目录 1. 优势杂交育种预测 2. GS育种原理与模型算法 岭回归和LASSO回归 贝叶斯方法 GBLUP和RRBLUP 偏最小二乘法 支持向量机/支持向量回归 其他方法 3. 模型预测能力验证 4. 局限性 基于数学建模的杂交种预测的一些假设: 影响因素 5. 展望 1. 优势杂交育种预测 杂交育种:选育优良纯合亲本,再进行亲本配组. 杂种优势与亲本间的遗传差异有关,前人通过遗传标记计算亲本间的遗传距离.但遗传距离和杂种优势的相关性只能在一定程度上定性地评价杂交组合的表现,并不能定量地预测表现…

目录 1. GS概况 2. GS模型 1)直接法 GBLUP 直接法的模型改进 ①单随机效应 ②多随机效应 2)间接法 间接法模型 基于间接法的模型改进 3. GS模型比较 模型比较结论 4.问题及展望 文献来源: 尹立林, 马云龙, 项韬, 朱猛进, 余梅, 李新云, 刘小磊, 赵书红. 全基因组选择模型研究进展及展望[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(2): 233-242. 华中农大赵书红老师于2019年发表在< 畜牧兽医学报>上的综述,主要针对动物. 1. GS概况 2009年…

全基因组选择(Genomic selection, GS)是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估计准确性等加快遗传进展,尤其对低遗传力.难测定的复杂性状具有较好的预测效果,真正实现了基因组技术指导育种实践. 原理 常规育种手段主要利用性状记录值.基于系谱计算的个体间亲缘关系,通过最佳线性无偏估计(best linear unbiased predication…

目录 1. 前言 2. BLUP方法 ABLUP GBLUP ssGBLUP RRBLUP 3. 贝叶斯方法 BayesA BayesB BayesC/Cπ/Dπ Bayesian Lasso 4. 机器学习 支持向量机 集成学习 深度学习 5. 其他模型 RKHS GWAS-assisted GS 非加性效应 多变量模型 多组学 6. 小结 参考资料 1. 前言 在介绍GS模型之前,我们有必要先来了解一下混合线性模型(Mixed Linear Model,MLM).混合线性模型是一种方差分量模…

目录 1. 免费开源包/库 1.1 R包 1.2 Python库 2. 成熟软件 3. WEB/GUI工具 前面我们已经介绍了基因组选择的各类模型,今天主要来了解一下做GS有哪些可用的软件和工具.基因组选择处在热门研究阶段,每年都有不少新工具开发出来,可分析的软件非常之多,为了便于大家更加清晰地了解,这里我将它们分为免费开源包/库.成熟软件.WEB/GUI工具三类,用户使用难度依次降低. 1. 免费开源包/库 R和Python语言作为开源软件的代表,在数据分析领域有着不可替代的优势.近几年大部分…

目录 1. 理论 2. 实操 2.1 rrBLUP包简介 2.2 实操 3. 补充说明 关于模型 关于交叉验证 参考资料 1. 理论 rrBLUP是基因组选择最常用的模型之一,也是间接法模型的代表.回顾一下,所谓间接法是指:在参考群中估计标记效应,再结合预测群的基因型信息将标记效应累加,最终获得预测群的个体估计育种值.而直接法则是指:将个体作为随机效应,参考群体和预测群体遗传信息构建的亲缘关系矩阵作为方差协方差矩阵,通过迭代法估计方差组分,进而求解混合模型获取待预测个体的估计育种值.简言之,直接…

目录 什么是基因组选择? 基因组选择技术的发展 基因组选择的原理和流程 基因组选择的模型 基因组选择的展望 参考资料 什么是基因组选择? 基因组选择(Genomic Selection,简称GS)这一概念由挪威生命科学大学的Theo Meuwissen 教授于2001年提出.它是一种利用覆盖全基因组的高密度分子标记进行选择育种的新方法,可通过构建预测模型,根据基因组估计育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)进行早期个体的预测和选择,从而缩短世代间隔…

近年来,Micro LED因其功耗低.响应快.寿命长.光效率高等特点,被视为继LCD.OLED之后的新一代显示面板技术.Micro LED的英文全名是Micro Light Emitting Diode,中文称作微发光二极体,也可以写作μLED,是将传统LED薄膜化.微小化和矩阵化,使像素点距离从毫米级降低至微米级别,并在一个芯片上高度集成的固体自发光显示技术[1].其与常规LED最大的不同在于尺寸,大小相当于人头发丝的1/10,体积达到了主流LED大小的1%,然而像素尺寸当前还未形成统一的定义…

目录 1. GS/GP在植物育种中的角色 2. GP模型应用 3. GP模型的准确性 4. 植物育种的GS展望 5. 小结 Genomic SelectioninPlant Breeding: Methods,Models,and Perspectives 国际玉米小麦改良中心(CIMMYT)José Crossa 2017年发表在<Trends in Plant Science>上的综述. 1. GS/GP在植物育种中的角色 过去的植物育种主要借助分子标记辅助选择法(MAS)来进行表型选择(…

目录 1. 简介 2. BLUP类模型 3. Bayesian类模型 4. 机器学习 5. GWAS辅助的GS 6. 杂交育种 7. 多性状 8. 长期选择 9. 预测准确性评估 10. GS到植物育种 11. 未来展望 2020年10月张志武老师联合多家单位的大佬撰写的植物GS育种的最新进展,目前还只是预印版(改到第二版).这篇综述涉及到GS在植物领域应用的最新进展,长达48页.不同于其他的综述描写空洞宽泛,这一篇特别对模型方法进行了介绍,正好解决了我的需求.缺点就是可能重点说明了他们自己开发…

中国农业大学等多家单位2017年合作发表在<遗传>杂志上的综述,笔记之. 作者中还有李宁院士,不胜唏嘘. 1.概述 GS的两大难题:基因组分型的成本,基因组育种值(genomic estimted breeding value, GEBV)的准确性. 基于个体的基因组估计育种值GEBV比传统基于系谱的估计育种值(estimted breeding value, EBV)准确性更高. GS实施示意图: 基于单点SNP标记的GEBV估计方法 一类基于估计等位基因效应来计算GEBV: ①最小二乘法…

目录 说明 1.前言 2.植物GS瓶颈 3.提高GS预测的准确性 4.GS与现代育种技术结合 5.GS开源育种网络 说明 Enhancing Genetic Gain through Genomic Selection: From Livestock to Plants 这篇是徐云碧老师2019年发表在<Plant Communications>上的综述.徐老师是农科院作科所以及CIMMYT的分子育种专家,著有<分子数量遗传学>和<分子植物育种>,提出环境型.遗传增益等…

目录 1.GS研究 2.数量遗传发展 GS应用主要在国外大型动物和种企,国内仍以学术为主.近期整理相关学术文献,了解到一些相关研究人员,记录下备忘查询,但不可能全面. 1.GS研究 Theo Meuwissen(挪威生命科学大学) GS概念提出者,号称"基因组选择之父",贝叶斯方法为主,但是做动物的,所以可略过. https://www.researchgate.net/scientific-contributions/Theo-H-E-Meuwissen-2120554457 Ign…

--新华龙电子为韩国WIZnet公司网络芯片授权代理商,具有20多年的专业团队IC应用开发实力-- 如今不管是在企业还是小区.街道,甚至是居民室内,以太网接口无处不在.有鉴于此,电子设备必将向更加智能的网络化方向发展.作为潜心研发全硬件TCP/IP技术长达10余年的WIZnet,在即将迎来更广阔市场前景的物联网领域有何差异化竞争优势?WIZnet公司陈海峰博士在电子发烧友论坛上,全面解答WIZnet所独有的全硬件TCP/IP协议栈技术. 基于WIZnet所独有的全硬件TCP/IP协议栈技术,着眼…

前言 有关IM(InstantMessaging)聊天应用(如:微信,QQ).消息推送技术(如:现今移动端APP标配的消息推送模块)等即时通讯应用场景下,大多数都是桌面应用程序或者native应用较为流行,而网上关于原生IM(相关文章请参见:<IM架构篇>.<IM综合资料>.<IM/推送的通信格式.协议篇>.<IM心跳保活篇>.<IM安全篇>.<实时音视频开发>).消息推送应用(参见:<推送技术好文>)的通信原理介绍也较多…

昨天刚发布的小米3用的是OGS全贴合屏幕技术,包括魅族MX3也是同样的技术,但是iPhone5是In-Cell屏幕技术,什么才是全贴合?它们之间到底有何区别?哪个好?小编今天就来普及一下全贴合屏幕技术的知识,包括In-Cell.On-Cell以及OGS. 什么是全贴合? 智 能手机的竞争变得越来越激烈,许多厂商都希望通过硬件的差异化来凸显自己,什么IPS.SLCD.视网膜.ClearBlack等新名词不断的出现,很多 时候在我们还未理解新技术的时候新的技术名词又诞生了.最近又有不少手机厂商开始以…

本文框架 什么是热修复? 热修复框架分类 技术原理及特点 Tinker框架解析 各框架对比图 总结   通过阅读本文,你会对热修复技术有更深的认知,本文会列出各类框架的优缺点以及技术原理,文章末尾简单描述一下Tinker的框架结构. 一.什么是热修复? 正常开发流程 热修复开发流程 热修复优势 修复什么? 二.热修复框架分类 现状:百花齐放百家争鸣 简单分类 更合理的分类 三.技术原理及特点 3.1 阿里Dexposed -- native解决方案 原理: 直接在native层进行方法的结构体信…

史上最全的Java高级技术点,全是Java高级进阶技术,几乎包含了Java后端的所有知识点 1…

知识全聚集 .Net Core 技术突破 | 我用C#手把手教你玩微信自动化一 教程 01 | 模块化方案一 02 | 模块化方案二 03 | 简单说说工作单元 其他教程预览 分库分表项目实战教程 Git地址: https://github.com/MrChuJiu/EasyLogger 01 | 前言 02 | 简单的分库分表设计 03 | 控制反转搭配简单业务 04 | 强化设计方案 05 | 完善业务自动创建数据库 06 | 最终篇-通过AOP自动连接数据库-完成日志业务 介绍 本文主要讲…

知识全聚集 .Net Core 技术突破 | 简单说说工作单元 教程 01 | 模块化方案一 02 | 模块化方案二 其他教程预览 分库分表项目实战教程 Git地址: https://github.com/MrChuJiu/EasyLogger 01 | 前言 02 | 简单的分库分表设计 03 | 控制反转搭配简单业务 04 | 强化设计方案 05 | 完善业务自动创建数据库 06 | 最终篇-通过AOP自动连接数据库-完成日志业务 从10.1到现在都太忙了,好久没更新文章了,也主要因为 工作…

HMS Core 6.0已于7月15日全球上线,本次版本向广大开发者开放了众多全新能力与技术.其中HMS Core Network Kit开放了全链路网络加速技术,助力开发者为用户提供低时延的畅快网络体验. 插入封面图 Network Kit是HMS Core面向开发者开放的一款网络基础服务套件,为开发者提供简单易用.低时延.高吞吐和高安全的端云传输通道.本次Network Kit开放的全链路网络加速技术,能够根据用户的网络状况,提供差异化的参数调优,减少使用过程中的无效等待.全链路网络加速技术…

https://mp.weixin.qq.com/s/I-rNwgXHEtwgdpkWzKtVXw 摘要 新一代增强现实技术需要依赖可视计算理论与方法解决大尺度复杂环境下的场景建模.内容生成.感知交互三个关键科学问题.本文从以上三个方面,介绍了面向增强现实的可视计算技术的主要研究进展.其中,场景建模主要涉及复杂场景定位.重建与建模,包括同时定位与地图构建.场景几何与材质精确重建与数字化.实时高质量动态环境重建等:内容生成主要涉及视觉一致性驱动的高逼真度虚实融合,包括场景渲染参数估计.虚拟物体嵌入…

Atitit 语音识别的技术原理 1.1. 语音识别技术,也被称为自动语音识别Automatic Speech Recognition,(ASR),2 1.2. 模型目前,主流的大词汇量语音识别系统多采用统计模式识别技术2 1.3. 基本方法般来说,语音识别的方法有三种:基于声道模型和语音知识的方法.模板匹配的方法以及利用人工神经网络的方法.2 1.3.1. 模板匹配的方法2 1.4. 一般来说,语音识别的方法有三种:基于声道模型和语音知识的方法.模板匹配的方法以及利用人工神经网络的方法.2 1…

前言 有关IM(InstantMessaging)聊天应用(如:微信,QQ).消息推送技术(如:现今移动端APP标配的消息推送模块)等即时通讯应用场景下,大多数都是桌面应用程序或者native应用较为流行,而网上关于原生IM(相关文章请参见:<IM架构篇>.<IM综合资料>.<IM/推送的通信格式.协议篇>.<IM心跳保活篇>.<IM安全篇>.<实时音视频开发>).消息推送应用(参见:<推送技术好文>)的通信原理介绍也较多…

众所周知,现实世界是一个三维空间,除去时间这一维度,现实世界是由长度.宽度和高度三个维度组成,我们每天就生活在这个三维世界中,而现有的显示设备大多数都只能显示二维信息,并不能带给人真实的三维感觉.为了使显示的物体和场景具有深度感(也就是3D),人们纷纷对3D显示技术展开研究,经历了二十几年的发展,目前已取得了十分丰硕的成果. 裸眼3D显示器被广泛应用于广告.传媒.示范教学.展览展示以及影视等各个不同领域.区别于传统的双目3D显示技术,裸眼3D显示由于拥有其裸眼的独特特性,即不需要观众佩戴眼镜或头…

源:truetype技术和矢量字库的技术原理及实现 广泛汉字矢量字库(HZKSLxxJ)格式             在矢量字库中,每个汉字都是以128   X   128点阵制成矢量数据.每个汉字     的矢量数据都由一指针指向,   指针区在每个汉字字库文件的开头0xBB3E字节.     每个汉字矢量数据指针占6个字节,   其格式为:前4个字节为汉字的矢量数据在     文件中的偏移,   后2个字节为汉字的矢量数据的长度.                 汉字指针在指针区的偏移由公式…

2012 年 6 月,由 IoT-GSI(Global Standards Initiative on Internet of Things)发布的白皮书“ITU-T Y.4000/Y.2060”[1]中明确定义了物联网的概念.从技术标准化的角度来讲,物联网可以看作是信息社会中,基于现有或将来产生的信息通讯技术,对物体进行互联(物理或虚拟)的全球基础设施. 物联网融合了现有和将有的信息通信技术.数据处理技术,这些技术包括但不限于机器到机器的通信.自主网络.数据的挖掘和决策.安全和隐私保护.云计算…

为了更好的理解AOP实践和体现AOP的优势.我们始终将OOP和AOP的比較贯穿到下文中.并在终于总结出AOP与OOP相比所拥有的长处,AOP的缺点以及AOP一般的使用场景. 1.1 问题空间到解空间的映射 在比較研究OOP和AOP实践之前.先让解决从理论上OOP和AOP解决这个问题的区别,也就是它们各自从问题空间到解空间的不同映射关系. 1.1.1"问题空间"和"解空间"的定义 在不同的文献中对其定义有着细微的区别,本文对其定义的例如以下:        问题空间(…

之前一直在忙于通用跨链公链PalletOne的研发,没有怎么做技术分享的博客,最近PalletOne主网上线也有几个月的时间了,即将进行PTN(PalletOne上面的主Token)从ERC20到主网的转网工作.在转网进行时,正好将这其中的技术原理与大家分享. 一.Token转网的方式 因为ERC20同质化通证标准的流行,大量区块链项目都是通过先在以太坊上以ERC20的形式发行Token,进行募资.糖果发放.Token买卖等,等到自己的主链研发完成,就会将ERC20上的Token销毁或者冻结,而…

阿里Dexposed -- native解决方案 原理: 直接在native层进行方法的结构体信息对换,从而实现完美的方法新旧替换,从而实现热修复功能   他的思想完全来源于Xposed框架,完美诠释了AOP编程,这里用到最核心的知识点就是在native层获取到指定方法的结构体,然后改变他的nativeFunc字段值,而这个值就是可以指定这个方法对应的native函数指针,所以先从Java层跳到native层,改变指定方法的nativeFunc值,然后在改变之后的函数中调用Java层的回调即可.…