final model for bioinformatics 模拟真实的生物系统,从有机分子到细胞,到组织,到器官,到个体,到家系,到群体. 正确的设计结构,可拓展性,可塑性. 良好的可视化. 面向对象的编程,游戏引擎. 基因结构class 细胞结构class 组织结构class 个体结构class 我们都是被实例出来的某个类地一个对象. 真正的个性化医疗的最终目的不就是把人给数字化吗?只有建立一个这种模型才算是真正的数字化. 数字化的最大好处就是低成本的模拟未来,比如根据你的遗传信息判断你未来…

引自:http://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/72857454 中文文档:http://keras-cn.readthedocs.io/en/latest/ 官方文档:https://keras.io/ 文档主要是以keras2.0. . Keras系列: 1.keras系列︱Sequential与Model模型.keras基本结构功能(一) 2.keras系列︱Application中五款已训练模型.VGG16框架(Sequent…

模型对应的数学公式,公式中往往有待学习得到的参数,因此在进行训练或者学习时,首先初始化这部分参数(0 或标准正太分布): 学习之前的初始化:initial model: 学习完成之后的模型:final model: 算法则是一套处理的流程: 引入新的记号(变量): 对参数进行update: 算法执行结束,意味着最终的参数也学习得到: 框架,可以 embed 各种不同的求解算法:…

import numpy import theano.tensor as T from theano import function x = T.dscalar('x') y = T.dscalar('y') z = x + y f = function([x, y], z)numpy.allclose(f(16.3, 12.1), 28.4) 输出为truenumpy.allclose(z.eval({x:16.3, y:12.1}, 28.4)) 输出为true tensor:高维数组,T…

第7章 高级概念 The Code First modeling functionality that you have seen so far should be enough to get you up and running with most applications. However, Code First also includes some more advanced functionality that you may require as your needs advance.…

论文看的云里雾里,希望通过阅读其代码来进一步了解. 参考:http://blog.csdn.net/sloanqin/article/details/51525692 首先是./tools/train_faster_rcnn_alt_opt.py,通过其main函数了解整个训练流程. if __name__ == '__main__': #建议读者调试这个函数,进去看看每个变量是怎么回事 args = parse_args() #解析系统传入的argv参数,解析完放到args中返回 print(…

写在前面,metric2t指标详解: NDCG(Normalized discounted cumulative gain)即DCG/IDCGCG(cumulative gain)DCG(Discounted Cumulative Gain)MAP(Mean Average Precision)MRR(Mean Reciprocal Rank) Usage: java -jar RankLib.jar <Params>Params: [+] Training (+ tuning and eva…

Daniil's blog Machine Learning and Computer Vision artisan. About/ Blog/ Image Segmentation with Tensorflow using CNNs and Conditional Random Fields Tensorflow and TF-Slim | Dec 18, 2016 A post showing how to perform Image Segmentation with a recentl…

来自:http://deeplearning.net/software/theano/tutorial/examples.html More Examples 现在,是时候开始系统的熟悉theano的基础对象和操作了,可以通过浏览库的部分来详细的了解 Basic Tensor Functionality. 随着这个教程的深入,你可以逐渐的让自己熟悉库的其他相关的部分和文档入口页面的其他相关的主题了. 一.Logistic 函数 这是一个简单的例子,虽然会比两个数值相加要难一些.假设你想要计算一个…

来自:http://deeplearning.net/software/theano/tutorial/modes.html Configuration Settings and Compiling Modes 一.配置 该 config 模块包含了好几个属性用来修改theano的行为.许多属性会在导入theano模块的时候被检查的,其中一些属性是被假定成只读形式的.约定俗成,在config模块中的属性不应该在用户的代码中被修改. Theano的代码对这些属性都有默认值的,不过你可以从你的 .t…