P值是论文中最常用的一个统计学指标,可是其误用.解释错误的现象却很常见.因此,很有必要说明p值的意义.用法及常见错误.   P值指的是比较的两者的差别是由机遇所致的可能性大小.P值越小,越有理由认为对比事物间存在差异.例如,P<0.05,就是说结果显示的差别是由机遇所致的可能性不足5%,或者说,别人在同样的条件下重复同样的研究,得出相反结论的可能性不足5%.P>0.05称“不显著”:P<=0.05称“显著”,P<=0.01称“非常显著”.   由于常用“显著”来表示P值大小,所…

郑冰刚提到P值,说P值的定义(着重号是笔者加的,英文是从WikiPedia摘来的): P值就是当原假设为真时,比所得到的样本观察结果更极端的结果出现的概率. The P-value is the probability of obtaining a result at least as extreme as the one that was actually observed, given that the null hypothesis is true. 以下延续白话系列,解释一下,“什么是P…

在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意思是取log2,这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距. Let's say there are 50 read counts in control and 100 read counts in treatment for gene A. This means gene A is…

火山图 Volcano plot 在统计学上,火山图是一种类型的散点图,被用于在大数据中快速鉴定变化.由于它的形成像火山喷发的样子,所以被称为火山图.和上文讲的曼哈顿图类似.   火山图基本元素 火山图也有很多种样式,在生物学高通量测序结果中,常见有的X和Y轴分别为aboundance 和 fold-change,或p-value和fold-change两种样式.如上图中为p-value versus fold-change的样式,,先此为例进行图中基本元素解读: - X轴:通常为两组基因表达或…

laviewpbt  2014.8.4 编辑 Email:laviewpbt@sina.com   QQ:33184777 最近闲来蛋痛,看了一些显著性检测的文章,只是简单的看看,并没有深入的研究,以下将研究的一些收获和经验共享. 先从最简单的最容易实现的算法说起吧: 1. LC算法 参考论文:Visual Attention Detection in Video Sequences Using Spatiotemporal Cues. Yun Zhai and Mubarak Shah.  P…

写在前面 最近在读<JavaScript启示录>,这本书不是JavaScript的详尽的参考指南,但是把对象作为了解JavaScript的透镜,受益匪浅. 那么我们先来聊一下JavaScript的原始值(值类型)以及复杂值(引用类型),以及他们在内存空间中的存储,关于他们你可能不清楚的一些事: 我们先通过一个经典的面试题类型(并不是原题,我即兴发挥)引出我们今天的主题: 我们已经看出他们的差别,在图一:我们让b = a,改变b的值,发现a并没有改变.在图二:我们让d = c,通过d.name改…

四种简单的图像显著性区域特征提取方法-----> AC/HC/LC/FT. 分类: 图像处理 2014-08-03 12:40 4088人阅读 评论(4) 收藏 举报 salient region detec显著性检测 laviewpbt  2014.8.3 编辑 Email:laviewpbt@sina.com   QQ:33184777 最近闲来蛋痛,看了一些显著性检测的文章,只是简单的看看,并没有深入的研究,以下将研究的一些收获和经验共享. 先从最简单的最容易实现的算法说起吧: 1. LC…

React 使用虚拟 DOM 将计算好之后的更新发送到真实的 DOM 树上,减少了频繁操作真实 DOM 的时间消耗,但将成本转移到了 JavaScript 中,因为要计算新旧 DOM 树的差异嘛.所以这个计算差异的算法是否高效,就很关键了.React 中其计算差异的过程叫 Reconciliation,可理解成调和前后两次渲染的差异. 正式讨论前,先来看个问题. 问题 假设我们有一个展示百分比的柱状条组件,其宽度由是传入的数值决定.并且它带动画,如果传入的值变化,那么柱状条应该由 0 动画到需要…

http://developer.51cto.com/art/200906/126199.htm 差异一:变量作用域的不同 如下面这段程序代码是符合C++语言的语法要求的.其可以在C语言下正常运行.但是其在Java语言平台下编译的时候,就会被告知有错误.其格式.关键字上面都没有错误.那么错误到底是这么呢?这就关系到变量的作用域. { float y=3.15 { float y=3.15 } } 作用域就决定了其定义的变量名的可见性与生命周期.在C++语言(包括其衍生出来的其他语言)与Java语…

C#与Java的语法差异C与Java的语法差异前言程序结构基本语法数据类型字符串变量与常量运算符判断语句循环语句访问权限方法数组结构枚举类继承多态运算符重载接口命名空间预处理器指令正则表达式异常IO泛型集合属性索引器委托事件匿名方法前言本文主要供有Java基础的读者快速掌握C#基本语法使用,重点落在C#的语法上. 程序结构C#中使用using关键字引用命名空间(namespace),作用和Java中使用import导入包中的类基本相同,都是为了避免命名冲突. C#中文件名和类名可以不相同,但Ja…