前面我们讲过GO.db这个包,现在接着延伸topGO包,该包是用来协助GO富集分析 1)安装 if("topGO" %in% rownames(installed.packages()) == FALSE) {source("http://bioconductor.org/biocLite.R");biocLite("topGO")} suppressMessages(library(topGO)) ls("package:topGO&…

参考:http://www.biotrainee.com/thread-558-1-1.html http://bioconductor.org/packages/3.7/bioc/ http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/topGO.html https://www.jianshu.com/p/9e21f2196178 https://rpubs.com/aemoore62/TopGo_colMap_Func_Trouble…

1.安装bioconductor及go分析涉及的相关包 source("http://bioconductor.org/biocLite.R") options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") biocLite("DO.db", type = "source") biocLite("BiocUpgrade") biocLite('cluster…

20155205 2016-2017-2 <Java程序设计>第6周学习总结 教材学习内容总结 第十章 在Java中,输入串流代表对象为Java.io.InputStream实例,输出串流代表对象为Java.io.OutputStream实例. 字节流: int read (byte[]b,int off,int len) //int返回值是这一次读取了多少个数据,off是偏移量(初始索引),len是数据长度. void write (byte[]b,int off,int len) 注 :r…

20155318 2016-2017-2 <Java程序设计>第六周学习总结 教材学习内容总结 学习目标 理解流与IO 理解InputStream/OutPutStream的继承架构 理解Reader/Writer继承架构 会使用装饰类 InputStream和OutputStream 发生错误时返回`java.io.IOException异常,所以表示为 public static void dump(InputStream src, OutputStream dest) throws IO…

20155328 2016-2017-2 <Java程序设计>第6周学习总结 教材学习内容总结 根据不同的分类标准,IO可分为:输入/输出流:字节/字符流:节点/处理流. 在不使用InputStream与OutputStream时,必须使用Clos()方法关闭串流. InputStream和OutputStream的常用类继承架构: 可以使用System的setIn()方法指定InputStream实例,重新指定标准输入来源:用setOut()方法指定PrintStream实例,将结果输出至指…

20155339 2016-2017-2 <Java程序设计>第6周学习总结 教材学习内容总结 第十章 串流设计 Java将输入/输出抽象化为串流,数据有来源及目的地,衔接两者的是串流对象. 输入串流代表对象为java.io.Inputstream实例,输出串流代表对象为java.io.OutputStream实例. 在进行InputStream与OutStream的相关操作时若发生错误,会抛出java.io.IOException异常,在dump()方法上声明throws,由调用``dump…

20155224 2016-2017-2 <Java程序设计>第6周学习总结 教材学习内容总结 Thread线程: 定义某线程后,要有 xxx.stard(); Thread.sleep()会让线程进入Blocked状态,此时若调用线程的interru方法,会抛出interruptedException异常对象. synchronized: 在方法前加上此关键字,可以确保方法内的流程完整执行. 资源在多线程下的交叉调用可能造成死锁. Lock: 主要操作类为ReentrantLock 方法:…

20155237 2016-2017-2 <Java程序设计>第6周学习总结 教材学习内容总结 第十章 输入与输出 InputStream与OutputStream 流(Stream)是对「输入输出」的抽象,注意「输入输出」是相对程序而言的 标准输入输出 System.in: 标准输入,默认关联到键盘(终端输入) System.out: 标准输出,默认关联到显示器(终端输出) System.err: 标准错误,默认关联到显示器(终端输出) 输入输出重定向:setIn,setOut,setErr…

20155229 2016-2017-2 <Java程序设计>第六周学习总结 教材学习内容总结 第十章 Java中,输入串流代表对象为java.io.InputStream,输出串流代表对象为java.io.OutputStream InputStream的read()方法每次尝试读入byte数组长度的数据,并返回实际读入的字节:OutputStream的write()方法,指定要写出的byte数组.初索引与数据长度. System的setIn()方法指定InputStream,重新制定标准输…