做差异表达的软件DEseq和edgeR所需要的数据格式必须是原始counts,经过normalization和log2后的数据都不适合,所以对于做差异表达计算的童鞋可以使用ExperimentHub下载TCGA的原始数据. GEO地址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE62944安装:首先安装环境要求BioC 3.4## In R-3.3library(BiocInstaller)useDevel()biocValid()…

Differential expression analysis for paired RNA-seq data 抽象背景:RNA-Seq技术通过产生序列读数并在不同生物条件下计数其频率来测量转录本丰度. 为了鉴定两种条件之间差异表达的基因,重要的是要考虑实验设计以及数据的分布特性. 在许多RNA-Seq研究中,表达数据以多对获得,例如来自相同个体的治疗前和治疗后样品.我们寻求将配对结构纳入分析. 结果:我们提出了一个用于RNA-Seq数据的贝叶斯分层混合模型,以分别考虑变异性来自配对数据结构的…

需求描述 在生产环境中,很多情况下需要采集数据,用以定位问题或者形成基线. 关于SQL Server中的数据采集有着很多种的解决思路,可以采用Trace.Profile.SQLdiag.扩展事件等诸多方案. 几种方案各有利弊,其中从SQL Server2012版本开始,微软的开始各种整合这些采集方案,力推扩展事件. 对于上述的数据采集只是一种实现手段,对于采集完数据的存储没有统一的规范,并且对于多服务器的数据采集及汇总没形成统一的规范. 本篇实现 1.通过SQL Server自带的数据采集器实现…

简评:还有其他公司比 Facebook 更能收集我们的数据么?大概,可能,没准是谷歌.(文末彩蛋) 最近 Facebook 已经因为收集个人数据而站在了聚光灯前,它收集用户数据并因此获利. 但是要知道,Facebook 不是单独一家「在用户毫不知情」的情况下收集数据的公司,Google 可能更甚:它的信息搜集量,追踪范围,以及用户在 Google 相应网站和应用上花费更多的时间. 但是尽管如此,仍然有很多用户不了解自己的信息被收集和使用的程度. 欧洲正在拟定新法规[1],推动谷歌等公司公开更多信…

最近需要搭建一套日志监控平台,结合系统本身的特性总结一句话也就是:需要将Kafka中的数据导入到elasticsearch中.那么如何将Kafka中的数据导入到elasticsearch中去呢,总结起来大概有如下几种方式: Kafka->logstash->elasticsearch->kibana(简单,只需启动一个代理程序) Kafka->kafka-connect-elasticsearch->elasticsearch->kibana(与confluent绑定紧…

摘自 https://www.jianshu.com/p/d52020f0c247 本文以一款阿里云市场历史天气查询产品为例,为你逐步介绍如何用 Python 调用 API 收集.分析与可视化数据.希望你举一反三,轻松应对今后的 API 数据收集与分析任务. 市场 我们尝试的,是他们找到的阿里云市场的一款 API 产品,提供天气数据. 它来自于易源数据,链接在 https://market.aliyun.com/products/57096001/cmapi010812.html?spm=517…

1 docker服务的安装 1)在线安装docker服务 在线安装可以参考下面的安装步骤 a 安装相关依赖组件 yum install -y yum-utils device-mapper-persistent-data lvm2 b docker源安装配置 yum-config-manager --add-repo https://download.docker.com/linux/centos/docker-ce.repo yum-config-manager --enable docker…

Sysstat是一个工具集,包括sar.pidstat.iostat.mpstat.sadf.sadc.其中sar是其中最强大,也是最能符合我们测试要求的工具,同时pidstat也是非常有用的东东,因此本文结合性能测试重点介绍这两个工具. 1.Sysstat下载地址 下载:http://sebastien.godard.pagesperso-orange.fr/download.html 2.Sysstat的安装 #解压tar.gz包 tar -zxvf sysstat-12.4.0.tar.g…

该脚本只是把awr报告的内容,原封不动的 展现出来,做记录 awrreport.sql  脚本内容如下: ******************************************************* #该脚本请用具有 dba 权限的用户执行,普通用户没有权限访问数据库的基表set linesize 1200 ;set pagesize 0;set long 99999;set heading off;--set termout off;set echo off;set feed…

#!/usr/bin/ksh touch hostinfo$(date +%Y%m%d).csv filename=hostinfo$(date +%Y%m%d).csv >${filename} for ip in $(cat iplist); do SYSTEM=`ssh -q ${ip} uname -s` HOST_NAME=`ssh -q ${ip} hostname` SERNUM="" OS="" printf "${ip},"…