么是同步,异步,阻塞,非阻塞,只有这几个单个概念理解清楚了,然后在组合理解起来,就相对比较容易了. 1.同步和异步是针对应用程序和内核的交互而言的. 2.阻塞和非阻塞是针对于进程在访问数据的时候,根据…
 [群主]雷欧纳德简单理解 tcpip是有通信确认的面对面通信   有打招呼的过程  有建立通道的过程 有保持通道的确认    有具体传输udp是看到对面的人好像在对面等你 就往对面扔东西[群主]雷欧纳德基本上 好比从货车a  运东西到货车b   tcpip是建立人手互传的方式   udp是 a货车里搬出的东西直接往b货车的人方向扔  你接成功没有  散架没 我扔的一方不管的tcp管这个 ip是通道[群主]雷欧纳德ip是手语  高速对面 我在等你  或者我要发过来了 这一类的[群主]雷欧纳德然后…
IO的方式通常分为几种,同步阻塞的BIO.同步非阻塞的NIO.异步非阻塞的AIO. 一.BIO      在JDK1.4出来之前,我们建立网络连接的时候采用BIO模式,需要先在服务端启动一个ServerSocket,然后在客户端启动Socket来对服务端进行通信,默认情况下服务端需要对每个请求建立一堆线程等待请求,而客户端发送请求后,先咨询服务端是否有线程相应,如果没有则会一直等待或者遭到拒绝请求,如果有的话,客户端会线程会等待请求结束后才继续执行. 二.NIO NIO本身是基于事件驱动思想来完…
1.同步异步.阻塞非阻塞概念        同步和异步是针对应用程序和内核的交互而言的. 阻塞和非阻塞是针对于进程在访问数据的时候,根据IO操作的就绪状态来采取的不同方式,说白了是一种读取或者写入操作函数的实现方式,阻塞方式下读取或者写入函数将一直等待,而非阻塞方式下,读取或者写入函数会立即返回一个状态值.   由上描述基本可以总结一句简短的话,同步和异步是目的,阻塞和非阻塞是实现方式. 1 同步 指的是用户进程触发IO操作并等待或者轮询的去查看IO操作是否就绪 自己上街买衣服,自己亲自干这件事…