http://daler.github.io/pybedtools/ 用个下面这个 >>> fn = pybedtools.example_filename('test.fa') >>> BedTool.seq('chr1:2-10', fn) 'GATGAGTCT' >>> BedTool.seq(('chr1', 1, 10), fn) 'GATGAGTCT'…

离线pip下载Python包   这几天搞Windows离线断网环境下安装Python包,配置环境,各种坑!做个记录,供以后查询吧.      # 生产环境  windows xp# python 2.7# pip 8.1.2        友情提示:当你遇到无法安装包的不明错误时,可以回头来考虑如下建议了:       一.更新 pip版本              1.下载最新 pip       新建packages文件夹放在目录中:d:python27packages.      Uno…

本系列分为两篇: 1.[转]windows和linux中搭建python集成开发环境IDE 2.[转]linux和windows下安装python集成开发环境及其python包 3.windows和linux中搭建python集成开发环境IDE——如何设置多个python环境 参考:http://blog.csdn.net/pipisorry/article/details/39902327 一.安装Python集成开发环境IDE 参考[linux和windows中搭建python开发环境] 二…

结构如下: appsdk\ appsdk.py(这里面有多个类,包括appsdk,appsdksync等类) __init__.py ... ① 有个appsdk的文件夹(符合python包的定义) ② 将这个appsdk的文件夹copy到/usr/lib/python2.7/site-packages目录下 ③ 进入这个appsdk文件夹,vim __init__.py,然后输入如下内容(这是一种参考模式,因为之前我试过很多方式,发现RF加载不了包里面的py里面的多个类): from apps…

本文适用于刚入门的小白,欢迎大牛们批评指正. 因为要开始数据分析,而python又不像R和matlab那么简洁.需要安装的包很多~ 网上找了好多牛人博客,想在centos7下安装numpy,scipy等包,一开始就懵逼了,网上的指导帖很多,试了很多方法, 绕了很多弯路,总结一下经验~ ——————————————————————华丽分割线—————————————————————————— 最简单的方法: 命令行执行: sudo yum -y install gcc gcc-c++ numpy…

python 包管理工具 Python当前的包管理工具链是 easy_install/pip + distribute/setuptools + distutils,显得较为混乱. 而将来的工具链组合非常简单:pip + distutils2. 1.distutils:Python 自带的基本安装工具,适用于非常简单的应用场景,使用: 为项目创建 setup.py 脚本: 执行 setup.py install 可进行安装: 2.setuptools:针对 distutils 做了大量扩展,尤其…

Python 包管理工具解惑 本文链接:http://zengrong.net/post/2169.htm python packaging 一.困惑 作为一个 Python 初学者,我在包管理上感到相当疑惑(嗯,是困惑).主要表现在下面几个方面: 这几个包管理工具有什么不同? distutils setuptools distribute disutils2 distlib pip 什么时候该用pip,什么时候该用 setup.py ,它们有关系么? easy_install.ez_setup…

[Python 包的相对导入讲解] 参考:http://www.dai3.com/python-import.html…

from: http://www.linuxde.net/2014/05/15576.html CentOS 6.4安装pip,CentOS安装python包管理安装工具pip的方法 2014/05/12 centos, pip, Python 运维管理经验与工具 2 70,955   之前有的朋友问我,CentOS版本怎么安装python的pip,我之前给出的Ubuntu下apt-get的方法 ubuntu 需要先安装下pip吧, apt-get install python-pip 安装re…

如果你有多个模块需要发布,而它们又存在于多个包中,那么指定整个包比指定模块可能要容易地多.即使你的模块并不在一个包内,这种做法也行的通:你可以告诉Distutils从根包(root package)处理模块,并且它工作起来和其他任意的包一样(除非你不需要拥有一个__init__.py文件). 例1.1 根包发布 文件结构为: <root>/ setup.py foo.py bar.py setup脚本可以这样写: from distutils.core import setup setup(n…

位置 \Windows\System32 python包依赖包安装 rtree 依赖 spatialindex(spatialindex.dll   spatialindex_c.dll) shapely 依赖 geos(geos.dll  geos_c.dll) 在windows安装时把dll文件拷贝到\windows\Systems32即可…

常见的包管理工具及关系 setuptools -->distribute easy_install-->pip 1.distribute distribute是对标准库disutils模块的增强,我们知道disutils主要是用来更加容易的打包和分发包,特别是对其他的包有依赖的包.distribute被创建是因为setuptools包不再维护了. 主页:https://pypi.python.org/pypi/distribute 安装及使用 wget https://pypi.python.…

pip 是一个安装和管理 Python 包的工具 , 是 easy_install 的一个替换品.本文将详细说明 安装 pip 的方法和 使用 pip 的一些基本操作如安装.更新和卸载 python 包. 一.pip是基于setuptools的,所以要事先把setuptools安装好. 下载安装包: https://pypi.python.org/packages/source/s/setuptools/setuptools-1.4.2.tar.gz 解压并进入到目录:python setup.…

python 包导入规则,恶心了一天,终于搞清楚了 1.目录 speed data __init__.py __init__.py static templates view __init__.py table_alding_data.py table_odp_us.py 2.文件 data/__init__py #!/usr/bin/env python # encoding: utf-8 import json def get_data(data_name="result"): d…

python包管理-distutils,setuptools,pip,virtualenv等介绍 对于每个编程语言来说打包和发布开发包往往非常重要,而作为一个编程者能够快速容易的获得并应用这些由第三方提供的包同样非常重要.类似于java为了便于管理有人开发了maven等管理工作,而python自然而然也需要便捷的打包和发布工具,以下就介绍python的几个包管理方式. 一  distutils - Python自带的基本安装工具, 适用于非常简单的应用场景使用 通过distutils来打包,生成…

由于python包是从C++包编译出来的,所以需要先下载源码进行编译安装.1. gdal下载http://download.osgeo.org/gdal/CURRENT/sudo ./configure --with-python --with-geos=geos-config的路径sudo makesudo make install 注:安装失败重新编译之前,使用make clean清除一下上次的内容. 2. 然后进入到swig/python目录下sudo python setup.py bu…

用anaconda的pip安装第三方python包的日志 启动anaconda命令窗口: 开始> 所有程序> anaconda> anaconda prompt 会得到两行提示: Deactivating environment "d:\Anaconda2"... Activating environment "d:\Anaconda2"... 安装tushare包 在anaconda 命令窗口里: 输入 pip install tushare 安…

使用Python编程的都知道,Python的包安装非常的方便,一般都是可以pip来安装搞定: sudo pip install <package name> pip的安装请移步:https://pip.pypa.io/en/stable/installing/ 最近因为项目上的需要,发布了一个自己的pypi Python包,这里我大致分享如何发布自己的Pypi包一般过程. 打包工作主要依赖python的一个叫setuptools的包来完成,在进行下面操作前请使用pip安装它: sudo pip…

1. Python包管理工具 在安装Python包的过程中,经常涉及到distutils.setuptools.distribute.setup.py.easy_install.easy_install和pip等等.突然对Python的包管理凌乱了,这些工具关系是什么,应该怎么去选择使用? 下面就简单介绍下Python包管理相关的一些内容. 1.1 distutils distutils 是 python 标准库的一部分,这个库的目的是为开发者提供一种方便的打包方式, 同时为使用者提供方便的安装…

CentOS 6.4安装pip,CentOS安装python包管理安装工具pip的方法如下: 截至包子写本文的时候,pip最新为 1.5.5 wget --no-check-certificate https://github.com/pypa/pip/archive/1.5.5.tar.gz 注意:wget获取https的时候要加上:--no-check-certificate tar zxvf .tar.gz #解压文件 cd pip-/ python setup.py install OK…

pipenv 是Kenneth Reitz大神的作品,提供Python的各个版本间的管理,各种包管理.个人觉得是virtualenv pip等工具的合体. pipenv主要有以下特性: (1)以前我们会用pip管理包,virtualenv管理Python的各个版本,pipenv集成了两者的功能. (2)管理requirements.txt文件可能会有问题,因此Pipenv使用Pipfile和Pipfile.lock,后者存放将包的依赖关系. (3)各个地方使用了哈希校验,更安全.自动公开安全漏洞…

pip 是一个安装和管理 Python 包的工具 , 是 easy_install 的一个替换品. distribute是setuptools的取代(Setuptools包后期不再维护了),pip是easy_install的取代. pip的安装需要setuptools 或者 distribute,如果你使用的是Python3.x那么就只能使用distribute因为Python3.x不支持setuptools. 一.windows 1. 下载pip 地址:https://pypi.python.…

RHEL6安装python包tornado tornado是使用Python开发的全栈式(full-stack)Web框架和异步网络库,最早由Friendfeed开发.通过使用非阻塞IO,Tornado可以处理数以万计的开放连接,是long polling.WebSockets和其他需要为用户维护长连接应用的理想选择. tornado 跟其他主流的Web服务器框架(主要是Python框架)不同是采用epoll非阻塞IO,响应快速,可处理数千并发连接,特别适用用于实时的Web服务.Tornado…

目录 setuptools 和 setup.py 你所需要做的事 & 一些概念 基础概念 关于源码分发文件和二进制分发文件 示例和分发选择 pure python module package extension module package 元信息参数 package 内容参数 py_modules 列举每个模块 package 列举每个包 package_dir 重新映射 package 和目录的关系 install_requires 和 dependency_links 安装依赖模块 ex…

背景 有个私有仓储,地址为https://your.repo.com/pypi/ 代码存储在gitlab, 地址为https://gitlab.company.com/software.git CI为jenkins 常规解决手法 jenkins有一个特定的节点,节点里面已经配置好了%HOMEPATH%/.pypirc [distutils] index-servers = deploy [deploy] repository=https://your.repo.com/pypi/ usernam…

原创连接 https://www.cnblogs.com/AlwinXu/p/5598543.html Python包中 __init__.py文件的作用 在创建python包的过程中,IDE都会在包根目录下创建一个__init__.py文件,该Python文件默认是空的.目录结构如下: Pycharm下的package树结构: 在Finder中的目录结构: 从Finder中的目录就可以看出来,每个package实际上是一个目录(Directory),那么IDE是怎么识别它为package呢?没…

Python包的管理可以通过Python 自带的管理 工具,例如:package-autoremove,package-list-packages, package-install 等,使用起来也非常方便.但是有些包是没有的. 而PyPA 推荐使用的是pip 来管理 Python 包.Pip 就像CentOS / RHEL 中的yum 一样.可以很方便的对Python 包进行管理.可以去pip 查找自己感兴趣的程序,或者做为贡献者提供Projects. 3.1 PyPA PyPA (Python…

pip 是 Python 包管理工具,该工具提供了对Python包的查找.下载.安装.卸载的功能.Python 2.7.9 + 或 Python 3.4+ 以上版本都自带 pip 工具. pip使用(cmd中执行) 1.pip包的安装(cmd中执行) pip --version //验证是否已经安装 pip --help //获取帮助 pip install -U pip //升级pip包 pip安装完毕后目录为$PYTHON_HOME/Scripts 2.使用pip管理Python包(cmd中…

本文主题如下: 编写一个包(Python 源代码),但不是本文的重点. 编译包,观察编译后的文件. 发布包,发布的包可以有多种类型. 如何在 Pypi 中查看已发布的包 注意: 本文编写的包在 Python2 环境下测试通过,实际上这个包(只是个例子)比较简单,在 Python3 下也能运行. 本文知识点可能陈旧,比如 Python Pypi 官方已做了很大改变. 1. 编写包源代码 这篇文章主要描述如何发布一个包,不描述如何编写一个包,如果你没有代码(只想学习如何发布包),可下载下面的示例.…

在创建python包的过程中,IDE都会在包根目录下创建一个__init__.py文件,该Python文件默认是空的.目录结构如下: Pycharm下的package树结构: 在Finder中的目录结构: 从Finder中的目录就可以看出来,每个package实际上是一个目录(Directory),那么IDE是怎么识别它为package呢?没错,__init__.py的第一个作用就是package的标识,如果没有该文件,该目录就不会认为是package. Python中的包和模块有两种导入方式:…