文献名:Multi-batch TMT reveals false positives, batch effects and missing values (多批次TMT定量方法中对假阳性率,批次效应,以及缺失值的研究) 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics DOI:10.1074/mcp.RA119.001472 Online:https://www.mcponline.org/content/early/2019/07/22/mcp.RA119.001472…

Recall(召回率);Precision(准确率);F1-Meature(综合评价指标);在信息检索(如搜索引擎).自然语言处理和检测分类中经常会使用这些参数. Precision:被检测出来的信息当中正确的或者相关的(也就是你想要的)信息中所占的比例(TP占预测总正样本的比例): Recall:所有正确的信息或者相关的信息(wanted)被检测出来的比例(TP占真实总正样本数的比例).     表格中的翻译比较重要,可以帮助理解. true positives (纳真)          …

刚读完一篇paper<Solving the “false positives” problem in fraud prediction>,趁热打铁,做个笔记. 文章下载链接:https://arxiv.org/pdf/1710.07709.pdf 概述 这篇文章是对 bank transaction fraud prediction 场景下的机器学习算法做了优化,优化方法是,使用 Deep Feature Synthesis 自动生成大量的特征,优化后 False Positive Rate…

这篇经典论文,甚至可以说是2015年最牛的一篇论文,早就有很多人解读,不需要自己着摸,但是看了论文原文Batch normalization: Accelerating deep network training by reducing internal covariate shift 和下面的这些解读之后,还有感觉有些不明白.比如, 是怎么推导出来的,我怎么就是没搞懂呢? 1.论文翻译:论文笔记-Batch Normalization 2.博客专家 黄锦池 的解读:深度学习(二十九)Batch…

转自:http://blog.csdn.net/t710smgtwoshima/article/details/8215037   Recall(召回率);Precision(准确率);F1-Meature(综合评价指标);       在信息检索(如搜索引擎).自然语言处理和检测分类中经常会使用这些参数,介于语言翻译上的原因理解难免出现误差,下面介绍下自己对他们的理解.   首先来个定义: Precision:被检测出来的信息当中 正确的或者相关的(也就是你想要的)信息中所占的比例: Reca…

前言 整个章节由浅入深了解Spring Batch,让你掌握批处理利器.面对大批量数据毫无惧色.本章只做介绍,后面章节有代码示例.好了,接下来是我们的主角Spring Batch. 1.1 背景介绍 1.1.1 诞生 开源社区一直把大部分注意力集中在web和SOA框架中,基于java的批处理框架确很少,因此一个标准的.可重用的批处理框架对我们来说很重要.先来说一下什么是批处理?在企业应用时,需要定期或者人工触发的读入大批量数据,然后完成相应的业务处理并进行归档.这类工作就成为批处理. Sprin…

True Positive (真正, TP)被模型预测为正的正样本: True Negative(真负 , TN)被模型预测为负的负样本 : False Positive (假正, FP)被模型预测为正的负样本: False Negative(假负 , FN)被模型预测为负的正样本: True Positive Rate(真正率 , TPR)或灵敏度(sensitivity)     TPR = TP /(TP + FN)     正样本预测结果数 / 正样本实际数 True Negative…

True Positive (真正, TP)被模型预测为正的正样本: True Negative(真负 , TN)被模型预测为负的负样本 : False Positive (假正, FP)被模型预测为正的负样本: False Negative(假负 , FN)被模型预测为负的正样本: True Positive Rate(真正率 , TPR)或灵敏度(sensitivity)    TPR = TP /(TP + FN)    正样本预测结果数 / 正样本实际数 True Negative Ra…

文献名:Untargeted lipidomics reveals specific lipid abnormality in nonfunctioning human pituitary adenomas(非靶向脂质组学揭示非功能人类脑垂体瘤中的特异性脂质) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2020年1月) IF:3.78 单位:中国科学院大连物理化学研究所 技术:非靶向脂质组学 一. 概述: 无功能垂体腺瘤(functionless pituit…

文献名:Proteomic Profiling of Paired Interstitial Fluids Reveals Dysregulated Pathways and Salivary NID1 as a Biomarker of Oral Cavity Squamous Cell Carcinoma(口腔癌配对肿瘤组织液的蛋白质组学分析揭示了通路失调和唾液中NID1作为口腔腔鳞状细胞癌的生物标志物) 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2…

发表时间:2019年4月 IF:5.232 一. 概述: 分支杆菌索状因子TDM(trehalose-6,6’-dimycolate)能够与巨噬细胞C-型凝集素受体(CLR)MINCLE结合引起下游通路变化.本文对TDM处理的巨噬细胞磷酸化蛋白质组进行定量分析,发现了依赖于MINCLE的信号通路和MINCLE非依赖的信号通路,两种信号通路具有不同的生物功能. 二. 研究背景:(简要介绍研究进展动态.研究目的和意义) 巨噬细胞对分支杆菌的识别依赖于TLR.CLR以及分支杆菌核酸.TDM是细胞壁主要…

期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年12月) IF:4.828 单位:1德国海德堡大学附属医院2德国汉诺威医科大学3德国亥姆霍茲感染研究中心4德国马克斯·普朗克生化研究所5瑞典于默奥大学6葡萄牙波尔图大学7德国&柏林健康研究所 8法国里昂大学 物种:人 技术:非标定量蛋白质组学,免疫共沉淀,病毒化验 一. 概述: 该研究使用免疫共沉淀-非标定量蛋白质组学的方法发现了高尔基转运相关蛋白GBF1与乌库涅米病毒(UUKV)的感染有关.通过…

Redis事物 Redis命令实现事务 Redis的事物包含在multi和exec(执行)或者discard(回滚)命令中 和sql事务不同的是,Redis调用Exec只是将所有的命令变成一个单元一起执行,期间不会插入其他的命令. 这种方式不保证事务的一致性,即使中间有一条命令出错了,其他命令仍然可以正常执行,并且无法回滚 下面的例子演示了一个基本的事务操作 127.0.0.1:6379> multi OK 127.0.0.1:6379> set name mike QUEUED 127.0.…

为什么要做batch处理        这个问题我就不解释了,因为我想你们肯定能比我解释的更好!如果你真的不知道,那就到Google上去搜索一下吧☻Oracle回滚段    这个问题偶也不很明白,只是大概有个了解,如果你是这方面的专家,或者对这方面有比较深的理解,别忘了跟偶分享哦☻在JDBC中如何做batch处理    JDBC提供了数据库batch处理的能力,在数据大批量操作(新增.删除等)的情况下可以大幅度提升系统的性能.我以前接触的一个项目,在没有采用batch处理时,删除5万条数据大概要…

Redis大幅性能提升之Batch批量读写 提示:本文针对的是StackExchange.Redis 一.问题呈现 前段时间在开发的时候,遇到了redis批量读的问题,由于在StackExchange.Redis里面我确实没有找到PipeLine命令,找到的是Batch命令,因此对其用法进行了探究一下. 下面的代码是我之前写的: public List<StudentEntity> Get(List<int> ids) { List<StudentEntity> res…

学卷积神经网络的理论的时候,我觉得自己看懂了,可是到了用代码来搭建一个卷积神经网络时,我发现自己有太多模糊的地方.这次还是基于MINIST数据集搭建一个卷积神经网络,首先给出一个基本的模型,然后再用Batch Norm.Dropout和早停对模型进行优化:在此过程中说明我在调试代码过程中遇到的一些问题和解决方法. 一.搭建基本的卷积神经网络 第一步:准备数据 在<Hands on Machine Learning with Scikit-Learn and TensorFlow>这本书上,用的…

内容来自<Spring Batch 批处理框架>,作者:刘相.我只是个搬运工. 一.Spring Batch提供了独立的标签用来顶一个Job配置,分别是job.step.tasklet.chunk等.共有6个外层标签使用,如下: <batch:job id=""></batch:job><batch:flow id=""></batch:flow> <batch:job-listener><…

1.tf.train.batch(image, batch_size=batch_size, num_threads=1) # 获取一个batch的数据 参数说明:image表示输入图片,batch_size表示一个batch的大小,num_threads表示使用几个线程进行执行 import tensorflow as tf import numpy as np def generate_data(): num = 25 label = np.asarray(range(0, num)) im…

tensorflow数据读取机制 tensorflow中为了充分利用GPU,减少GPU等待数据的空闲时间,使用了两个线程分别执行数据读入和数据计算. 具体来说就是使用一个线程源源不断的将硬盘中的图片数据读入到一个内存队列中,另一个线程负责计算任务,所需数据直接从内存队列中获取. tf在内存队列之前,还设立了一个文件名队列,文件名队列存放的是参与训练的文件名,要训练 N个epoch,则文件名队列中就含有N个批次的所有文件名. 示例图如下: 图片来至于 https://zhuanlan.zhihu.…

事务模型描述 1.step之间事务独立 2.step划分成多个chunk执行,chunk事务彼此独立,互不影响:chunk开始开启一个事务,正常结束提交.chunk表示给定数量的item的操作集合,主要属性commit-interval,表示数量达到多少条提交一次.      图-job总体事务   图-step内部事务   3.chunk定义:默认设置commitInterval=N,即读取N条数据为一个chunk(采用默认SimpleCompletionPolicy),或者reader里面所…

Spring batch是用来处理大量数据操作的一个框架,主要用来读取大量数据,然后进行一定处理后输出成指定的形式. Spring batch主要有以下部分组成: JobRepository     用来注册job的容器 JobLauncher             用来启动Job的接口 Job                          实际执行的任务,包含一个或多个Step Step                        step包含ItemReader.ItemProces…

tensorflow数据读取机制 tensorflow中为了充分利用GPU,减少GPU等待数据的空闲时间,使用了两个线程分别执行数据读入和数据计算. 具体来说就是使用一个线程源源不断的将硬盘中的图片数据读入到一个内存队列中,另一个线程负责计算任务,所需数据直接从内存队列中获取. tf在内存队列之前,还设立了一个文件名队列,文件名队列存放的是参与训练的文件名,要训练 N个epoch,则文件名队列中就含有N个批次的所有文件名. 示例图如下: 图片来至于 https://zhuanlan.zhihu.…

使用tf.nn.batch_normalization函数实现Batch Normalization操作 觉得有用的话,欢迎一起讨论相互学习~Follow Me 参考文献 吴恩达deeplearningai课程 课程笔记 Udacity课程 """ 大多数情况下,您将能够使用高级功能,但有时您可能想要在较低的级别工作.例如,如果您想要实现一个新特性-一些新的内容,那么TensorFlow还没有包括它的高级实现, 比如LSTM中的批处理规范化--那么您可能需要知道一些事情. 这…

Spring Batch是一个基于Spring的企业级批处理框架,它通过配合定时器Quartz来轻易实现大批量的数据读取或插入,并且全程自动化,无需人员管理. 在使用spring batch之前,得对spring batch的流程有一个基本了解 每个batch它都包含了一个job,而一个job中却有可能包含多个step,整个batch中干活的是step,batch主要是用来对数据的操作,所以step就有三个操作数据的东西,一个是ItemReader用来读取数据的,一个是ItemProcessor…

距离开始使用 Spring Batch 有一段时间了,一直没有时间整理,现在项目即将完结,整理下这段时间学习和使用经历. 官网地址:http://projects.spring.io/spring-batch/ 一.定义与特点 A lightweight, comprehensive batch framework designed to enable the development of robust batch applications vital for the daily operati…

第四章 配置作业Job 4.1 基本配置 Job的配置有3个必须的属性.name,jobRepository,steps.一个简单的Job配置例如以下: <job id="footballJob"> <step id="playerload" parent="s1" next="gameLoad"/> <step id="gameLoad" parent="s2&qu…

引言 Spring Batch是处理大量数据操作的一个框架,主要用来读取大量数据,然后进行一定的处理后输出指定的形式.比如我们可以将csv文件中的数据(数据量几百万甚至几千万都是没问题的)批处理插入保存到数据库中,就可以使用该框架,但是不管是数据资料还是网上资料,我看到很少有这样的详细讲解.所以本片博文的主要目的边讲解的同时边实战(其中的代码都是经过实践的).同样地先从Spring Boot对Batch框架的支持说起,最后一步一步进行代码实践! 一.Spring Boot对Batch框架的支持…

Spring Batch(4): Job详解 2016-03-26 18:46 870人阅读 评论(1) 收藏 举报  分类: Spring(6)  版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载.   目录(?)[+]   第四章 配置作业Job 4.1 基本配置 Job的配置有3个必须的属性,name,jobRepository,steps.一个简单的Job配置如下: <job id="footballJob"> <step id="playerlo…

spring batch(二):核心部分(1):配置Spring batch 博客分类: Spring 经验 java   chapter 3.Batch configuration 1.spring batch 的命名空间 spring xml中指定batch的前缀作为命名空间. 示例: <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <beans xmlns="http://www.springframe…

原文地址: https://blog.csdn.net/dcrmg/article/details/79776876 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ tensorflow数据读取机制 tensorflow中为了充分利用GPU,减少GPU等待数据的空闲时间,使用了两个线程分别执行数据读入和数据计算. 具…