mothur trim.seqs 去除PCR引物】的更多相关文章

trim.seqs 有以下几个主要应用: 1)根据barcode 拆分序列: 2)去除PCR引物 3) 去除低质量序列 trim.seqs 在使用时必须输入一个fasta 格式的序列,然后在加至少一个的选项:其选项有很多,下面一一介绍: 1)oligos: 从字面意义看是寡聚核苷酸, 这里是指barcode 和 PCR 引物的序列,这个选项对应的是一个文件,文件内容如下: forward CATGCTGCCTCCCGTAGGAGT #reverse TCAGAGTTTGATCCTGGCTCAG…
trim()方法去除字符串首尾空格 1.原生js                 Function trimStr(str){                         Return str.replace(/(^\s*)|(\s*$)/g,"");                 }                 调用:var 变量=trimStr(要去除空格的字符串); 2.jquery  $.trim(str)                 var str=$.trim…
在介绍summary.seqs的用法之前,我们首先需要搞清楚两个概念: 1)ambiguous bases 中文叫做模糊碱基,对于DNA序列来说,只有ATCG 4种碱基,在IUPAC定义的碱基标准中,出了上述4种碱基之外,还包括其他的碱基,可以代表不同类型的碱基 代码 英文含义 中文含义 G   Guanine 鸟嘌啉 A   Adenine 腺嘌啉 T (U) Thymine (Uracil) 胸腺嘧啶 (尿嘧啶) C   Cytosine 胞嘧啶 R (A or G) PuRine 嘌啉 Y…
reverse.seqs 命令可以得到输入序列的反向互补序列 用法: mothur "#reverse.seqs(fasta = "input.fasta")" input.fasta 的内容如下: >1 AGCAGCATCGACGACGACGACTC 运行成功后,会输出一个 input.rc.fasta 文件,该文件中就是input.fasta 的反向互补序列 input.rc.fasta 的内容如下: >1 GAGTCGTCGTCGTCGATGCTG…
SQL TRIM()函数去除字符串头尾空格 SQL 中的 TRIM 函数是用来移除掉一个字串中的字头或字尾.最常见的用途是移除字首或字尾的空白.这个函数在不同的资料库中有不同的名称: MySQL: TRIM( ), RTRIM( ), LTRIM( ) Oracle: RTRIM( ), LTRIM( ) SQL Server: RTRIM( ), LTRIM( ) 各种 trim 函数的语法如下: TRIM ( [ [位置] [要移除的字串] FROM ] 字串): [位置] 的可能值为 LE…
String.prototype.trim = function (char, type) { if (char) { if (type == 'left') { return this.replace(new RegExp('^\\'+char+'+', 'g'), ''); } else if (type == 'right') { return this.replace(new RegExp('\\'+char+'+$', 'g'), ''); } return this.replace(…
在C#语言程序开发过程中,很多时候需要对字符串对象的前后空格进行去除,此时就需要使用到Trim()方法来实现这个功能,Trim()方法可以快速去除字符串前端和后端的所有空格. 例如有个字符:string  str="  Abc  "; 则需要去除字符串前后空格的话,则可以采用:str=str.Trim()方法.经过此方法调用后,str的值实际上已经更改为"Abc",前后空格被去除了. 备注:更多干货关注博主站点IT技术小趣屋.原文转载自C#使用Trim方法去除字符串…
去掉首尾空格 SELECT TRIM(' abc '), ltrim(' abc '), rtrim(' abc ') FROM dual; 去掉首尾的其他字符 SELECT /*TRIM(';a;b;c;'),*/ ltrim(';a;b;c;',';'), rtrim(';a;b;c;',';') FROM dual; 注意:无法使用TRIM(‘;a;b;c;’, ‘;’)的格式 但是TRIM()却有它自己的格式 SELECT TRIM(';' FROM ';a;b;c;'), TRIM(l…
var str= ",2,3,4,6,7,"; var str2 = str.Trim(new char[] { ',' }); //去除字符串str两端的','字符. //则str2 为:"2,3,4,6,7"…
原因: 从txt文件中读取一些数据导入mysql数据库,导入数据库之后发现有一个字段的前面有两个“空格”,后来在代码里我尝试用trim().replace()等方法去除,发现怎么也去不掉,于是我将字符串里的这个“空格”的ASCII码输出,输出12288,查询资料后发现这个字符是全角空格,用trim().replace()等方法是无法去除的,采用如下方法解决. 解决方案: str = str.replaceAll((char)12288+"",""); 注意:(cha…