今天调试一个paper的代码,出现很奇怪的错误: qh2 <- mydf %>% filter(date >= as.Date('2013-08-14'),date <= as.Date('2013-08-20'))Error in `<=.default`(date, as.Date("2013-08-20")) :   comparison (4) is possible only for atomic and list types 各种挠头,尝试各种…

今天在一个 asp.net core 项目中遇到了 nuget 包版本冲突的问题,错误信息如下: Version conflict detected for Microsoft.AspNet.WebApi.Client. Reference the package directly from the project to resolve this issue. Cnblogs.Zzk.ServiceAgent -> Cnblogs.Net 2.0.1 -> Microsoft.AspNet.W…

今天在一个 asp.net core 项目中遇到了 nuget 包版本冲突的问题,错误信息如下: Version conflict detected for Microsoft.AspNet.WebApi.Client. Reference the package directly from the project to resolve this issue. Cnblogs.Zzk.ServiceAgent -> Cnblogs.Net 2.0.1 -> Microsoft.AspNet.W…

新版API上线后,发现LOG文件没有正常输出.查看Tomcat的Log文件发现如下的错误信息 May , :: AM com.sun.xml.ws.server.sei.EndpointMethodHandler invoke SEVERE: Found class ch.qos.logback.core.spi.CyclicBufferTracker, but interface was expected java.lang.IncompatibleClassChangeError: Foun…

  项目中出现如下错误,记录下解决方法: org.springframework.beans.factory.BeanDefinitionStoreException: Unexpected exception parsing XML document from class path resource [META-INF/spring/community-context.xml]; nested exception is java.lang.NoSuchMethodError: org.spri…

*** glibc detected *** /usr/lib64/R/bin/exec/R: free(): invalid next size (fast): 0x000000000263a420 *** ======= Backtrace: ========= /lib64/libc.so.6[0x313a47dda6] /lib64/libc.so.6[0x313a47f08e] /home/phoxis/Documents/Works/Programming/R/libmetis.so…

转载--https://www.analyticsvidhya.com/blog/2017/03/create-packages-r-cran-github/ 什么是 R 包?我开始创建 R 包的原因是?创建包的好处和挑战必要条件开始创建你的第一个包发布包向CRAN 做贡献后的体验附加提示Additional resources 1. 什么是 R 包? R 包就是一个可重复使用的 R 函数,附带有关如何使用的标准.简要说明文档.有时,包还附带简单的数据. 直至今日,CRAN 上有 10000多个…

randomForest 包提供了利用随机森林算法解决分类和回归问题的功能:我们这里只关注随机森林算法在分类问题中的应用 首先安装这个R包 install.packages("randomForest") 安装成功后,首先运行一下example library(randomForset) ?randomForset 通过查看函数的帮助文档,可以看到对应的example data(iris) set.seed(71) iris.rf <- randomForest(Species…

2013-07-15 21:41:04   #本文的目的在于介绍回归建模时变量选择和正则化所用的R包,如glmnet,ridge,lars等.算法的细节尽量给文献,这个坑太大,hold不住啊. 1.变量选择问题:从普通线性回归到lasso 使用最小二乘法拟合的普通线性回归是数据建模的基本方法.其建模要点在于误差项一般要求独立同分布(常假定为正态)零均值.t检验用来检验拟合的模型系数的显著性,F检验用来检验模型的显著性(方差分析).如果正态性不成立,t检验和F检验就没有意义. 对较复杂的数据建模(…

MacOS 上安装 R 包 install.packages("data.table") 后面提示是否安装需要编译的版本: Do you want to install from sources the package which needs compilation?y/n 选择了 y 之后,报错 clang: error: unsupported option '-fopenmp' 网上找到的解决方法是: 安装 clang-omp brew install clang-omp 但是提…

机器学习数据集,主数据集不能通过,人脸数据集介绍,从r包中获取数据集,中国河流数据集   选自Microsoft www.tz365.Cn 作者:Lee Scott 机器之心编译 参与:李亚洲.吴攀.杜夏德 要学习怎么使用微软 Azure 机器学习,最重要的是获取样本数据集和进行实验. 在微软,我们有大量的样本数据集可用.这些数据集已经在 Azure Cortana Intelligence Gallery 中的样本模型中得到了应用. 其中一些数据集可以通过 Azure Blob 存储获取,所以…

[下面列出每个步骤最有用的一些R包] .数据导入 以下R包主要用于数据导入和保存数据: feather:一种快速,轻量级的文件格式:在R和python上都可使用 readr:实现表格数据的快速导入 readxl:读取Microsoft Excel电子表格数据 openxlsx:读取Microsoft Excel电子表格数据 googlesheets:读取google电子表格数据 haven:读取SAS,SPSS和Stata统计软件格式的数据 httr:从网站开放的API中读取数据 rvest:网…

R不必说,数据统计分析可视化的必备语言,R包开发的门槛比较低,所以现在随便一篇文章都会发表一个自己的R包,这样有好处(各种需求早有人帮你解决了)也有坏处(R包太多,混乱,新手上手较难).作为生信工程师,日常就是查看别人写的R包,分析数据,然后借鉴.修改,根据自己的需求开发新的R包. 参考: http://blog.fens.me/r-build-package/ R包开发 如何系统地学习 R 语言的各种 packages? Developing Packages with RStudio To…

导入struts包,在struts核心包的ognl包下存在javassist包: 然后再导入hibernate包,在hibernate核心下也存在javassist包: 这样便会存在冲突,ecplise没有办法区分去调用哪个版本的包,所以我们应该去解决包之间的冲突. 解决方案: 1.通过<excludions>标签解决 我们如果想要使用较高版本的包,我们可以在低版本的包上右击,然后选择Exclude Maven Artifact.我们可以在pom.xml中看到: 这样便对低版本的jar包进行了…

yum安装是非常方便的,可以自动解决依赖问题,但是有时候我们安装包会出现冲突,这个时候我们就要查找是哪些包与哪些包出现冲突,然后再针对性的解决问题. 一般来说起冲突的包会报出来,主要为两点 1.包与包之间要仔细查看谁冲突了谁,然后依次查找这两个包是否在系统中安装过,rpm -a命令来查看.最后把已安装过的包卸载了(前提是包不重要)再看看会不会冲突.这个可以参考链接:http://blog.51cto.com/11009243/1835644 2.冲突的包也有报出版本引起的问题,这个我们需要解决版…

摘自 方匡南 等编著<R数据分析-方法与案例详解>.电子工业出版社 R包简介 R包提供了一个加载所需代码.数据和文件的集合.R软件自身就包含大约30种不同功能的包,这些基本包提供了R软件的基本功能.与此同时,R作为一个开源软件,它提供了各种统计计算函数,从而方便使用者能够灵活机动的进行数据分析,甚至创造出符合特定需要的新统计计算方法,而这些函数大多是以包的形式提供,这些都是世界各地R用户自己编写的,并上传到网上分享.因此,制作出属于用户自己的R包,并与全世界的R用户共享是一件非常有意思的事情.…

引入:http://blog.csdn.net/sanzhongguren/article/details/71191290 在spring reference中提到一个解决spring jar包之间版本冲突的解决方案,原文如下 It is possible to accidentally mix different versions of Spring JARs when using Maven. For example, you may find that a third-party lib…

生物上的一些包可以这样安装 source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("affy") 一般的包: install.package("包名") 使用library()可以查看已经安装的包的列表,会打开一个新窗口显示信息. 使用installed.packages()可以看到各个包安装的路径,版本号等信息. 也可以使用 .packages(all.available=T) 就在控制台…

1 debian包之间存在两大类关系 第一,依赖 第二,冲突 2 依赖类关系 2.1 depends 2.2 pre-depends 2.3 recommends 2.4 suggests 2.5 enhances 3 冲突类关系 3.1 conflicts 3.2 breaks 3.3 replaces…

如何制作自己的R包? 摘自 方匡南 等编著<R数据分析-方法与案例详解>.电子工业出版社 R包简介 R包提供了一个加载所需代码.数据和文件的集合.R软件自身就包含大约30种不同功能的包,这些基本包提供了R软件的基本功能.与此同时,R作为一个开源软件,它提供了各种统计计算函数,从而方便使用者能够灵活机动的进行数据分析,甚至创造出符合特定需要的新统计计算方法,而这些函数大多是以包的形式提供,这些都是世界各地R用户自己编写的,并上传到网上分享.因此,制作出属于用户自己的R包,并与全世界的R用户共享是…

在linux下安装rpm包时经常会遇到下面这个问题: error: Failed dependencies: ..................................................... 省略号表示安装此rpm缺少的包. 遇到此问题时可以在安装rpm包命令的后面加两个参数,如: rpm -ivh libstdc++5.0-3.3.3-62745cl.i386.rpm 改成: rpm -ivh libstdc++5.0-3.3.3-62745cl.i386.rpm -…

1.不同包之间调用,因为在不同文件夹下,引用的时候加上包名就可以了.运行时,在eclipse直接运行没有问题.但是在,命令行运行时出现找不到模块的错误.原因是,Python只搜索当前目录和内置模块以及安装的第三方模块.因此,会找不到模块. 解决办法是,在要运行的文件中加上sys.path.append('要引用的模块路径') 2.获取上一层路径的方法,os.path.split(sys.path[0])[0],sys.path[0]表示的是,当前运行文件路径,进行split得到元组,第一个就是上…

当你的项目需要安装的依赖包越多,遇到包冲突可能性就越大,尤其是当依赖的包有重大更新时.比如下图: 上面可以看到是xml跟intl_translation两个包有冲突,因为他们依赖两个不同的petitparser包.打开pubspec .yaml看到: 可能解决办法是去 pub.dartlang.org手动尝试历史版本的包,这么麻烦的吗?有没有别的解决办法呢?当然. 解决办法: 通过将两者依赖包版本号改为:any,点击flutter packages get重新获取包,这样就会自动去匹配适合两者的…

前言 这是代谢组学数据分析的一个R包,包括用于代谢组学数据分析.可视化和功能注释等众多功能.最近有同事在集群中搭建蛋白和代谢流程,安装这个包出现了问题,于是我折腾了一上午. 这个包的介绍在:https://github.com/xia-lab/MetaboAnalystR,安装确实还比较复杂,依赖的东西太多太多.废话不多说,记录下安装历程. 安装过程 首先最好是已经安装了自己的R版本(非root),比如我的是R-3.5.2.然后进入R中,依照文档给的顺序依次安装: 第一步:安装依赖包 insta…

最近安装github上的R包,经常显示Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet, : 无法打开URL'https://api.github.com/repos/之类的错误.起初以为是网络的问题,换了网不行,登梯子不行,关闭重启也不行. 在网上查了下,说是R默认是通过IE浏览器来下载包的,所以需要设置IE的安全选项. but,我已经很多年没用过IE了(但很多政府官方网站的操作都是默认IE,而且是要…

1.安装,加载所用到到R包 用BiocManager安装,可同时加载依赖包 source("https://bioconductor.org/biocLite.R") BiocManager::install("clusterProfiler") library(clusterProfiler) ##富集分析library(topGO) ###画GO图library(AnnotationHub) ##获取数据库library(BiocFileCache) ##依赖包…

目的 走一遍R包开发过程,并发布到Github上使用. 步骤 1. 创建R包框架 Rsutdio --> File--> New Project--> New Directory --> R Package 创建完成后,在R包文件夹下有如下文件(夹): man: 存放*.Rd文件 R: 存放R脚本 DESCRIPTION: R包描述信息 NAMESPACE: 命令空间 rmytools.Rproj: R工程文件 2. 自定义R包 上面是Rstudio为开发者创建的一个框架,接下来是…

1 package face_package; 2 3 import face_packagedemoA.DemoA; 4 5 /* 包(package) 6 * 1,对类文件进行分类管理. 7 * 2,给类提供多层命名(名称)空间 8 * 3,写在程序文件的第一行. 9 * 4,类名的全称是包名.类名 10 * 5,包也是一种封装形式. 11 * 命令行 -d指定存放生成的类文件的位置 12 * 除了手动创建文件夹包名,将类文件放入 13 * javac -d . PackageDemo.ja…

转自 http://bnuzhutao.cn/archives/901 一般 R 语言的书籍上,介绍安装 R 包的方法都是这样的: install.packages("packagename"); 一般而言这不会成功,因为它默认会安装到系统目录下面,而普通用户在这个目录里并没有写入的权限. 因此,需要在 install.packages 这个函数里面指定安装的路径,例如想安装到 /home/myname/R 这个目录,就这么写: install.packages("packa…

R语言的使用,很大程度上是借助各种各样的R包的辅助,从某种程度上讲,R包就是针对于R的插件,不同的插件满足不同的需求,截至2013年3月6日,CRAN已经收录了各类包4338个. 一. R语言包的安装 1.通过选择菜单: 程序包->安装程序包->在弹出的对话框中,选择你要安装的包,然后确定. 2.使用命令 install.packages("package_name","dir") package_name:是指定要安装的包名,请注意大小写. dir:包…