MIC:the Maximal Information Coefficient,是用网格分法判断数据的集中程度的一个标准. MIC所依据的理念是,如果2个变量之间存在着一种关系,那么就应该有一种方法在那些变量的散点图上画一个网格,使得大多数的数据点集中在该网格的几个单元格中. 通过搜寻这种“最适合”的网格,计算机可以计算MIC及一族可用来发现并描绘关系的相关的统计数据. 这一族统计数据被称作“最大的基于信息的非参数性探索” 或MINE.…

英文名:Genetic architecture of artemisinin-resistant Plasmodium falciparum 中文名:疟原虫青蒿素抗药性的全基因组关联分析 期刊:Nature Genetics影响因子:29.352一.研究背景以青蒿素为主的联合疗法一直以来都是治疗疟疾的有效方法,值得关注的是横跨亚洲到非洲都出现了对一线药物的抗药性.阻止出现更高水平的抗药性以及阻止抗药性扩散到非洲刻不容缓.为了更好同抗药性进行斗争,了解遗传因素在抗药性的混合和传播中的作用非常重要…

前言 想必大家都听过数据挖掘领域那个经典的故事 - "啤酒与尿布" 的故事. 那么,具体是怎么从海量销售信息中挖掘出啤酒和尿布之间的关系呢? 这就是关联分析所要完成的任务了. 本文将讲解关联分析领域中最为经典的Apriori算法,并给出具体的代码实现. 关联分析领域的一些概念 1. 频繁项集: 数据集中经常出现在一起的物品的集合.例如 "啤酒和尿布" 2. 关联规则: 指两个物品集之间可能存在很强的关系.例如 "{啤酒} -> {尿布}"…

全基因组关联分析流程: 一.准备plink文件 1.准备PED文件 PED文件有六列,六列内容如下: Family ID Individual ID Paternal ID Maternal ID Sex (1=male; 2=female; other=unknown) Phenotype PED文件是空格(空格或制表符)分隔的文件. PED文件长这个样: 2.准备MAP文件 MAP文件有四列,四列内容如下: chromosome (1-22, X, Y or 0 if unplaced) r…

关联分析是一种在大规模数据集中寻找有趣关系的任务,这些关系有两种形式:频繁项集和关联规则.频繁项集是经常出现在一起的物品的集合,关联规则暗示两种物品之间可能存在的很强的关系. 如何寻找数据集中的频繁或关联关系呢?主要是通过支持度和可信度. 一个项集的支持度被定义为数据集中包含该项集的记录所占的比例. 可信度是针对关联规则来定义的,比如规则A->B的可信度为:支持度{A,B} / 支持度{A} 支持度和可信度是用来量化关联分析是否成功的方法. Apriori原理: 要计算某个项集在数据集的支持度,…

前言 最近在看Peter Harrington写的"机器学习实战",这是我的学习心得,这次是第11章 - 使用Apriori算法进行关联分析. 基本概念 关联分析(association analysis)或者关联规则学习(association rule learning) 这是非监督学习的一个特定的目标:发现数据的关联(association)关系.简单的说,就是那些数据(或者数据特征)会一起出现. 关联分析的目标包括两项:发现频繁项集和发现关联规则.首先需要找到频繁项集,然后才能…

 http://blog.csdn.net/vipzjyno1/article/details/25463457    Android启动模式Flags栈Task   目录(?)[+] 什么是栈 栈 定义栈Stack 栈的操作压栈弹栈 Activity中的栈 Task Activity启动模式 Activity栈和Task联系 Intent Flags Activity相关属性taskAffinity      在学习Android的过程中,Intent是我们最常用Android用于进程内或进程…

系列文章:<机器学习实战>学习笔记 最近看了<机器学习实战>中的第11章(使用Apriori算法进行关联分析)和第12章(使用FP-growth算法来高效发现频繁项集).正如章节标题所示,这两章讲了无监督机器学习方法中的关联分析问题.关联分析可以用于回答"哪些商品经常被同时购买?"之类的问题.书中举了一些关联分析的例子: 通过查看哪些商品经常在一起购买,可以帮助商店了解用户的购买行为.这种从数据海洋中抽取的知识可以用于商品定价.市场促销.存活管理等环节. 在美国…

http://blog.csdn.net/vipzjyno1/article/details/25463457    在学习Android的过程中,Intent是我们最常用Android用于进程内或进程间通信的机制,其底层的通信是以Binder机制实现的,在物理层则是通过共享内存的方式实现的.     Intent主要用于2种情景下:(1)发起意图  (2)广播     它的属性有:ComponentName,action,data,category,extras,flags等,通常情况下,进行…

1基本概念 购物篮事务(market basket transaction),如下表,表中每一行对应一个事务,包含唯一标识TID,和购买的商品集合.本文介绍一种成为关联分析(association analysis)的方法,这种方法,可以从下表可以提取出,{尿布}->牛奶. 两个关键问题:1大型数据计算量很大.2发现的某种模式可能是虚假,偶然发生的. 2问题定义 把数据可以转换为如下表的二元表示,非二元不在本文讨论范围 项集 项集的支持度计数: 关联规则: 我们要发现,满足最小支持度与最小置信度…