使用 MPI for Python 并行化遗传算法】的更多相关文章

前言 本文中作者使用MPI的Python接口mpi4py来将自己的遗传算法框架GAFT进行多进程并行加速.并对加速效果进行了简单测试. 项目链接: GitHub: https://github.com/PytLab/gaft PyPI: https://pypi.python.org/pypi/gaft 正文 我们在用遗传算法优化目标函数的时候,函数通常都是高维函数,其导数一般比较难求取.这样我们的适应度函数计算通常都是比较费时的计算. 例如在使用遗传算法寻找最优结构时候通常需要调用量化软件进行…
本系列文章代码取材于书籍<Genetic Algorithms with Python>,本人是在校电气专业的研究生,立志从事于Python相关的代码工作,具体什么方向还有待深究. 众所周知,算法一类的相关工作在市场上工资不菲,对于跨专业想从事算法工作的同学,算法入门是很难的一件事,一者没有好的代码基础,二者算法书晦涩难懂,让人没有读下去的欲望.我从研究生入学到现在,已经有半年的时间了,期间一直摸索算法入门,但都没有坚持下来,但一直在学习Python的基础语法,几个月之前导师在群里推了这本书,…
前言 本文对遗传算法中的几种选择策略进行了总结, 其中包括: Proportionate Roulette Wheel Selection Linear Ranking Selection Exponential Ranking Selection Tournament Selection 对于每种选择策略我都使用Python进行了相应的实现并以内置插件的形式整合进了本人所写的遗传算法框架GAFT中.对需要使用遗传算法优化问题以及学习遗传算法的童鞋可以作为参考. 项目链接: GitHub: ht…
大数据集群计算利器之MPI/OpenMP ---以连通域标记算法并行化为例 1 背景 图像连通域标记算法是从一幅栅格图像(通常为二值图像)中,将互相邻接(4邻接或8邻接)的具有非背景值的像素集合提取出来,为不同的连通域填入数字标记,并且统计连通域的数目.通过对栅格图像中进行连通域标记,可用于静态地分析各连通域斑块的分布,或动态地分析这些斑块随时间的集聚或离散,是图像处理非常基础的算法.目前常用的连通域标记算法有1)扫描法(二次扫描法.单向反复扫描法等).2)线标记法.3)区域增长法.二次扫描法由…
前言: 不管学习那门语言都希望能做出实际的东西来,这个实际的东西当然就是项目啦,不用多说大家都知道学编程语言一定要做项目才行. 这里整理了70个Python实战项目列表,都有完整且详细的教程,你可以从中选择自己想做的项目进行参考学习练手,你也可以从中寻找灵感去做自己的项目. 70个Python项目列表: 1.[Python 图片转字符画] 2.[200行Python代码实现2048] 3.[Python3 实现火车票查询工具] 4.[高德API+Python解决租房问题 ] 5.[Python3…
前言: 近几年Python可谓是大热啊,很多人都纷纷投入Python的学习中,以前我们实验楼总结过多篇Python实战项目列表,不但有用还有趣,最主要的是咱们实验楼不但有详细的开发教程,更有在线开发环境,非常适合Python学习者学习啊,今天再总结一批Python实战项目教程. 附上前面总结的Python项目教程列表: [给缺少Python项目实战经验的人] [(新)10个Python项目,给缺少Python项目实战经验的人] [这10个Python项目超有趣!] [Python实现从excel…
开头真的很重要!!!一个吻,一部小说,一篇文章......好的开头就像一个漂亮女孩的问候,问完了,你还期待着她接下来会对你说些什么甜蜜的话呢. 真可惜!我不是漂亮女孩,我的这个开头也不好.但开头不好,并不妨碍下面的干货不好噢.下面这80个Python学习教程,涵盖了从Python入门,到基础巩固,再到进阶强化的各类练习项目.就像......就像一个长相一般,但灵魂有趣的女孩子哇.好啦我退下啦,请自便哦. Python3 简明教程 Python版设计模式实践 Python Flask Web框架…
最近在用Python写遗传算法时,发现需要将十进制的整数转换成二进制数,那么怎么来转换呢?当然如果你学过进制转换的有关计算方法,你可以手动编写一些函数来实现,不过总体来说还是比较麻烦的,这里介绍Python内置的两个函数bin()和int(),利用这两个函数可以轻轻松松完成转换. 一.十进制整数转换成二进制数 代码如下: num = 8 numb = bin(num) print(numb) 这段代码的输出结果如下: 0b1000 0b是什么呢?有过一定计算机专业基础的人一定知道,其实他只是表示…
整理几个实验楼小项目,有免费的也有会员的,会员的可以参考他们的实验报告. 直接去实验楼这个网站,粘贴上就能搜到. 免费专区: Kmeans聚类算法评估足球比赛 Python实现3D建模工具 K-近邻算法实现手写数字识别系统 PyQt 实现简易浏览器 Python 基于共现提取<釜山行>人物关系 Python 气象数据分析 Python 数据可视化 Django打造文件分享系统 Python3 实现简单的 Web 服务器 Python3 实现色情图片识别 Python 破解验证码 高德API +…
70个Python项目列表: 1.[Python 图片转字符画]2.[200行Python代码实现2048]3.[Python3 实现火车票查询工具]4.[高德API+Python解决租房问题 ]5.[Python3 色情图片识别]6.[Python 破解验证码]7.[Python实现简单的Web服务器]8.[pygame开发打飞机游戏]9.[Django 搭建简易博客]10.[Python基于共现提取<釜山行>人物关系]11.[基于scrapy爬虫的天气数据采集(python)]12.[Fl…
不管学习哪门语言都希望能做出实际的东西来,这个实际的东西当然就是项目啦,不用多说大家都知道学编程语言一定要做项目才行. 这里整理了70个Python实战项目列表,都有完整且详细的教程,你可以从中选择自己想做的项目进行参考学习练手,你也可以从中寻找灵感去做自己的项目. ####1.Python 图片转字符画 ####2.200行Python代码实现2048 ####3.Python3实现火车票查询工具 ####4.高德API+Python解决租房问题 ####5.Python3 色情图片识别 ##…
不管学习那门语言都希望能做出实际的东西来,这个实际的东西当然就是项目啦,不用多说大家都知道学编程语言一定要做项目才行. 这里整理了70个Python实战项目列表,都有完整且详细的教程,你可以从中选择自己想做的项目进行参考学习练手,你也可以从中寻找灵感去做自己的项目. 70个Python项目列表: 1.[Python 图片转字符画]2.[200行Python代码实现2048]3.[Python3 实现火车票查询工具]4.[高德API+Python解决租房问题 ]5.[Python3 色情图片识别]…
转载:https://zhuanlan.zhihu.com/p/25332041 前言 在高性能计算的项目中我们通常都会使用效率更高的编译型的语言例如C.C++.Fortran等,但是由于Python的灵活性和易用性使得它在发展和验证算法方面备受人们的青睐于是在高性能计算领域也经常能看到Python的身影了.本文简单介绍在Python环境下使用MPI接口在集群上进行多进程并行计算的方法. MPI(Message Passing Interface) 这里我先对MPI进行一下简单的介绍,MPI的全…
王益,分布式机器学习的践行者,他的足迹值得后来者学习. 膜拜策略: LinkedIn高级分析师王益:大数据时代的理想主义和现实主义(图灵访谈)[心路历程] 分布式机器学习的故事-王益[历史由来] 分布式机器学习系列讲座(王益)[油管视频] 腾讯孔雀系统 一.基本状况 2014年业内现状 并且很多研究员也并不擅长设计适合于自己研发的算法的并行计算架构 业内实际问题 同时也和腾讯的同事们一起为国际数据挖掘大赛出题,比如KDD Cup 2012和ICME Grand Challenge 2014. 业…
摘要:Ray的定位是分布式应用框架,主要目标是使能分布式应用的开发和运行. Ray是UC Berkeley大学 RISE lab(前AMP lab) 2017年12月 开源的新一代分布式应用框架(刚发布的时候定位是高性能分布式计算框架,20年中修改定位为分布式应用框架),通过一套引擎解决复杂场景问题,通过动态计算及状态共享提高效率,实现研发.运行时.容灾一体化 Ray架构解析 业务目标 Ray的定位是分布式应用框架,主要目标是使能分布式应用的开发和运行. 业务场景 具体的粗粒度使用场景包括 弹性…
Downloading The MPI for Python package is available for download at the project website generously hosted by Google Code. You can use curl or wget to get a release tarball: $ curl -O http://mpi4py.googlecode.com/files/mpi4py-X.X.X.tar.gz $ wget http:…
因为要用基于GCC4.8.1的boost最新版本的库,默认apt-get install 安装的是boost1.53, 并且基于GCC4.7.3,不是我想要的.所以决定下载源代码自己编译. 下载(后面的路径可能会变,具体参考boost网站链接) wget -O boost_1_54_0.tar.bz2 http://downloads.sourceforge.net/project/boost/boost/1.54.0/boost_1_54_0.tar.bz2?r=http%3A%2F%2Fww…
参考博客 http://www.cnblogs.com/lidabo/p/3805487.html http://www.cppblog.com/Robertxiao/archive/2013/01/06/197022.html http://www.cnblogs.com/finallyliuyu/archive/2013/05/23/3094246.html http://www.cnblogs.com/lidabo/p/3782193.html http://www.cnblogs.com…
转载请注明出处: http://www.cnblogs.com/darkknightzh/p/5797940.html 参考网址: http://www.boost.org/doc/libs/1_61_0/more/getting_started/unix-variants.html http://blog.csdn.net/tedious/article/details/6793544 说明:boost库包含两部分:无需编译的头文件,及单独编译的库.单独编译的库如下: Boost.Chrono…
首先说下环境,win7,vs2010. 先在http://www.boost.org/users/download/上下载boost安装包,我下的是1.52.0版. 按照说明,直接运行“bootstrap.bat”,报“‘cl'不是内部或外部命令”的错误,于是在环境变量中添加了cl.exe的路径——“C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 10.0\VC\bin\x86_ia64”.再次运行“bootstrap.bat”,提示找不到“mspd…
1. 下载并解压Boost C++ Libs 下载地址: SourceForge:http://sourceforge.net/projects/boost/files/boost/1.48.0/ Boost Official:http://www.boost.org/users/history/version_1_48_0.html (实际上也是从SourceForge下载) 解压到 E:\boost_1_48_0 2. 编译 我们需要对所有 编译器版本(Visual Studio 20**…
  背景   结合上一篇CLion之C++框架篇-优化框架,单元测试(二),继续进行框架优化!这一版优化引入一个我们日常经常使用的操作库Boost,估算使用频率在70%以上!   Boost的优势在哪里? 1.Boost是一个功能强大.构造精巧.跨平台.开源并且完全免费的C++程序库,有着“C++‘准’标准库”的美誉. 2.它由C++标准委员会部分成员所设立的Boost社区开发并维护: 3.使用了许多现代C++编程技术,内容涵盖字符串处理.正则表达式.容器与数据结构.并发编程.函数式编程.泛型编…
boost是一个功能强大.构造精巧.跨平台.开源并且完全免费的C++程序库. 获取方式 boost提供源码形式的安装包,可以从boost官方网站下载,目前最新版本是1.59.0. 本机上正好有boost_1_55_0的源码包,就不下载最新版本,就以boost_1_55_0为例说明,安装编译方式对1.59.0版本同样使用. 目录结构 源码包解压后的目录结构: BOOST_1_55_0 #boost根目录,存放配置脚本和说明文件 ├─boost #所有boost库头文件,90%以上的boost库源码…
最近发现了一门新语言 Julia   ,  这门编程语言据说大有取代 Python语言成为数据科学的大佬,但是细看发现最主要说的是这门编程语言运行速度比较快,并且在分布式和并行计算上比较有优势,这时候我就在想PYTHON语言是否也可以比较容易的搭建并行计算的平台呢,这一看还真有,就是  MPI4PY,这是个基于MPI的Python并行计算框架,其实细研究发现这个东西其实就是把MPI做了一下封装,然后把Python的消息用MPI进行传递. 由于  mpi4py  是在MPI 之上进行运作的,需要先…
env: windows xp 32 bit mingw official  NDK 1. 下载源代码    地址是 :http://sourceforge.net/projects/boost/files/boost/1.54.0/    本文下载的是 boost_1_54_0.7z 2. 解压源代码到任意目录    本问解压后匹配文件:  ***/boost154/tools/build/v2/user-config.jam3. 生成bjam.exe    打开cmd.exe    切换目录…
boost大部分库仅仅须要包括头文件就可以使用,而有部分须要编译的.例如以下: E:\Qt\Qt3rdlib\boost_1_58_0>bjam --show-libraries The following libraries require building: - atomic - chrono - container - context - coroutine - date_time - exception - filesystem - graph - graph_parallel - io…
原文地址:https://www.shiyanlou.com/questions/102676/?utm_source=baidu&utm_medium=cpc&utm_campaign=python&utm_term=keywords&renqun_youhua=417274 下面是我们的老师根据现有资源整理的一个Python学习路径,包含入门知识.Python基础.Web框架.基础项目.网络编程.数据与计算等80个大大小小的学习项目,将带着你逐步深入,学会如何使用 Py…
目录 前言 概述 启发式的理解(重点) 优化问题的定义 个体编码 初始族群的创建 评价 配种选择 锦标赛 轮盘赌选择 随机普遍抽样选择 变异 单点交叉 两点交叉 均匀交叉 部分匹配交叉 突变 高斯突变 乱序突变 位翻转突变 均匀整数突变 环境选择 完全重插入(Pure reinsertion) 均匀重插入(Uniform reinsertion) 精英重插入(Elitist reinsertion) 精英保留重插入(Fitness-based reinsertion) 进化算法的python实现…
用c语言写了kmeans算法的串行程序,再用mpi来写并行版的,貌似参照着串行版来写并行版,效果不是很赏心悦目~ 并行化思路: 使用主从模式.由一个节点充当主节点负责数据的划分与分配,其他节点完成本地数据的计算,并将结果返回给主节点.大致过程如下: 1.进程0为主节点,先从文件中读取数据集,然后将数据集划分并传给其他进程: 2.进程0选择每个聚类的中心点,并发送给其他进程: 3.其他进程计算数据块中每个点到中心点的距离,然后标出每个点所属的聚类,并计算每个聚类所有点到其中心点的距离之和,最后将这…
春节坐在回家的火车上百无聊赖,偶然看到 Parallelism in one line 这篇在 Hacker News 和 reddit 上都评论过百的文章,顺手译出,enjoy:-) http://www.zhangzhibo.net/2014/02/01/parallelism-in-one-line/ Python 在程序并行化方面多少有些声名狼藉.撇开技术上的问题,例如线程的实现和 GIL1,我觉得错误的教学指导才是主要问题.常见的经典 Python 多线程.多进程教程多显得偏“重”.而…