转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大,其下面有非常多的参数,但是一般使用的参数如:-p.-i.-d.-o.-e等几个. -p: 执行的程序名称 -d: 搜索的数据库名称 -i : 要查询的序列文件名(Query File) -e:(数学)期望值(Expectation value),E值是个统计阈值,缺省值10, 意指比对结果中由于随…

详见:http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/ Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 本文面向初学者(最好还是懂得基本的linux使用),高手可直接忽视.不介绍Windows系统中的安装方法,一是因为思路一样,二是因为Linux中BLAST效率更高,系统更稳定,不会卡死.所以,请用Linux服务器,我想你也不忍心让自己心爱的本本跑几十个小时的程序吧. 请不要因为篇幅长,而觉得很困难,只是为了初学者能懂,叙述比较详(luo)细(s…

链接:http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=830496&do=blog&quickforward=1&id=640600 Linux下BLAST+的本地化(NCBI-BLAST 2.2.29+): 1.  下载软件BLAST: 在以下网址  ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 下载:   ncbi-blast-2.2.29+-x6…

简介 NCBI除了提供在线的Web BLAST序列比对服务外,还提供FTP方式下载序列比对工具.这允许在本地平台上针对从NCBI下载或本地创建的数据库执行BLAST搜索.这些实用程序没有图形用户界面,通过类似DOS的命令窗口运行,并通过基于文本的命令行开关接受输入. 以下内容介绍了在运行Windows 7操作系统的PC上安装BLAST+和示例NCBI数据库所需的步骤. 下载 BLAST+软件包ncbi-blast-#.#.#+-win64.exe,适用于运行64位Windows操作系统的PC上.…

1)blast产生背景 双序列比对可以采用是基于动态规划算法的Needleman-Wunsch(NW)和Smith-Waterman algorithm(SW)算法,虽然精度高,但计算消耗大.当与数据库比对的时候,该算法就显得不切实际.因此TASTA,blast采用启发式算法使得通过大幅度丢失灵敏度来减少运行时间.与FASTA软件相比,blast通过把搜索限制在狭隘的矩阵对角线条带上,来改进FASTA进行数据库搜索的速度. 2)blast的大致原理 blast 程序首先查询query序列的所有子…

文档目录 本节内容: 简介 应用语言 本地化源 XML文件 注册XML本地化源 JSOn文件 注册JSON本地化源 资源文件 自定义源 获取一个本地文本 在服务端 在MVc控制器里 在MVC视图里 在Javascript里 格式化参数 默认本地化源 扩展本地化源 获取语言 最佳实践 简介 任何应用至少有一种用户界面语言,很多应用有多种,ABP为一个应用提供了一个灵活的本地化系统. 应用语言 第一件事就是声明支持哪些语言,这在你的模块的PreInitialize方法里完成,如下所示: Config…

前言  最近加入到新项目组负责前端技术预研和选型,其中涉及到一个熟悉又陌生的需求--国际化&本地化.熟悉的是之前的项目也玩过,陌生的是之前的实现仅仅停留在"有"的阶段而已.趁着这个机会好好学习整理一下,为后面的技术选型做准备.  本篇将阐述国际化和本地化的概念,以及其中一个很重要的概念--Language tag(也叫Language code 或 Culture). 何为国际化?  国际化我认为就是应用支持多语言和文化习俗(数字.货币.日期和字符比较算法等),而本地化则是应用…

返回总目录<一步一步使用ABP框架搭建正式项目系列教程> 本篇目录 扯扯本地化 ABP中的本地化 小结 扯扯本地化 本节来说说本地化,也有叫国际化.全球化的,不管怎么个叫法,反正道理都是一样的,就是一个系统具有选择多种语言的能力.比如,我们用的电脑或手机,可以在设置中选择语言,但是这并不影响系统已经具有的功能,只是显示的文字变成你所选语言的文字了.再比如说微信,功能设置里面也能选择语言,比如你选择的是英语,那么我们在中文看到的朋友圈就变成了"Moments". 想要更详细地…

本文逐个分析ABP中涉及到locaization的接口和类,以及相互之间的关系.本地化主要涉及两个方面:一个是语言(Language)的管理,这部分相对简单.另一个是语言对应得本地化资源(Localization)的管理,这部分稍显复杂. LanguageInfo:用于封装language的基本信息. ILanguageProvider:接口定义一个返回本地化语言集合的方法.这里使用接口做隔离是有必要的,因为ABP底层框架的DefaultLanguageProvider只是返回通过代码hardc…

ABP Zero模块扩展了ABP基础框架中的本地化功能,实现了通过数据库管理本地化的功能.其通过数据库保存本地化语言及其资源. ApplicationLanguage:代表本地化语言的实体类.一种语言就是一个ApplicationLanguage实例. ApplicationLanguageProvider:实现了ILanguageProvider接口,通过IApplicationLanguageManager实例设置DefaultLanguage和获取应用所配置的Language的列表. Ap…

系列目录 我们的系统有时要扩展到其他国家,或者地区,需要更多的语言环境,微软提供了一些解决方案,原始我们是用js来控制的,现在不需要了. 我们只要创建简单的资源文件,通过MVC的路由设置就可以轻松的进行语言中的切换. 本节受益于:Asp.net MVC3 高级编程第121页.大家可以自行百度这本书,这应该是国内第一本中文版的MVC3.0教程 现在从项目入手吧(本节也适合其他MVC程序),新建一个语言项目来放资源文件. 一.新建App.Lang,同时新建BaseRes.resx和BaseRes.e…

原文:Globalization and localization 作者:Rick Anderson.Damien Bowden.Bart Calixto.Nadeem Afana 翻译:谢炀(Kiler) 校对:许登洋(Seay).高嵩 使用 ASP.NET Core 创建一个多语言版本的网站有助于你吸引到更多的用户,ASP.NET Core 提供服务和中间件来支持本地化语言和文化. 国际化涉及 全球化 和 本地化.全球化是为了应用程序支持不同文化而设计的.全球化增加了对特定地理区域的语言文字…

前言  最近加入到新项目组负责前端技术预研和选型,其中涉及到一个熟悉又陌生的需求--国际化&本地化.熟悉的是之前的项目也玩过,陌生的是之前的实现仅仅停留在"有"的阶段而已.趁着这个机会好好学习整理一下,为后面的技术选型做准备.  本篇将于大家一起挽起袖子撸代码:) 如何获取Language tag?  在实现本地化处理前,我们起码先要获取Language tag吧?那么获取方式分为两类 1.直接获取浏览器的Language tag信息  一般来说浏览器语言的版本标示着用户所属或…

前言  最近加入到新项目组负责前端技术预研和选型,其中涉及到一个熟悉又陌生的需求--国际化&本地化.熟悉的是之前的项目也玩过,陌生的是之前的实现仅仅停留在"有"的阶段而已.趁着这个机会好好学习整理一下,为后面的技术选型做准备.  本篇作为系列的最后一篇,打算和大家一起看看HTTP的Content Negotiation机制和更多关于本地化的应用方向. Content Negotiation(内容协同)  记得第一次接触国际化和本地化时是指服务端根据请求头字段Accept-Lan…

<?php /* [LocoySpider] (C)2005-2010 Lewell Inc. 火车采集器 DedeCMS 5.7 UTF8 文章发布接口 Update content: 图片加水印,远程图片本地化(无后缀的图片也可以本地化) Update people :Abner Update time : 2017-01-05 */ /********密码验证***********/ $password='huarenyuangong'; //这个密码是登陆验证用的.您需要在模块里设置和这…

$body = '<p style="margin: 0px 0px 1.1em; padding: 0px; color: rgb(51, 51, 51); font-family: Arial, Verdana, Helvetica, sans-serif; font-size: 14px; line-height: 25.200000762939453px; text-align: center;"> <img alt="" src=&quo…

返回总目录 本篇目录 应用语言 本地化资源 获取本地化文本 扩展本地化资源 最佳实践 应用语言 一个应用至少有一种UI语言,许多应用不止有一种语言.ABP为应用提供了一个灵活的本地化系统. 第一件事情就是声明支持哪些语言.这个是在模块的PreInitialize方法中完成的,如下所示: Configuration.Localization.Languages.Add(new LanguageInfo("en", "English", "famfamfam-…

本地化与国际化详解 效果如下:   英语:                                                                    中文: 具体实现如下:   一.先做准备:设置程序本地化 在xcode点击程序图标:点击Info选项->Localizationn,点击“+”,选择要添加的语言,简体中文选择Chinese(zh-Hans) 你会在你工程目录下发现多了个文件夹,“zh-Hans.lproj",x-code使用.lproj作为其本地化…

在使用本地化语言之前,来看看本地化语言文件内容的结构(这里我以Chinese为例):"Cancel"="取消";"OK"="确定";"Tip"="信息提示";"Login Faild"="登陆失败"; ....... 其实就是简单的字符串替代而已,在程序中,如果有个UILable控件,需要赋值:lbLoginTip.text = NSLocaliz…

本地化也叫国际化,就是做多语言程序时,可以一键式将当前语言切换到另外一种语言.对于跨国企业或者和国外有业务往来的公司特别重要:就算一个普通公司的门户如果支持中.英.繁体,也会让人觉得高大上.有没有呀,有没有!不过微软对国际化/本地化一直支持的就很好,现在本地化代码还开源,这是相当nice的.本次要介绍的是微软asp.net5的“Localization-dev”解决方案,可以到github上asp.net5官网上下载: https://github.com/aspnet/Localization…

在上一篇<DDD开发框架ABP之本地化/多语言支持>中,我们知道,ABP开发框架中本地化资源存储可以采用XML文件,RESX资源文件,也提供了其他自定义的存储方式的扩展接口.ABP框架默认实现了前面两种方式,而数据库存储方式则需要自己扩展,大概是因为数据库存储涉及到了实体和仓储等方面的具体内容,不适合放在基本框架里面. 以数据库的方式存储本地化资源,一个最明显的好处就是方便修改,尤其是对于基于数据库的应用系统而言,可以提供统一的维护界面.接下来我们就来一步步地实现将本地化资源存储在数据库中.…

使用 XCode 6 开发本地化时,第一步,不能忘记,否则在添加本地化文件时,可能会找不到简体中文. 此外,如果使用 NSLocalizedString(@"xxx", nil) 来获取本地化文本的话,本地化字符串文件要命名为:Localizable.strings…

项目的本地化就是:iOS系统在不同语言环境下自动切换语言,从而实现一个app发布到全世界各个国家的AppStore上. 我们不仅仅需要在iOS项目中做本地化处理,在上架iOS APP的时候,也需要做对应的本地化设置哦. iOS项目中需要处理的本地化大概有以下几点: 1.APP名称 2.字符串 3.图片 4.storyboard/xib文件 5.上架设置 前置工作 首先我们要在 PROJECT -> project name -> Localizations 下添加我们需要适配的语言,这里我添加…

转自http://www.cocoachina.com/industry/20140526/8554.html 简单说,国际化是一个应用程序国际兼容性设计的过程,比如: 1.以用户母语处理文本输入和输出: 2.处理不同的日期.时间以及数字格式: 3.利用适当的历法和时区处理数据:   国际化是一项你和开发者通过利用系统提供的API来实现的活动,并在代码上做一些补充和修改,从而让应用的中文版.阿拉伯语版本和英文版一样好.   相比之下,本地化仅仅是把应用的用户界面和资源翻译成不同的语言,这是你可以…

ActiveReports UI界面中的所有字符信息.错误提示信息.以及一些logo.图像资源,都能够通过运行batch文件来本地化.本文主要介绍资源本地化的具体步骤: 1. 资源目录 所有可本地化的资源文件都放在安装目录下:C:\Program Files (x86)\GrapeCity\ActiveReports 10\Localization. 2. 首先指定语言 2.1 以管理员权限来打开记事本或其他文本编辑器 2.2 使用记事本打开ARDesigner.bat为后缀的资源文件,修改Cu…

因为公司网络环境较差和自己是菜鸟的原因,很简单的事情折腾了不少时间.测试开发的网页时候 更新速度总是很慢,这跟使用bootstrapCDN有关系,因为每次更新,它都要重新访问cdn.bootstrap.com一遍,所以需要响应时间.如果网络速度快当然,不需要本地化,否则还是本地化资源文件,不必去忍受每一次响应很长时间. 只是为了测试自己开发的某小功能而本地化的.如果网站上线,那么还是要还原bootstrapCDN. (一)搭建bootstap环境 可以用bootstrap的CDN服务,在<hea…

我们又都知道,Spark中任务的处理也要考虑数据的本地性(locality),Spark目前支持PROCESS_LOCAL(本地进程).NODE_LOCAL(本地节点).NODE_PREF.RACK_LOCAL(本地机架).ANY(任何)几种.其他都很好理解,NODE_LOCAL会在spark日志中执行拉取数据所执行的task时,打印出来,因为Spark是移动计算,而不是移动数据的嘛. 那么什么是NODE_PREF? 当Driver应用程序刚刚启动,Driver分配获得的Executor很可能还…

Google Web font在国内经常不稳定,速度在国内延迟也很高,而引发网页打开速度慢. 一.常见的字体格式介绍 不同的浏览器对字体格式支持是不一致的,常见的如下: 1.TureTpe(.ttf): .ttf字体是Windows和Mac的最常见的字体,是一种RAW格式,因此他不为网站优化,支持这种字体的浏览器有[IE9+,Firefox3.5+,Chrome4+,Safari3+,Opera10+,iOS Mobile Safari4.2+]: 2.OpenType(.otf): .otf字…

因为调用系统相册.相机需要显示中文,所以搞了半天才知道是在Project->info->Custom ios Target Properties 添加 Localizations 并加入Chinese 本地化多语言化支持: 1.添加多国语言支持   Project->info->Localizable   加入语言支持 2.创建国际化语言文件 new File-> localizable.string   并在fileinspector(文件观察器) 中选中Localizab…

本地化(Localization)也就是多语言功能,借此用户能够选择他的母语或熟悉的语言来使用系统,这显然非常有利于软件系统推向国际化.一个应用程序的UI界面至少有一种语言,DDD开发框架ABP就提供了一个弹性的多语言框架,可以简化我们在多语言方面的开发时间.利用ABP完整实现多语言只需要简单地完成三个步骤:建立资源.配置资源以及使用资源. 一.建立资源 本地化的内容主要是文本字符串,ABP提供三种方式存储本地化资源的方式,分别是ASP.NET自带的资源文件.XML文件以及自定义的资源获取方式.…