解读人：陈秋实，SP2: Rapid and Automatable Contaminant Removal from Peptide Samples for Proteomic Analyses（标准操作流程2：如何在蛋白质组学分析中快速和自动的去除肽段样品中的污染物）

发表时间:2019年4月 IF:3.950 单位: 威斯康星医学院生物化学系威斯康星医学院生物医学质谱研究中心物种:人(人体肾脏细胞和蛋白) 技术:肽段清理一. 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果) 肽段清理对于去除在自下而上(也称为鸟枪法)蛋白质组工作流程中样品制备阶段可能引入的污染物很重要.近些年的研究表明在去除洗涤剂和聚合物污染时,相较于传统的反相洗涤方法,使用羧酸盐修饰的顺磁颗粒有多种益处.但是,也面临实验结果可重复与否的挑战,实验的可重复性限制了这种方法在实验室的广泛实…

Highly Efficient Analysis of Glycoprotein Sialylation in Human Serum by Simultaneous Quantification of Glycosites and Site-Specific Glycoforms (通过同时定量糖基化位点和位点特异性糖型来高效分析人血清中的糖蛋白唾液酸化)-阅读人：陈秋实

期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2019年9月) IF:3.78 单位: 中国科学院大连化学物理研究所中国科学院大学大连医科大学第二附属医院物种:人血浆技术:用组氨酸修饰的具有可变换表面电荷的亲水性智能材料(组氨酸键合的二氧化硅,HBS)可选择性地从复杂的生物样品中富集唾液酸化的糖肽(SGP) 一. 概述: 糖蛋白的异常唾液酸化与许多恶性疾病密切相关,唾液酸化的分析对于揭示这些疾病的现状具有很大的潜力.然而,深入分析唾液酸化仍然具有挑战性…

文献名：Repeat-Preserving Decoy Database for False Discovery Rate Estimation in Peptide Identication （用于肽段鉴定中错误发生率估计的能体现重复性的诱饵数据库）

文献名:Repeat-Preserving Decoy Database for False Discovery Rate Estimation in Peptide Identication (用于肽段鉴定中错误发生率估计的能体现重复性的诱饵数据库) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2020年3月) IF:3.78 单位: 滑铁卢大学计算机科学学院多伦多细胞生物学和SPARC生物项目中心多伦多大学分子遗传学系技术:肽段鉴定,诱饵数据库构建一…

解读人：谭亦凡，Macrophage phosphoproteome analysis reveals MINCLE-dependent and -independent mycobacterial cord factor signaling（巨噬细胞磷酸化蛋白组学分析揭示MINCLE依赖和非依赖的分支杆菌索状因子信号通路）（MCP换）

发表时间:2019年4月 IF:5.232 一. 概述: 分支杆菌索状因子TDM(trehalose-6,6’-dimycolate)能够与巨噬细胞C-型凝集素受体(CLR)MINCLE结合引起下游通路变化.本文对TDM处理的巨噬细胞磷酸化蛋白质组进行定量分析,发现了依赖于MINCLE的信号通路和MINCLE非依赖的信号通路,两种信号通路具有不同的生物功能. 二. 研究背景:(简要介绍研究进展动态.研究目的和意义) 巨噬细胞对分支杆菌的识别依赖于TLR.CLR以及分支杆菌核酸.TDM是细胞壁主要…

Comparing Data-Independent Acquisition and Parallel Reaction Monitoring in Their Abilities To Differentiate High-Density Lipoprotein Subclasses 比较DIA和PRM区分高密度脂蛋白亚类的能力（解读人：陈凌云）

文献名:Comparing Data-Independent Acquisition and Parallel Reaction Monitoring in Their Abilities To Differentiate High-Density Lipoprotein Subclasses(比较DIA和PRM区分高密度脂蛋白亚类的能力) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:2019年11月 IF:3.78 单位: 圣保罗大学 Universidade…

Sample Preparation by Easy Extraction and Digestion (SPEED) - A Universal, Rapid, and Detergent-free Protocol for Proteomics based on Acid Extraction（一种使用强酸的蛋白质提取方法SPEED，普适，快速，无需去垢剂）-解读人：李思奇

期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年12月) IF:4.828 单位:德国Robert Koch 研究所物种:多种技术:新蛋白提取和酶解方法一. 概述: 本文设计了一种仅需要三步——酸化,中和及酶解——就能完成蛋白提取和酶解的实验方法,命名为简单的蛋白提取和酶解法(SPEED).SPEED使用三氟乙酸(TFA)做裂解液,适用于不同类型的样本,包括难以裂解的样本类型.文章评估了SPEED方法对大肠杆菌,小鼠肝脏和金黄色葡萄球菌的效果,又将该方法与5种不同原理…

Journal of Proteome Research | Utilization of the Proteome Data Deposited in SRMAtlas for Validating the Existence of the Human Missing Proteins in GPM (解读人：梁嘉琪）

文献名:Utilization of the Proteome Data Deposited in SRMAtlas for Validating the Existence of the Human Missing Proteins in GPM(利用SRMAtlas中的已有的蛋白质组数据验证GPM中人类缺失蛋白的存在) 期刊名:journal of proteome 发表时间:2019.10.24 IF:3.780 单位: 1.日本Niigata大学 2.开罗Al-Azhar大学物种:人类…

MCP|XHK|High-density peptide arrays help to identify linear immunogenic B cell epitopes in individuals naturally exposed to malaria infection（高密度肽段阵列有助于在自然暴露于疟疾感染的个体中识别线性免疫原性B细胞表位）

文献名:High-density peptide arrays help to identify linear immunogenic B cell epitopes in individuals naturally exposed to malaria infection(高密度肽段阵列有助于在自然暴露于疟疾感染的个体中识别线性免疫原性B细胞表位) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年4月) IF:5.236 单位: 1海德堡大学附属医院寄生虫学感染中心,德国…

8、组件注册-@Import-给容器中快速导入一个组件

8.组件注册-@Import-给容器中快速导入一个组件 8.1 给容器中注册组建的方式包扫描+组建标注注解(@Controller.@Service.@Repository.@Component)[有局限,不是自己写的就无法注入] @Bean[导入第三方包里面的组建] @Import[快速的给容器中导入一个组建] 8.2 @Import 直接导入新建两个类:Color.class, Read.class @Import({Color.class, Read.class}) // 快速导入组建…

一行代码在 .NET Core 中快速使用 log4net

原文:一行代码在 .NET Core 中快速使用 log4net 1. .NET Core 控制台程序中使用第一步:添加引用 Install-Package log4net 第二步:将附件 LogHelper.cs 和 log4net.config 两个文件加入到项目中第三步:在Main中使用 LogHelper 类来记录日志 public static void Main(string[] args) { LogHelper.Configure(); //使用前先配置 LogHelper.…

Journal of Proteome Research | An automated ‘cells-to-peptides’ sample preparation workflow for high-throughput, quantitative proteomic assays of microbes (解读人：陈浩）

文献名:An automated ‘cells-to-peptides’ sample preparation workflow for high-throughput, quantitative proteomic assays of microbes(一种基于高通量的,自动的由细胞制备多肽的样品自动处理工作体系的微生物蛋白组定量实验) 期刊名:Journal of Proteome Research 影响因子:3.86 单位: 联合生物能源研究所,劳伦斯伯克利国家实验室,埃默里维尔,加利福尼…