本文主要参考博客:http://chengjunwang.com/en/2013/08/learn-basic-epidemic-models-with-python/.该博客有一些笔误,并且有些地方表述不准确,推荐大家阅读Albert-Laszlo Barabasi写得书Network Science,大家可以在如下网站直接阅读传染病模型这一章:http://barabasi.com/networksciencebook/chapter/10#contact-networks.Barabasi…

function spreadingability=sir(A,beta,mu) for i=1:length(A) for N=1:50%随机次数 InitialState=zeros(length(A),1);InitialState(i)=1; time=5;%传播时间 I(N,:)=sire(A,InitialState,beta,mu,time); end spreadingability(i,1)=mean(mean(I));%节点i的传播能力 end end function I=…

最近新型冠状病毒疫情越来越严重了,待在家中没法出去,学习一下经典传染病模型. 这里总结了五个模型,分别是SI模型,SIS模型,SIR模型,SIRS模型,SEIR模型. 这几种模型的特点先介绍一下. 首先定义SEIR: S为易感者 (Susceptible),指未得病者,但缺乏免疫能力,与感染者接触后容易受到感染: E为暴露者 (Exposed),指接触过感染者,但暂无能力传染给其他人的人,对潜伏期长的传染病适用: I为感病者 (Infective),指染上传染病的人,可以传播给 S 类成员,将其…

上篇介绍了隐马尔科夫模型 本文给出关于问题3解决方法,并给出一个例子的python代码 回顾上文,问题3是什么, 下面给出,维比特算法(biterbi) algorithm 下面通过一个具体例子,来说明维比特算法(biterbi) 下面附上该解决该例题的python代码 import numpy as np #you must install the numpy A=np.array([[0.5,0.2,0.3],[0.3,0.5,0.2],[0.2,0.3,0.5]]) B=np.array(…

关于Latent Dirichlet Allocation及Hierarchical LDA模型的必读文章和相关代码 转: http://andyliuxs.iteye.com/blog/1051743 LDA和HLDA: (1)D. M. Blei, et al., "Latent Dirichlet allocation," Journal of Machine Learning Research, vol. 3, pp. 993-1022, 2003. (2)T. L. Grif…

TensorFlow 训练好模型参数的保存和恢复代码,之前就在想模型不应该每次要个结果都要重新训练一遍吧,应该训练一次就可以一直使用吧. TensorFlow 提供了 Saver 类,可以进行保存和恢复.下面是 TensorFlow-Examples 项目中提供的保存和恢复代码. ''' Save and Restore a model using TensorFlow. This example is using the MNIST database of handwritten digits…

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SI模型 import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import smallworld as sw #邻接矩阵 a = sw.a # 感染率 beta = sw.beta #初始患者 origin = sw.origin def si_(a, beta, origin): #总人数 n = a.shape[0] #控制符 judge = 1 #未感染人群 s = np.arange(n) s = np.delete(s, origin)…

/* 头文件:OurGaussmix2.h */ #include "opencv2/core/core.hpp" #include <list> #include"cv.h" using namespace cv;//InputArray 等的定义在cv里面 namespace ourGaussmix { class BackgroundSubtractor: public cv::Algorithm { public: virtual ~Backgr…

MATLAB是matrix&laboratory两个词的组合,意为矩阵工厂(矩阵实验室).是由美国mathworks公司发布的主要面对科学计算.可视化以及交互式程序设计的高科技计算环境.它将数值分析.矩阵计算.科学数据可视化以及非线性动态系统的建模和仿真等诸多强大功能集成在一个易于使用的视窗环境中,为科学研究.工程设计以及必须进行有效数值计算的众多科学领域提供了一种全面的解决方案,并在很大程度上摆脱了传统非交互式程序设计语言(如C.Fortran)的编辑模式,代表了当今国际科学计算软件的先进水平…