当database是10个物种(A.B.C.E.F.G.H.J.I.K)时,进行all vs all 比对结果是: 此时reference是物种A的第一个基因:即用10个物种的genome中的所有基因比对物种A的基因1 eg:如下 $ cat A_R00001_A.fa.70.blastp.m1|grep '1_0' -A 2 > r.sh Query= A_R00001_A (423 letters) Database: all.10 165,229 sequences; 72,505,122…

catalogue . 引言 . RC522芯片(读卡器)简介 . FM1702SL芯片(读卡器)简介 . RFID M1卡简介 . 读取ID/序列号(arduino uno.MFRC522芯片 Based On MF522-AN模块) . 读取ID/序列号(arduino uno.FM1702SL) . arduino uno.RC522向mifare卡写入数据 0. 引言 需要明白的一点是,一张卡能否hack取决于以下几点 . 卡本身的硬件结构和内部实现: 例如如果一张卡的电路设置了只读逻辑…

软件工程整个学期结束了,很开心学了这门课,在学到知识的同时也提高了自己的动手实践的能力,感觉自己在整个软件工程的各个环节中都能有所把握,可以将学到的知识运用到设计.实践更多的项目中去. M1阶段个人总结 这是之前写的总结的链接:http://www.cnblogs.com/zmpy/p/4117668.html M2阶段个人总结 人员分配与任务调整 由于M1阶段基本所有代码都是我写的,之前软件开发中的所有框架我都已经搭建完善,所以我们团队讨论了一下,决定把M2阶段的任务分配给他们每个人,每周每人…

简单来讲CPU卡比M1卡更加安全.扩展性更好.支持更多应用   CPU卡 M1 操作系统 带有COS系统 无COS系统 硬件加密模块 硬件DES运算模块 无实现算法的硬件加密模块 算法支持 标准DES算法 厂家专用不公开算法 密钥长度 16字节DES 12字节口令 交易安全性 钱包不可被非法访问:与PSAM之间严格双向认证流程:交易自动形成不可抵赖的TAC码 口令保护钱包,不校验口令错误次数:口令更换是明文可被截获,卡片不能验证设备合法性 终端安全性 采用动态密钥,密钥存储.交易验证与加密计算都…

进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是: [00] Query id [01] Subject id [02] % identity [03] alignment length [04] mismatches [05] gap openings [06] q. start [07] q. end [08] s. start [09] s. end [10] e-value [11] bit score…

转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大,其下面有非常多的参数,但是一般使用的参数如:-p.-i.-d.-o.-e等几个. -p: 执行的程序名称 -d: 搜索的数据库名称 -i : 要查询的序列文件名(Query File) -e:(数学)期望值(Expectation value),E值是个统计阈值,缺省值10, 意指比对结果中由于随…

格式化数据库: makeblastdb -in db.fasta -dbtype prot -parse_seqids -out dbname 参数说明: -in:待格式化的序列文件 -dbtype:数据库类型,prot或nucl -out:数据库名 蛋白序列比对蛋白数据库(blastp): blastp -query seq.fasta -out seq.blast -db dbname -outfmt 6 -evalue 1e-5 -num_descriptions 10 -num_thre…

本文整理自网络. M1卡是指菲利浦下属子公司恩智浦出品的芯片缩写,全称为NXP Mifare1系列,常用的有S50及S70两种型号,目前都有国产芯片与其兼容,属于非接触式IC卡.最为重要的优点是可读可写并且安全性高的多功能卡.这些优点与其自身的结构密不可分.   主要指标 容量为8K位EEPROM(Electrically Erasable Programmable Read-Only Memory,带电可擦可编程只读存储器) 分为16个扇区,每个扇区为4块,每块16个字节,以块为存取单位 每个…

我生信入门,老师就要求我学好blast比对,说得也确实是很有道理,是个人都知道比对是最基本的东西,现在再想想那老师的建议,也只能呵呵一笑. 北大生物信息公开课有一章专门讲得序列数据库搜索,可以好好看看,快速入门. 序列数据库搜索 BLAST算法 Basic Local Alignment Search Tool BLAST使用…

主要参考下面两篇论文 1.<不定方程x(x-1)=Dy(y-1)的解法> 2.<用递推公式求一个不定方程的正整数解> 原有题目意思是 记得有一次全班去唱K, 其中有个活动是情歌对唱. 具体操作流程是这样的: 准备好 21 个阄(我们班 15 男 6 女), 其中只有两个是有标记的, 每人随意抓取一个, 最后取到有标记的阄的两个人去点首情歌对唱. 旁边一哥们儿幽幽地对我说, 看来搅基真是神的安排啊, 你看我们班的男女人数, 搅基的几率 C(15,2)/C(21,2) 刚好是 1/2.…