1.数据库简介 UniVec是一个数据库,可用于快速识别核酸序列中可能来自载体来源(载体污染)的片段.使用UniVec进行筛选是高效的,因为已经消除了大量冗余子序列,从而创建一个只包含来自大量载体的每个惟一序列段的一个副本数据库.除了载体序列,UniVec还包含用于克隆cDNA或基因组DNA过程中常用的adpter.linkers和引物的序列.这使得在载体筛选过程中可以发现这些寡核苷酸序列的污染.UniVec可以从NCBI FTP目录获得:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/p…

参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解BLAST Databases:BLAST FTP Site   如何下载NCBI blast数据库? NCBI提供了一个非常智能化的脚本update_blastdb.pl来自动下载所有blast数据库. 脚本使用方法: perl update_blastdb.pl nr 有哪些可供下载的blast…

Login.java //登录界面 package com.tsinghua; import javax.servlet.http.*; import java.io.*; public class Login extends HttpServlet{ public void doGet(HttpServletRequest req, HttpServletResponse res) { //业务逻辑 try{ //中文乱码 //浏览器默认ISO-8859 res.setContentType(…

目录 1.Conda连接不上镜像源问题 2. aspera不能再独立使用 3.使用prefetch搭配aspera 4. prefetch下载方法 记录下下载过程,为自己和后人避坑. 1.Conda连接不上镜像源问题 首先是anaconda安装软件或创建环境时遇到的问题.即使换完清华源和其他镜像源以后依旧报错. CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https://mirrors.tuna.tsi 尝试了很多方法:换源,删除.co…

1. 把 excel 另存为 .csv 格式 2. 用 Notepad 打开 .csv 文件, 第一行就是全部的字段 3. 创建表结构 create table yu_rt_01 as select Transaction_Id,Last_Update_Date,Last_Updated_By,Creation_Date,Created_By,Last_Update_Login,Request_Id,... ,Lcm_Shipment_Line_Id from rcv_transactions…

1.创立数据表…

NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国国家生物技术信息中心)除了维护GenBank核酸序列数据库外,还提供数据分析和检索资源.NCBI资源包括Entrez.Entrez编程组件.MyNCBI.PubMed.PudMed Central.PubReader.Gene.the NCBI Taxonomy Browser.BLAST.Pimer-Blast.COBALT.RefSeq.UniGene.HomoloGene.ProtES…

简介 SRA数据库是美国国立卫生研究院(NIH)的高通量测序数据的主要归档,是国际核苷酸序列数据库协作(INSDC)的一部分,其中包括NCBI序列读取存档(SRA),欧洲生物信息学研究所(EBI)和DNA数据库 日本(DDBJ). 提交给三个组织中的任何一个的数据都是共享的. SRA数据库数据来自高通量测序平台(Roche 454 GSSystem®,Illumina GenomeAnalyzer®,Applied Biosystems SOLiDSystem®,HelicosHeliscope…

[TOC] 前言 在使用Spark Streaming的过程中对于计算产生结果的进行持久化时,我们往往需要操作数据库,去统计或者改变一些值.最近一个实时消费者处理任务,在使用spark streaming进行实时的数据流处理时,我需要将计算好的数据更新到hbase和mysql中,所以本文对spark操作hbase和mysql的内容进行总结,并且对自己踩到的一些坑进行记录. Spark Streaming持久化设计模式 DStreams输出操作 print:打印driver结点上每个Dstream…

iOS 数据库入门 一.数据库简介 1.什么是数据库? 数据库(Database) 是按照数据结构来组织,存储和管理数据的仓库 数据库可以分为2大种类 关系型数据库(主流) PC端 Oracle MySQL SQL Server Access DB2 Sybase 嵌入式/移动客户端 SQLite 对象型数据库 以对象的形式进行存储,使用方便,维护简单,但目前还不成熟 2.iOS中数据存储的方式 Plist (NSArray / NSDictionary) 特点: 只能存储系统自带的数据类型,如…

用过MySQL的应该都会注意到,默认情况下,Linux下安装的MySQL是大小写敏感的,也就是说Table1和table1可以同时存在.而Windows下的MySQL却是大小写不敏感的,所有表名和数据库名都会变成小写. 对于怎么启用或者停用MySQL数据库的大小写敏感,这个网上随便都能找到,就是改改参数lower_case_table_names,然后重启即可. 但是,如果我们的数据库中已经有了多个区分大小写的数据库,现在要改为不区分大小写的,那么就会报错:Table 'databasename…

1NoSQL简述 CAP(Consistency,Availabiity,Partitiontolerance)理论告诉我们,一个分布式系统不可能满足一致性,可用性和分区容错性这三个需求,最多只能同时满足两个.关系型数据库通过把更新操作写到事务型日志里实现了部分耐用性,但带来的是写性能的下降.MongoDB等NoSQL数据库背后蕴涵的哲学是不同的平台应该使用不同类型的数据库,MongoDB通过降低一些特性来达到性能的提高,这在很多大型站点中是可行的.因为MongoDB是非原子性的,所以如果如果应…

由于监听系统短信广播受到权限的限制,所以很多手机可能使用这种方式没法监听广播,从而没办法获取到系统短信,所以又重新开辟一条路. Android监听系统短信数据库内容变化使用场景: 1.监听短信数据库的变化,添加删除修改,变化的时候会回调onChange方法 2.提取刚刚变化的那条短信的内容 备注: 1.这种方式虽然一开始能够监听到数据变化,但是要判断是刚刚接手到的短信,还需要做一些处理,具体看代码 2.这种方式需要从数据库里面去读取刚刚加入的那条短信,所以需要读取数据库权限,会弹出系统的权限申请…

本文探讨了提高MySQL 数据库性能的思路,并从8个方面给出了具体的解决方法. 1.选取最适用的字段属性 MySQL可以很好的支持大数据量的存取,但是一般说来,数据库中的表越小,在它上面执行的查询也就会越快.因此,在创建表的时候,为了获得更好的性能,我们可以将表中字段的宽度设得尽可能小.例如,在定义邮政编码这个字段时,如果将其设置为CHAR(255),显然给数据库增加了不必要的空间,甚至使用VARCHAR这种类型也是多余的,因为CHAR(6)就可以很好的完成任务了.同样的,如果可以的话,我们应该…

什么是数据库的规格化呢,说白了就是为了去除数据库冗余.为了数据库更加容易管理而将大表按照逻辑划分为小表的过程. 什么是数据库的去规格化呢,就是规格化的反面.那么你可能就会问,既然上面说了数据库的规格化,是有好处的,为啥要去规格化呢?这是因为数据库的规格化,导致了一个结果,就是用户在查找数据的时候,可能需要关联多次表,才能将数据查询完整,这就降低了数据的查询速度,性能不是很好,所以有时候,为了性能,我们可以在数据库的规格化上做一些让步.…

本主题介绍如何启用管理模型差异(XAFML),并将设置存储在数据库中.   名词解释: 1.模型:XAF中把所有应用程序的结构都用模型来定义,比如列表,有哪些列,名称是什么,对应的字段名是什么,业务对象有哪些,有哪些验证条件等等. 2.模型差异:XAF中的模型是分层次的,结果是继承过来的,低层定义的模型可以认为是公用信息,就像是基类,在派生类中做了重写.如:win和web和mobile都可以继承自基础设置.不同的语言也是可以继承自英语这个基类,在这个基础上进行翻译. 这些数据通常是在设计时组织出…

原文地址 1. 前言 对于数据库而言,在日常开发中我们主要的关注点有两块,一个是schema的结构设计,另一个就是索引的优化,这两块是影响我们最终系统结构和性能的关键部分,自然也是我们花费精力最多的部分: 本文主要介绍数据库设计中的一般原则和优化手段,包括数据库的一半范式.反范式设计.数据切分.数据路由与合并等等 2. Schema设计的一般性原则 2.1 概述 范式理论是关系型数据库设计的黄金法则,它提供了数据结构化的理论基础,有效地保证了数据的一致性,应该说,关系型数据库就是在范式的基础上才…

python  Django教程  之 模型(数据库).自定义Field.数据表更改.QuerySet API 一.Django 模型(数据库) Django 模型是与数据库相关的,与数据库相关的代码一般写在 models.py 中,Django 支持 sqlite3, MySQL, PostgreSQL等数据库,只需要在settings.py中配置即可,不用更改models.py中的代码,丰富的API极大的方便了使用. 本节的代码:(Django 1.6, Python 2.7 测试环境) 大…

    其实Getting Started当中有着详细的说明,https://docs.efproject.net/en/latest/platforms/aspnetcore/new-db.html.但是有网友问道,就说一下好了. 新建项目,Asp.net core,选择不适用身份验证. 添加项目引用.这里还是使用postgreSql. 在Nuget 控制台中输入命令: Install-Package Npgsql.EntityFrameworkCore.PostgreSQL Install-…

MongoDB作为一个阶层型数据库,在很短的时间里面是不可能被大面积推广使用的, 本文作为一个实验性的课题,探讨一下MongoDB作为网站数据库的可能性. 1.MongoDB作为代替关系型数据库的可能性. 2.MongoDB作为代替文件服务器的可能性. 通过探讨来加强对于MongoDB的认识 环境准备 技术选型 1.由于是验证性质的课题,这里没有使用MVC5/6.如果有人对MVC6有兴趣,可以另开一个课题讨论.这里使用的是传统的WebForm. 2.使用MongoDB最新版本作为数据库 3.Mo…

原文地址:http://blog.jobbole.com/94385/ 简单介绍 存储引擎就是指表的类型.数据库的存储引擎决定了表在计算机中的存储方式.存储引擎的概念是MySQl的特点,而且是一个插入式的存储引擎概念.这 就决定了MySQl数据库中的表可以使用不同的存储方式存储.用户可以根据自己的不同要求,选择不同的存储方式.是否进行事务处理等. 查询方式及内容解析 使用SHOW ENGINES语句可以查看MySQL数据库支持的存储引擎类型.查询方法如下: 1 SHOW ENGINES: SHO…

数据库访问技术 ado.net 将数据库中的数据,提取到内存中,展示给用户看还可以将内存中的数据写入数据库中去 并不是唯一的数据库访问技术,但是它是最底层的数据库访问技术 1.创建数据库,并设置主外键关系 2.创建新的C#项目,创建 数据库连接类 与 数据库操作方法 a.引用数据库 using System.Data.SqlClient;    b.创建数据库连接类:先进行编写连接字符串,在实例化连接类 c.创建数据库操作方法(此处不是实例化类)    d.打开数据库 → 执行操作 → 关闭数据…

先看错误信息: java.sql.SQLException: Before start of result set at com.mysql.jdbc.SQLError.createSQLException(SQLError.java:910) at com.mysql.jdbc.ResultSet.checkRowPos(ResultSet.java:720) at com.mysql.jdbc.ResultSet.getStringInternal(ResultSet.java:5624)…

ado.net数据库访问技术将数据库中的数据,提取到内存中,展示给用户看还可以将内存中的数据写入数据库中去 并不是唯一的数据库访问技术,但是它是最底层的数据库访问技术也就是说是最麻烦但是是最不可缺少的一部分 下面我们来通过代码和注释了解一下数据库用C#增删改查 1.添加数据 using System;using System.Collections.Generic;using System.Linq;using System.Text;using System.Data.SqlClient; n…

  引言: 关于数据库优化,网上有不少资料和方法,但是不少质量参差不齐,有些总结的不够到位,内容冗杂 偶尔发现了这篇文章,总结得很经典,文章流量也很大,所以拿到自己的总结文集中,积累优质文章,提升个人能力,希望对大家今后开发中也有帮助 1.选取最适用的字段属性 MySQL可以很好的支持大数据量的存取,但是一般说来,数据库中的表越小,在它上面执行的查询也就会越快.因此,在创建表的时候,为了获得更好的性能,我们可以将表中字段的宽度设得尽可能小. 例如,在定义邮政编码这个字段时,如果将其设置为CHAR…

上一节主要是一些准备知识,本课还是准备知识,开发微信也可以不使用数据库,但是要想搭建一些查询类应用,就可能使用到数据库操作,所以本节主要涉及到百度BAE上面的数据库表的创建,插入数据,修改数据,删除数据,删除表,以及事务操作. 开发前去bae创建应用,然后添加数据库MySQL,就会自动生成一个数据库名称,是一串字符串. 这里使用mysqli,测试,MySQL差不多. $dbname = "tIXZeAfkXSSgYzKuMwGZ";//百度bae数据库 这就是生成的数据库,要替换成自己…

P6 EPPM手动安装指南(Oracle数据库) P6 EPPM Manual Installation Guide (Oracle Database) 1.      内容... 1 1.1.         Oracle数据库手动配置的概述... 1 1.1.1.            Oracle数据库安装... 2 1.1.1.1.           创建数据库结构甲骨文和加载应用程序数据... 2 1.1.1.1.1.            创建P6 EPPM为Oracle数据库结构…

如上图所示界面,当我们点击保存按钮时将会将表格中的数据保存到数据库中去,与数据库进行一个交互 第一步我们就是要获取到表格中的数据 string pwd = textpwd.Text; //获得第一次输入密码 string agePqd = txtsurepwd.Text; //获得第二次输入的密码 string name = textname.Text; //获得用户输入的名字 int grendID = Change(); //获得用户输入年级 string phone = textphone…

[声明] 欢迎转载,但请保留文章原始出处→_→ 生命壹号:http://www.cnblogs.com/smyhvae/ 文章来源:http://www.cnblogs.com/smyhvae/p/4050825.html [正文] 首先需要回顾一下上一篇文章中的内容:MySQL数据库学习笔记(八)----JDBC入门及简单增删改数据库的操作 一.ResultSet接口的介绍: 对数据库的查询操作,一般需要返回查询结果,在程序中,JDBC为我们提供了ResultSet接口来专门处理查询结果集.…

用 BigDump 工具导入超大 MySQL 数据库备份文件  创建于 2010-07-01, 周四 00:00  作者 白建鹏 在<Joomla! 1.5 网站防黑9条戒律>这篇文章中,我们提到的第一条就是:及时.定期备份你的 Joomla! 网站.我们也多次推荐使用Akeeba Backup (原名 JoomlaPack)这个备份工具.Akeeba Backup 自带的 kickstart.php 工具也能完成备份包的恢复(或者迁移安装).不过,这是针对整站的恢复.假如我们只是要恢复一下数…