一. 运行meerkat 前面已经依序安装了meerkat 的环境和meerkat,运行了预处理一步,在相对应的bam文件目录下生成了大批文件,因此,当要用meerkat处理某个bam文件时,应先将该bam文件移动到专有的一个文件夹,manual中也建议这样用. 预处理生成的文件包括: 黑名单文件.gz isinfo文件:包括插入大小信息 pdf文件:插入大小的分布图,unmapped reads长度的分布图,softclip reads长度分布图 pre.log文件:日志文件,包括输入的参数,…

一.准备工作     meerkat 0.189版本和以前的版本相比,支持bwa mem 输出的bam文件,还支持全外显子数据count SV. meerkat原理:参见http://compbio.med.harvard.edu/Meerkat/     1.1 需要准备的软件         1. unix/Linux系统(自带) 2. CMake(自带) 3. PERL 5.8.1及以上(自带) 4. BioPERL 1.5.0及以上(自行安装) 5. R 2.3.1及以上(自带) 6.…

1.button可下拉弹出层: watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvY2hpbmFwbGFu/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast" alt=""> HTML代码: <div class="porpre"> <div class="input-group-bt…

中文名称:江中微型统计分析软件 英文名称: 项目名称:JXUTCMMSAS 项目地址:保密 在研究生最后历时1年的时间里,完成了江中微型统计分析软件V1.0,后续还在不断更新中,将自己的改进算法.机器学习中的常用算法全部集成到该软件中,并通过对外提供调用接口,提供可视化界面,立志让其成为一款普通人可用.机器学习算法研究者调用的软件,让算法研究者们,不需要再重新做重复工作,着眼于算法本身,在已有基础上研究. 1.开发环境 MCR——项目中调用到MATLAB2014A(32bite)的MCR环境的j…

在 Hyperledger Fabric 1.0 从零开始(十二)--fabric-sdk-java应用 中我已经把官方sdk具体改良办法,即使用办法发出来了,所有的类及文件都是完整的,在文章的结尾也说明了用法主要都依赖于ChaincodeManager这个智能合约管理器,建议以单例的形式生成该对象. 鉴于新入门的朋友在实际运用上可能需要更加简单明了的方案,这里就把最直接的方案给出,具体是写了一个FabricManager管理器,这个管理器将会接管整个java sdk与peer节点服务器及ord…

<玩转Django2.0>读书笔记-Django建站基础 作者:尹正杰 版权声明:原创作品,谢绝转载!否则将追究法律责任. 一.网站的定义及组成 网站(Website)是指在因特网上根据一定规则,使用HTML(标准通用标记语言下的一个应用)等工具制作并用于展示特定内容相关网页的集合.简单地说,网站是一种沟通工具,人们可以通过网站来发布自己想要公开的咨询,或者利用网站来提供相应的网络服务,也可以通过网页浏览器来访问网站,获取自己需要的咨询或者享受网络服务. 在早期,域名,空间服务器与程序是网站的…

目录 muduo学习笔记(二)Reactor关键结构 Reactor简述 什么是Reactor Reactor模型的优缺点 poll简述 poll使用样例 muduo Reactor关键结构 Channel Poller EventLoop Reactor时序图 测试程序-单次触发的定时器 muduo学习笔记(二)Reactor关键结构 Reactor简述 什么是Reactor Reactor是一种基于事件驱动的设计模式,即通过回调机制,我们将事件的接口注册到Reactor上,当事件发生之后,就…

说明:这里是借鉴:晓风残月前辈的博客,他是将泰然网的跑酷教程,用cocos2d-x 2.X 版本号重写的,眼下我正在学习cocos2d-X3.0 于是就用cocos2d-X 3.0重写,并做相关笔记 OK,到昨天为止,我们已经将游戏基本上写完了,这里本来就是别人开源的东西,我这里重写,当然要发布源代码.那么这里有两种方式: 第一种:将我执行成功的整个项目打包,VS2012+win7下的,这样的方式就比較大,可是能够打开打开 Run/proj.win32/Run.sln 就能够啦 另外一种:就是我…

前言 哈喽大家周五好,马上又是一个周末了,下周就是中秋了,下下周就是国庆啦,这里先祝福大家一个比一个假日嗨皮啦~~转眼我们的专题已经写了第 23 篇了,好几次都坚持不下去想要中断,不过每当看到群里的交流,看到博客下边好多小伙伴提出问题,我又燃起了斗志,不过这两天感冒了,所以更新的比较晚,这里也提醒大家,节日要照顾好自己哟~~~,好多人说我写的上不了台面,哈哈这里表示赞同,本系列的宗旨就是,给大家一个学习的点,让大家去自学一个面,然后大家一起学,把面交流成一个立体,就达到一个体系了.好啦,言归正传…

<玩转Django2.0>读书笔记-探究视图 作者:尹正杰 版权声明:原创作品,谢绝转载!否则将追究法律责任. 视图(View)是Django的MTV架构模式的V部分,主要负责处理用户请求和生成相应的响应内容,然后在页面或其他类型文档中显示.也可以理解为视图是MVC架构里面的C部分(控制器),主要处理功能和业务上的逻辑. 一.构建网页内容 1>.视图函数的retrurn的多种响应类型 在上一个篇博客里我们看到视图函数都是通过return方式返回数据内容的,然后生成响应的网页内容呈现在浏览…