Docker方式安装QIIME 2】的更多相关文章

# 下载最新版QIIME 2 docker pull qiime2/core:2017.7 # 测试是否安装成功 docker run -t -i -v $(pwd):/mnt/hgfs/2017 qiime2/core:2017.7 qiime # 启动docker命令行,挂载目录至/mnt/hgfs/2017目录,退出自动移除 docker run --rm -v $(pwd):/mnt/hgfs/2017 --name=qiime -it qiime2/core:2017.7 这就相当于打…
今天使用docker方式安装openstf碰到了一小坑,坑了我半天.特此记录! docker方式安装stf就不说了,网上教程一大把. 但是... 安装完之后.进入web控制界面,手机连接的好好的.但硕大几个字:No Device Connect,然后各种日志查看,甚至不用docker安装,折腾了半天.然并卵没用. 最后发现是vm虚拟机的问题. 看这里: 右下角的这排小图标,那个蓝色的usb,之前是灰的.要点一下连接,然后就好了.真是日了狗了 然后就OK了 好了,记录一下.可能是自己sb了.操!…
在CentOS上通过Docker方式安装Redis 首先保证已经安装docker. 拖拽redis镜像 docker pull redis 启动redis docker run -p 6379:6379 -v $PWD/data:/data -d redis redis-server --appendonly yes 命令说明: -p 6379:6379 : 将容器的6379端口映射到主机的6379端口 -v $PWD/data:/data : 将主机中当前目录下的data挂载到容器的/data…
centos版本信息: docker版本信息 mysql版本:5.7 1.docker方式安装 首先拉取mysql镜像:docker pull mysql:5.7     查看本地的mysql镜像 执行如下命令,运行mysql容器: docker run -p 3307:3307 --name mysql-3307 -v /data/mysql/3307/conf/my.conf:/etc/mysql/mysql.conf.d/mysqld.cnf   -v /data/mysql/3307/m…
yum方式安装 wget https://openresty.org/package/centos/openresty.repo mv openresty.repo /etc/yum.repos.d/ ll /etc/yum.repos.d/ yum list | grep openresty yum install -y openresty.x86_64 service openresty status service openresty start /usr/local/openresty/…
这个示例展现了如何运行支持MySQL数据库的Zabbix server,基于Nginx web服务器运行Zabbix web接口,以及Zabbix Java gateway. 1. 启动一个空的MySQL服务器实例 docker pull mysql:5.7 docker run --name my…
pipelinewise 没有提供基于pip 包的模式进行安装,而且推荐使用docker 以及源码的方式 以下是一个使用docker运行的方式 安装   git clone https://github.com/transferwise/pipelinewise.git cd ./pipelinewise docker build -t pipelinewise:latest . 配置环境变量 alias pipelinewise="$(PWD)/bin/pipelinewise-docker&…
参考网站:https://www.jenkins.io/zh/doc/book/installing/#在docker中下载并运行jenkins 建议使用的Docker映像是jenkinsci/blueocean image(来自 the Docker Hub repository). 该镜像包含当前的长期支持 (LTS) 的Jenkins版本 (可以投入使用) ,捆绑了所有Blue Ocean插件和功能.这意味着你不需要单独安装Blue Ocean插件. 下载 jenkinsci/blueoc…
网上文档也多,安装的时候,还是踩了几个坑. 现在作一个安装记录吧. 1,先作自签名的证书ca-csr.json(为了和k8s共用根证书,可能将信息调为k8s). { "CN": "kubernetes", "key": { "algo": "rsa", "size": 2048 }, "ca": { "expiry": "438000h&…
1 - 官网信息 操作步骤:https://jenkins.io/zh/doc/book/installing/#docker Docker映像地址:https://hub.docker.com/r/jenkins/jenkins 官网建议 建议使用的Docker映像是jenkinsci/blueocean image(来自 the Docker Hub repository) jenkinsci/blueocean:https://hub.docker.com/r/jenkinsci/blue…
1. docker pull jenkins 2. docker run -d -p 49001:8080 -v $PWD/jenkins:/var/jenkins_home:z -t jenkins 如果要设置nginx做反代,可以 upstream app {     server 127.0.0.1:49001; } server {     listen 80;     server_name jenkins.your-domain.com;       location / {    …
以5.7版本为例 1 配置mysql配置文件编辑/etc/my.cnf,添加以下内容: [mysqld] skip-host-cache skip-name-resolve datadir=/var/lib/mysql socket=/var/lib/mysql/mysql.sock secure-file-priv=/var/lib/mysql-files user=mysql # Disabling symbolic-links is recommended to prevent assor…
gitlab就相当于我们自己内网搭建的git服务,相当于公司内的github. 拉取镜像docker pull gitlab/gitlab-ce 创建宿主机的数据目录mkdir -p /mnt/gitlab/etcmkdir -p /mnt/gitlab/logmkdir -p /mnt/gitlab/data 执行镜像并且把宿主机的端口与目录映射进容器docker run \ --detach \ --publish 8443:443 \ --publish 8090:80 \ --name…
获取镜像 docker pull postgres: docker pull sonarqube:-community 启动镜像 docker run -d -p : -e POSTGRES_PASSWORD= --name postgres postgres: docker run -d -p : -e -community…
1.创建几个文件夹保存ElastAlert相关配置信息,用来挂载到容器中使用 2.编写核心配置,创建 ${ELASTALERT}/config/config.yaml用来存储核心配置: 3.ElastAlert的启动参数配置,创建 ${ELASTALERT}/config/config.json启动参数配置文件: 4.编写一条报警规则 5.邮箱认证配置 6.拉取镜像 7.容器编排运行 8.告警规则测试 若无异常,你收到的报警邮箱大概是这样一份聚合后的结果: ElastAlert Kibana管理…
之前使用的项目GitHub地址是https://github.com/dazdata/redash.git,这个是直接复制国外的项目的,地址:https://github.com/getredash/redash.git 国内这个地址看release只有发布版本 但是复制的国外的这个看release,除了发行版本外,还有其他信息: 因此可以直接下载相对应的docker镜像,然后启动容器使用,就不用跟之前的那样麻烦了 docker pull redash/redash:8.0.0.b32245 d…
官方文档地址:https://github.com/grafana/loki/tree/master/production The Docker images for Loki and Promtail are available on DockerHub. To test locally, we recommend using the docker-compose.yaml file in this directory. Docker starts containers for Promtai…
mkdir -p /home/my_wordpress cd my_wordpress/ vim docker-compose.yml version: '3.3' services: db: image: mysql:5.7 volumes: - db_data:/var/lib/mysql restart: always environment: MYSQL_ROOT_PASSWORD: somewordpress MYSQL_DATABASE: wordpress MYSQL_USER:…
获取Ceph的Docker镜像 因为公司对于网络环境的限制,安装ceph时使用ceph-deploy反而很不方便,且ssh免密码方式也不适用,所以使用docker方式安装. Git地址 https://github.com/ceph/ceph-docker/tree/master/ceph-releases/luminous DockerHub地址 https://hub.docker.com/r/ceph/daemon/ 通过DaoCloud加速器后下载的地址 docker pull ceph…
docker pull rabbitmq 自定義的rabbitmq Dockerfile # base image FROM rabbitmq:3.7-management # running required command RUN rabbitmq-plugins enable --offline rabbitmq_management rabbitmq_management_agent rabbitmq_shovel rabbitmq_mqtt rabbitmq_federation_ma…
写在前面 我之前写过Asp.net Core 使用Jenkins + Dockor 实现持续集成.自动化部署(一):Jenkins安装这jenkisn的安装过程,但这篇使用的是docker的方式安装的,在实际的使用过程后:我不推荐新手使用docker的方式安装jenkins 新手使用docker的方式安装jenkins使用过程中可能会遇到较多问题,耗费不必要的时间精力: 运行环境 centos:7.2 cpu:1核 2G内存 1M带宽 安装java 因为jenkins是用java开发的,需先安装…
CentOS环境Docker安装教程(官方推荐的docker三种方式安装) 一.使用yum方式安装 1.安装依赖包 $ sudo yum install -y yum-utils device-mapper-persistent-data lvm2 2.设置稳定版仓库 $ sudo yum-config-manager --add-repo https://download.docker.com/linux/centos/docker-ce.repo 3.安装 //安装最新版本 $ sudo y…
二进制方式安装docker(非root用户启动docker) 一.下载安装包: 地址:https://download.docker.com/linux/static/stable/x86_64/ 这里本人选择安装docker-19.03.9.tgz 二.创建属组docker groupadd docker 三.创建用户dock useradd -m -d /data/dock dock 四.把用户dock加入docker组 gpasswd -a dock docker 五.编辑文件 [root…
CentOS环境下的Docker官方推荐的三种安装方式 yum安装方式 本地RPM安装方式 脚本安装方式 目录 1.下载Docker的RPM安装包 2.安装Docker 3.通过RPM安装包安装Docker出现的问题 如果无法使用yum方式安装Docker,可以通过先下载Docker的RPM包,然后在本地进行安装. 这种方式在工作的时候推荐使用,因为容易统一环境. 1.下载Docker的RPM安装包 (1)方式一 通过阿里云镜像网站下载RPM包. https://mirrors.aliyun.c…
rpm方式 源地址:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/gitlab-ce/yum/el7/ wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/gitlab-ce/yum/el7/gitlab-ce-12.9.0-ce.0.el7.x86_64.rpm rpm -ivh gitlab-ce-12.9.0-ce.0.el7.x86_64.rpm vim /etc/gitlab.rb # 编辑站点地址 gitlab-ctl re…
通过lsb_release命令查看以下我的LinuxMint发行版, 查看以下我的Linux内核版本, Docker要求Linux内核版本必须在要在3.10以上,显然我们的系统是满足的. 1. Docker安装 操作系统默认的apt源有docker包,我们可以直接使用下面的apt-get命令安装docker, $ sudo apt-get install -y docker.io 不过其安装的版本比较老.我们采用下面两种方式进行安装,个人比较推荐第二种,第二种方式安装的是最新的. 1.1 从Do…
之前一篇文章 Redis安装及主从配置 介绍了redis的安装配置,另一篇文件介绍了 Docker Centos安装Openssh .今天将两篇文件结合一下——在Docker Centos环境下搭建redis缓存数据库. Redis安装及主从配置 中执行到 “2.2.4启动 redis 服务” 即可认定为redis环境搭建完毕.但是要在docker容器中搭建这些东西就不这么容易了.比如你的容器中要存在make.g++.autoconfig等环境,但是仔细想想,这些编译需要的环境在真正运行的时候并…
官方站点上有各种环境下的 安装指南,这里主要介绍下Ubuntu和CentOS系列的安装. Ubuntu 系列安装 Docker 通过系统自带包安装 Ubuntu 14.04 版本号系统中已经自带了 Docker 包,能够直接安装. $ sudo apt-get update $ sudo apt-get install -y docker.io $ sudo ln -sf /usr/bin/docker.io /usr/local/bin/docker $ sudo sed -i '$acomp…
阿里专属的镜像加速 在宿主机器编辑文件:vi /etc/docker/daemon.json 阿里专属的镜像加速地址,类似于"https://91cntlkt.mirror.aliyuncs.com". 请在该配置文件中加入(没有该文件的话,请先建一个): { "registry-mirrors": ["https://91cntlkt.mirror.aliyuncs.com"] } 最后,需要重启docker服务 之后再使用pull命令拉取镜像…
准备 基本事项 Docker环境 登录授权方式 镜像存放地址 HTTPS外网访问 启动Docker Registry 1. 基本事项 本篇涉及到的数据文件都放在/data目录下, 其中会有三个子目录 /data/auth/ 基本的用户名密码认证文件存放地址 /data/certs/ docker registry 镜像https访问射击到的证书与密钥的存放地址 /data/registry/ docker registry镜像的存放地址, 当push镜像到镜像服务器之后,镜像就是存放在这里 2.…