临床预测模型也是大家比较感兴趣的,今天就带着大家看一篇临床预测模型的文章,并且用一个例子给大家过一遍做法. 这篇文章来自护理领域顶级期刊的文章,文章名在下面 Ballesta-Castillejos A, Gómez-Salgado J, Rodríguez-Almagro J, Hernández-Martínez A. Development and validation of a predictive model of exclusive breastfeeding at hospital…

最近看了好多潜类别轨迹latent class trajectory models的文章,发现这个方法和我之前常用的横断面数据的潜类别和潜剖面分析完全不是一个东西,做纵向轨迹的正宗流派还是这个方法,当然了这个方法和潜增长和增长曲线模型在做法并没有实际区别,都是用的hlme这个函数.但是文献中的叫法和花样就比较多了. 像本文写的latent class trajectory models,之前写的潜类别增长模型LCGA和增长曲线模型GMM都是潜类别线性混合模型latent class linear…

今天给大家写广义混合效应模型Generalised Linear Random Intercept Model的第一部分 ,混合效应logistics回归模型,这个和线性混合效应模型一样也有好几个叫法: Mixed Effects Logistic Regression is sometimes also called Repeated Measures Logistic Regression, Multilevel Logistic Regression and Multilevel Bina…

之前给大家写过一篇数据清洗的文章,解决的问题是你拿到原始数据后如何快速地对数据进行处理,处理到你基本上可以拿来分析的地步,其中介绍了如何选变量如何筛选个案,变量重新编码,如何去重,如何替换缺失值,如何计算变量等等------R数据分析:数据清洗的思路和核心函数介绍 今天呢,就更进一步,对于一个处理好的数据,我们就可以进行统计分析了,本文的思路就是对照期刊论文的一般流程写写如何快速的实现一篇论文的统计过程并简洁高效地展示结果.依然提醒大家,请先收藏本文再往下读哈. 先做描述统计 基本上文章结果部分…

之前给大家写过一个临床预测模型:R数据分析:跟随top期刊手把手教你做一个临床预测模型,里面其实都是比较基础的模型判别能力discrimination的一些指标,那么今天就再进一步,给大家分享一些和临床决策实际相关的指标,主要是校准calibration和决策曲线Decision curve analysis. 校准曲线 做预测模型都应该报告校准曲线的: Reporting on calibration performance is recommended by the TRIPOD (Tran…

本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/ZEjaxDifNATeV8fO4krOIQ更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号. 为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理.建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! 一 R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt chart)-项目管理/学习计划 二 Bioinfo R|fastqcr QC数据处理 :测序结果的数据质控及…

如果大家已经熟悉python和R的模块/包载入方式,那下面的表查找起来相对方便.python在下表中以模块.的方式引用,部分模块并非原生模块,请使用 pip install * 安装:同理,为了方便索引,R中也以::表示了函数以及函数所在包的名字,如果不含::表示为R的默认包中就有,如含::,请使用 install.packages("*") 安装. 连接器与io 数据库 类别 Python R MySQL mysql-connector-python(官方) RMySQL Oracl…

###************************************** 新老客户统计 ***************************************### dachu <- read.csv("D:\\Dasktop\\bigdata_game\\天池\\大厨\\qijiandiankehu.csv", header = T, encoding = "utf-8", colClasses = c("character&qu…

利用data.table包变形数据 一. 基础概念 data.table 这种数据结构相较于R中本源的data.frame 在数据处理上有运算速度更快,内存运用更高效,可认为它是data.frame 的升级版.同时,data.table 包具备更多更强的功能,它基本工作形式是, dt [i, j, by] dt 为data.table 结构 i 为行,j 为列,by 为分组 二. 创建 data.table 和data.frame一样,如下: data.table(a=c(1, 2), b=c(…

R语言特点: 主要用于统计分析.图表显示.   属于解释型语言.支持模块化编程. 应用:数据科学.统计计算.机器学习   学习方法: 做笔记,记重点或者心得 手动实践,加深理解 坚持练习,利用身边数据进行应用分析 理解扩展包和函数背后的原理 运行R语言的三种方式: 在console中执行交互式命令(用于比较简单的命令) 在文本编辑器中进行编辑,然后运行. 通过source('x.R')进行运行 在shell里面使用Rscript命令   window下的R版本更新 install.package…