乙醇脱氢酶力场文件的处理（含ZN，NAD，乙醇）

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乙醇脱氢酶力场文件的处理（含ZN，NAD，乙醇）

很多蛋白质在行驶生物催化反应(如ATP水解,氨基酸的乙酰化,CoA的去乙酰化,甲基化等等)都需要金属离子(Mg,Zn,Ca等等)的参与,换句话说,金属离子对蛋白功能是必须的.模拟金属酶体系,现在也是分子动力学中的热点及难点,尤其现在结合量子力学与分子力学的方法(QM/MM)更是前言.以Amber为例 1.金属的参数文件(在amber中不包括): (1)Ca离子的 0 0 2 Calsium IonCALCAL INT 1CORR OMIT DU BEG0.0000001 DUMM DU M 0…

html5拖拽事件 xhr2 实现文件上传含进度条

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在linux下将当前目录文件全部小写含目录名

ls | sed -n '/[A-Z]/s/.*/mv & \L&/e' 公司以前用的windows server 服务器文件大小写都一样. 新迁移到centos 服务器上,发现有些上传图片是大写的扩展名. <?php $path=$_SERVER['DOCUMENT_ROOT'].'/uploadfile';//要查找的目录 echo $path; //var_dump(opendir($path)); //测试系统是否有权限执行 //die('end'); if($hand…

C#操作EML邮件文件实例（含HTML格式化邮件正文和附件）

使用QQ邮箱.163邮箱等导出的EML邮件,包含了邮件的发件人.主题.内容.附件等所有信息,该实例就如何解析这些信息,并在编辑后保存做个Demo. 如下图所示,EML文件是编码后的文本文件,可以使用正则表达式识别其中的关键字,例如Received.Sender.Cc.Bcc.From等. 但解析后的内容是经过编码后的,例如Sender的内容X-QQ-FEAT……,这个时候需要对内容进行解码,一般使用Base64进行编码. EML源文件包含了很多信息,除了使用邮箱客户端看到的收件人.发件人.主题.…

Gromacs文件-Chapter1

Gromacs的文件非常的多,这是官方文档地址:http://manual.gromacs.org/online/files.html. 本文章部分内容来自以下网址https://zhuanlan.zhihu.com/p/27279508 下面我仅做一简述,涉及到PDB,GRO,MDP的文件内部结构不在此介绍,而是单独开篇. 参数文件: mdp:其他篇单独讲解 m2p:暂时没用到结构文件: gro:GROmacs format g96:gromacs-96 format pdb:Protein…

[译]：Orchard入门——媒体文件的添加与管理

原文链接:Adding and Managing Media Content 注:此文内容相对较老,实际操作指导性不强,仅适合做研究当你利用富文本编辑器上传图片时(或者使用XML-RPC客户端,例如 Open Live Writer--官网给出的为Windows Live Writer,且链接已失效),图片将保存在Orchard网站的根目录下的 Media 文件夹. Media 文件夹必须为可写的(针对网站托管的用户进程),这样才能保证图片可以成功上传. 如果你使用 Web Platform…

Linux 文件与目录管理

Linux 文件与目录管理我们知道Linux的目录结构为树状结构,最顶级的目录为根目录 /. 其他目录通过挂载可以将它们添加到树中,通过解除挂载可以移除它们. 在开始本教程前我们需要先知道什么是绝对路径与相对路径. 绝对路径:路径的写法,由根目录 / 写起,例如: /usr/share/doc 这个目录. 相对路径:路径的写法,不是由 / 写起,例如由 /usr/share/doc 要到 /usr/share/man 底下时,可以写成: cd ../man 这就是相对路径的写法啦! 处理目录的…

Java学习-042-获取目录文件列表（当前，级联）

以下三个场景,在我们日常的测试开发中经常遇到: 软件自动化测试,在进行参数测试时,我们通常将所有相似功能的参数文件统一放在一个目录中,在自动化程序启动的时候,获取资源参数文件夹中所有参数文件,然后解析实现参数化: 自动化测试脚本,每个测试用例类运行时,在 beforeClass(通常选这个) 或 beforeTest 前获取对应目录的参数化文件获取某个目录下所有的文件列表(含子目录文件,例如 TestNG生成的测试报告,或者 target/site 工程信息目录),将其拷贝至对应的web服务器…

Linux文件描述符与打开文件之间的区别（转载）

转载请说明出处:http://blog.csdn.net/cywosp/article/details/38965239 1. 概述在Linux系统中一切皆可以看成是文件,文件又可分为:普通文件.目录文件.链接文件和设备文件.文件描述符(file descriptor)是内核为了高效管理已被打开的文件所创建的索引,其是一个非负整数(通常是小整数),用于指代被打开的文件,所有执行I/O操作的系统调用都通过文件描述符.程序刚刚启动的时候,0是标准输入,1是标准输出,2是标准错误.如果此…

linux文件描述符--转载

转自:http://blog.csdn.net/cywosp/article/details/38965239 1. 概述在Linux系统中一切皆可以看成是文件,文件又可分为:普通文件.目录文件.链接文件和设备文件.文件描述符(file descriptor)是内核为了高效管理已被打开的文件所创建的索引,其是一个非负整数(通常是小整数),用于指代被打开的文件,所有执行I/O操作的系统调用都通过文件描述符.程序刚刚启动的时候,0是标准输入,1是标准输出,2是标准错误.如果此时去打开一个新…