化学键|甘氨酸|谷氨酸|半胱胺酸|motif|domain|疏水相互作用|序列相似性|clustering analysis|Chou and Fasman|GOR|PHD|穿线法|first-principle ab initio folding| 生命组学 对Protein的分析可以从Sequence到structure到function,最后研究interaction. Structure: 化学键形成骨架,化学元素的选取基于合成蛋白质选择容易获取的元素,氨基酸化学元素的选取决定了其结构,…

9道题.A了8道,A题看题解也没弄懂怎么维护m段子序列的,过一段时间再回来看看     dp试水 47:56:23 125:00:00   Overview Problem Status Rank (20) Discuss Current Time: 2016-04-05 21:01:23 Contest Type: Public Start Time: 2016-04-03 21:05:00 Contest Status: Running End Time: 2016-04-09 02:05:…

现场编辑 创建不仅捕获代码的脚本 - 它们讲述了可以与他人共享的故事.自动化的上下文提示可让您在编程时快速移动,并将结果和可视化与代码一起显示. 学到更多 访问MATLAB实时脚本库             App Designer App Designer使您无需成为专业软件开发人员即可创建专业应用程序.拖放可视组件以布置应用程序的设计,并使用集成编辑器快速编写应用程序的行为.您可以通过MATLAB Compiler创建独立桌面或Web应用程序来共享您的应用程序. 学到更多 数据分析 你有数据…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al 翻译 翻译机器的组成 mRNA tRNA aminoacyl tRNA synthetase ribosome 一.信使RNA 1.多肽链是由可读框决定的 含有多个ORF的mRNA叫多顺反子 只有1个ORF的mRNA叫单顺反子 2.原核细胞mRNA具有核糖体结合位点,可以募集翻…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al 转录的调控 原核生物的转录调控 一.转录调控原理 1.基因表达由调控蛋白控制 激活因子 activator 抑制因子 repressor 它们通常都是DNA结合蛋白 2.大多数的激活因子和抑制因子在转录起…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al DNA的复制,染色体组装 一.Replication Enzymes 复制酶 1.酶结构: 手状结构.thumb不动,而finger动. 手掌:①聚合作用. β折叠片层 2个二价金属离子(Mg2+orMn…

转载于 https://mp.weixin.qq.com/s/VDN1qAZGIMol6prwQW4umw Docking非原生配体 在前面的例子中,AutoDock Vina能把配体构象调整到几乎原生的构象,验证了这一预测方法的准确度.下面,我们尝试docking另外一个配体药物nelfinavir奈非那韦,来展示如何寻找小分子在蛋白内的结合位点.这个过程可以进一步地凝练和扩展作为“虚拟筛选(virtual screening)”的步骤. 重复上述步骤执行docking 获取nelfinavi…

转载于 https://mp.weixin.qq.com/s/P62sjqhSTxmWVicrEAk-RQ 为了简化展示过程,我们设计了一个pml脚本 (脚本内有很详细的解释),只需要修改脚本里面受体和配体的名字,然后在PyMOL的命令行界面输入PyMOL> run display.pml即可获得展示结果.当然这个脚本也可以使用程序generatePmlForHbond.py生成. #########################################################…

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