技术背景 VMD是分子动力学模拟领域常用的一款可视化软件,可以非常直观方便的展示分子的运动过程.而VMD本身对展现的格式有一定的要求,如果不是常见的rst等类型的坐标文件的话,就需要自己手动去实现一个可视化的插件.这里我们介绍的是通过VMD来可视化hdf5格式的坐标文件--hdf5是量子化学领域非常常用的一个数据格式,对于规模较大的数据集有很好的性能支持. 安装hdf5插件 这里本地使用的是Ubuntu20.04的系统,如果是其他系统,有可能需要针对性的修改下.首先我们将这个hdf5插件的源码下…

技术背景 在处理分子动力学模拟的数据时,不可避免的会遇到众多的大轨迹文件.因此以什么样的格式来存储这些庞大的轨迹数据,也是一个在分子动力学模拟软件设计初期就应该妥善考虑的问题.现有的比较常见的方式,大致可以分为存成明文的和存成二进制的两种方式.这两种方式各有优劣,明文存储可读性较好,二进制文件压缩率较好,不会占用太大的空间.又因为我们也不会经常性的去打开轨迹文件一个一个的检索,因此二进制文件是一个更好的存储格式选项.如果不仅仅限于分子动力学模拟的领域,在其他数据领域经常用的格式有npz等.而经过…

最近用caffe做了一下regression问题,先用data layer中的data,float_data试了一下,data用来存放图片,float_data存放regression的values,label存放标签,发现不行,因为float_data和label这俩是指向同一块内存,两者不能共存,除非改caffe源码.我又仔细看了一下caffe的源码,发现我这个地方说的不对,具体来讲,caffe读取image和label是这样一个流程: 1.编写程序将image和label转换成Datum格…

tiff/tfw, jpg/jpgw坐标文件的格式(6个参数) 0.100-0.13999904400510 以上每行对应的含义: 1 地图单元中的一个象素在X方向上的X分辨率尺度. 2 平移量. 3 旋转量. 4 地图单元中的一个象素在Y方向上的Y分辨率尺度的负值. 5 象素1,1(左上方)的X地坐标. 6 象素1,1(左上方)的Y地坐标. 栅格图导入之tfw坐标信息文件 Tfw文件是关于TIFF影像坐标信息的文本文件,ArcInfo.Microstation.AutoCAD等均支持该格式的坐…

gis空间分析案例_坐标文件投影变换地理处理工具 商务科技合作:向日葵,135—4855__4328,xiexiaokui#qq.com 功能: 对文件进行投影变换 特点: 1. 地理处理工具,可以与任何arcgis工具和语言集成 2. 精度高,实测误差小于0.001mm 3. 兼容强,支持所有arcgis坐标系 4. 操作便,直接输入坐标,选择坐标系 5. 效率高,可以批处理文件 6. 功能强,支持任何投影,包括高斯投影,UTM等等. 7. 格式多,支持所有主流格式,例如txt,csv,xls…

转载:java jdk实例宝典 感觉讲的非常好就转载在这保存! java.util.zip包实现了Zip格式相关的类库,使用格式zip格式压缩和解压缩文件的时候,须要导入该包. 使用zipoutputstream能够实现文件压缩,全部写入到zipoutputstream输入流中的数据,都会被ZIP格式压缩. 每一个被压缩的文件或者文件夹在zip文件里都相应一个zipentry对象,每一个zipentry都有一个name属性,表示它相对于zip文件文件夹的相对路径,对于文件夹,路径以“/“结尾,对…

Python生成PASCAL VOC格式的xml标注文件 PASCAL VOC数据集的标注文件是xml格式的.对于py-faster-rcnn,通常以下示例的字段是合适的: <annotation> <folder>GTSDB</folder> <filename>000001.jpg</filename> <size> <width>500</width> <height>375</heig…

Python3 Pandas的DataFrame格式数据写入excle文件.json.html.剪贴板.数据库 一.DataFrame格式数据 Pandas是Python下一个开源数据分析的库,它提供的数据结构DataFrame极大的简化了数据分析过程中一些繁琐操作,DataFrame是一张多维的表,大家可以把它想象成一张Excel表单或者Sql表: import pandas as pd import numpy as np df = pd.DataFrame(np.random.randn(…

[流媒體]H264—MP4格式及在MP4文件中提取H264的SPS.PPS及码流 SkySeraph Apr 1st 2012  Email:skyseraph00@163.com 一.MP4格式基本概念 MP4格式对应标准MPEG-4标准(ISO/IEC14496) 二.MP4封装格式核心概念 1  MP4封装格式对应标准为 ISO/IEC 14496-12(信息技术 视听对象编码的第12部分: ISO 基本媒体文件格式/Information technology Coding of aud…

小程序导入,别人导出的数据库json文件,错误信息如下: 导入数据库失败, Error: Poll error, 导入数据任务(id:373985)异常,错误信息:解析导入文件错误,请检查导入文件内容,仅支持导入json格式数据及excel文件,错误详情如下: JSON decoder out of sync - data changing underfoot? 导入的标准json文件格式如下: [  {    "_id": "W-Fq-Ku9e31Z7K3i", …