Picard Tools - By Broad Institute http://broadinstitute.github.io/picard/command-line-overview.html java version "1.8.x" java -jar /path/to/picard.jar -h Full list of Picard tools AddCommentsToBam AddOrReplaceReadGroups BaitDesigner BamToBfq Bam…

软件下载与说明:http://www.broadinstitute.org/software/allpaths-lg/blog/?page_id=12 原始数据的深度要达到100以上. 至少要两个库,大库和小库, 小库的一对reads要有重叠部分.并且小库的插入片段大小分布差异要在20%以内. 大库插入片段要接近3000,并且长度分布可以有较大的差异. ALLPATHS‐LG requires a minimum of 2 paired‐end libraries – one short and…

by Umer Zeeshan Ijaz The purpose of this tutorial is to introduce students to the frequently used tools for NGS analysis as well as giving experience in writing one-liners. Copy the required files to your current directory, change directory (cd) to t…

文章转载于 Original 2017-06-08 Jolvii 生信百科 由于生物信息的大部分工作都是在没有 root 权限的集群上进行的,本期我主要介绍一下非 root 用户怎么安装常用的软件.工欲善其事,必先利其器! 准备工作 1 首先我们建一个文件夹,用来存储我们自己编译的程序 ($HOME/software/bin) 和预编译的程序 ($HOME/software). mkdir -p $HOME/software/bin 2 用 vim 或 nano 等编辑器修改 ~/.bash_p…

今天拉同事最新的代码,编译时老是报如下错误: Error:Could not find com.android.tools.build:gradle:2.2.0.Searched in the following locations: file:/D:/software/android-studio/gradle/m2repository/com/android/tools/build/gradle/2.2.0/gradle-2.2.0.pom file:/D:/software/android…

Productivity Power Tools 是微软官方推出的 Visual Studio 扩展,被用以提高开发人员生产率.它的出现一定程度上弥补和完善了 Visual Studio 自身的不足,比如其中的标记自动补全.复制引用等看似虽小,但却真得帮助我减轻了很多麻烦.博客园中推荐该扩展的文章也不在少数,本篇多少也有点类似,只是为了大家阅读方便,我为个别比较好有的功能配上了 GIF 动画. 该扩展中很多有用的功能已经被直接加入到下一个版本的 Visaul Studio IDE当中,也就是说你…

dnt@MT:~$ cd /media/cdrom0 进入光驱内 dnt@MT:/media/cdrom0$ ls 查看当前目录下有哪些内容manifest.txt run_upgrader.sh VMwareTools-9.6.2-1688356.tar.gz vmware-tools-upgrader-32 vmware-tools-upgrader-64 dnt@MT:/media/cdrom0$ cp VMwareTools*.tar.gz /home 拷贝VWTools到home目录下…

上一篇 第二篇:Entity Framework CodeFirst & Model 映射 主要介绍以Fluent API来实作EntityFramework CodeFirst,得到了大家一些支持,其中就有一位同学就提出.熟悉了EntityFramework CodeFirst 原理,就可以用微软的工具来生产代码.是的,今天就来讲一下,由微软EntityFramework小组开发的为EntityFramework CodeFirst Visual Studio小插件 “Entity Frame…

一.Timeline panel 概况 Timeline工具栏可以详细检测出Web应用在加载过程中,时间花费情况的概览.这些应用包括下载资源,处理DOM事件, 页面布局渲染或者向屏幕绘制元素. 如下图,Timeline面板分为四个模块—控制模块,概述模块,火焰图模块,细节模块. 控制模块Control:控制开始记录,停止记录,配置一条记录要抓取信息类型,包括:JS概况,内存,重绘,截图.. 概述模块Overview:页面性能的一个高度总结. 火焰图模块Flame Chart:CPU栈的可视化描述…

1.在VMWare选VM -> Install VMWare Tools-,就会在桌面出现VMWare Tools图示让你安裝 2.进入CentOS桌面后,将光盘打开,看到了VMWareTools-6.0.2.59824.tar.gz. 3.将VMWareTools-6.0.2.59824.tar.gz复制到/home,进行解压缩. #cp  VMWareTools-6.0.2.59824.tar.gz /home # tar -zxvf VMwareTools-6.0.2-59824.tar.…