reference: https://www.biostars.org/p/42126/ fasta.y %{ #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <ctype.h> int yylex(); int yyerror( char* message); %} %error-verbose %token LT OTHER SYMBOL CR %start input %% input: input sequence…

Validate the date format function checkdate(input) { var validformat = /^\d{2}\/\d{2}\/\d{4}$/; //Basic check for format validity var returnval = false; if (!validformat.test(input.value)) alert("Invalid Date Format. Please correct and submit again.&…

[1] bedtools (https://github.com/arq5x/bedtools2) here is also bedtools (https://github.com/arq5x/bedtools2) getfasta. It uses Erik's code under the hood. $ cat test.fa >chr1 AAAAAAAACCCCCCCCCCCCCGCTACTGGGGGGGGGGGGGGGGGG $ cat test.bed chr1 5 10 $ be…

http://aras-p.info/texts/D3D9GPUHacks.html 格式 用法 资源 描述 NVIDIA GeForce AMD Radeon 英特尔 阴影映射 D3DFMT_D16 DS TEX 样本深度缓冲区直接作为阴影贴图 . 2001(GF3) 2006(HD2xxx) 2006(965) D3DFMT_D24X8 DS TEX 2001(GF3) 2006(HD2xxx) 2006(965) 深度缓冲区作为纹理 DF16 DS TEX 读深度缓冲区作为纹理 .   2…

[怪毛匠子 整理] samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步:sort 一下 BAM 文件,得到map.sorted.bam system"samtools sort map.b/am map.sorted"; #第三步:创建一个关于bam的索引文件,我们得到一个map.sorted.b…

参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解BLAST Databases:BLAST FTP Site   如何下载NCBI blast数据库? NCBI提供了一个非常智能化的脚本update_blastdb.pl来自动下载所有blast数据库. 脚本使用方法: perl update_blastdb.pl nr 有哪些可供下载的blast…

Ubuntu安装BLAST 2014-02-09 10:45:03|  分类: Linux/Ubuntu|举报|字号 订阅     下载LOFTER我的照片书  |     very easy! sudo apt-get install blast2 将自动安装以下程序: bl2seq blast2 blastall blastall_old blastcl3 blastclust blastpgp 具体程序参数请在终端输入程序名查看 转自:http://azaleasays.com/2008/…

转载: https://github.com/twbattaglia/RNAseq-workflow Introduction RNAseq is becoming the one of the most prominent methods for measuring celluar responses. Not only does RNAseq have the ability to analyze differences in gene expression between samples,…

samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtmlsamtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集.包含有许多命令.以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是:将sam文件转换成bam文件:然后对bam文件进行各种操作,比如数据的排序(不属于本命令的功能)和提取(这些操作 是对bam文件进行的,因而当输入为sam文件的时候,不能进行该操作):最后将排序或提取得到的数据输出为bam或sam(默认的)…

在网上看到了三道测试开发的笔试题,答案是用Python解的.这段时间正好在学PowerShell,练习一下:) 1. 验证邮箱格式 2. 获取URL的后缀名 3. 获取前一天时间或前一秒 我的解法是: # Check Email format Write-Host "Please input your email address" $email=Read-Host $regular="[a-zA-Z0-9]\@[a-zA-Z0-9]\.[a-zA-Z0-9]" if…