目录 流程使用 问题 记录下braker2的使用要点,以备忘记. 流程使用 braker2有很多流程,根据你的数据:组装的基因组.转录组.蛋白(同源,包括近缘或远缘)选择不同流程,官网有说明: https://github.com/Gaius-Augustus/BRAKER 现在的动植物组装,大多数都含有以上三类数据吧,因此可选择如下流程,用公共数据库OrthoDB中的直系同源蛋白,根据自己的物种选择,有动物植物微生物等,如我选择植物就有300多万条序列. 作者指出,braker2并非证据越多越…

iBatis & myBatis & Hibernate 要点记录 这三个是当前常用三大持久层框架,对其各自要点简要记录,并对其异同点进行简单比较. 1. iBatis iBatis主要完成两件事情: 根据JDBC规范建立与数据库之间的连接.并进行连接管理与事务管理: 通过反射打通JAVA对象与数据库参数交互之间的相互转换关系. 基本使用步骤: 在xml配置文件中配置上数据库的连接池信息.事务相关的参数等,并指定要加载的SqlMapConfig文件: 在数据表对应的SqlMap xml配置…

JAVA 中LinkedHashMap要点记录 构造函数中可能出现的几个参数说明如下: 1.initialCapacity 初始容量大小,使用无参构造方法时,此值默认是16 2.loadFactor 加载因子,使用无参构造方法时,此值默认是 0.75f 3.accessOrder false: 基于插入顺序 true: 基于访问顺序 其余的几个参数都好理解,关键是最后一个参数,是LinkedHashMap区别于其余类型的HashMap的一个关键特性所在. 对于accessOrder设置为true…

参考: 分子生物学教材 再一次,翻看真核生物基因结构! mRNA基本结构特点 Structure and function of Messenger RNA (mRNA ) 基因结构 其实这个结构不完整,完整的如下: 主要注意UTR这个结构 真核生物的基因结构包括编码区和非编码区. 编码区 编码区其实是断裂基因结构,也就是不连续基因.具有蛋白编码功能的不连续 DNA 序列称为外显子,外显子之间的非编码序列为内含子. 每个外显子和内含子接头区都有一段高度保守的一致序列,即内含子5'末端大多数是 G…

C/S结构测试要点   1.安装/卸载: 1.安装包:完整性,安装包大小是否达到要求,显示基本信息是否正确,步骤是否明确,内容是否合理. 2.首次安装: 1)是否与其他已安装的软件冲突. 2)各种杀毒软件(卡巴.瑞星.360)对安装程序的影响) 3)安装目录的考虑(中英文字符.长度.空目录.根目录.修改目录.默认目录) 4)干净环境下能否正常完成安装 5)安装后快速启动.桌面.开始程序里面的快捷方式情况等 6)360一键智能安装是否能正常完成 7)安装的程序是否带有插件 3.再次安装: 1)在已…

cocos2dx跨平台开发中需要了解android开发,昨天快速的浏览了一本Android开发入门教程,因为之前也似懂非懂的写过Activity,Intent,XML文件,还有里面许多控件甚至编程思想都能在IOS中找到影子,所以看起来并不吃力,只求以后看见Android程序能看懂,现在记录下一些要点心得. 提到Android开发,当然要先搞明白它的四大组件分别代表什么,起什么作用: (1)活动(Activity) 活动是最基本的 Android 应用程序组件,在应用程序中,一个活动通常就是一个单…

写在要点之前的一段话,留给将来的自己:第一次参加编程的培训班,很兴奋很激动,之前都是自己在网上找免费的视频来看,然后跟着写一些课程中的代码,都是照着模子写,没有自己过多的思考.感觉这样学不好,除了多写以外,还得自己思考,经过了自己思考的源码,才能真正成为自己的东西.在上课前,班主任就让我们自己想一下,通过这个培训,要达到的目标.其实我的目标很简单,不求通过这个培训班能成为什么开发工程师,年薪百万,达到人生巅峰,赢取白富美.那个不现实,我只求能够在现在实际工作中(我的工作主要是网络运维,还兼有系统…

原文:深入理解JavaScript系列(1):编写高质量JavaScript代码的基本要点 1.最小全局变量(Minimizing Globals)的重要性 JavaScript通过函数管理作用域.在函数内部声明的变量只在这个函数内部,函数外面不可用.另一方面,全局变量就是在任何函数外面声明的或是未声明直接简单使用的. 原因: 在同一个全局命名空间,如果程序的两个不同部分定义了同名,但不同作用的全局变量的时候,容易发生命名冲突.所以要尽可能少的使用全局变量. 2.单var形式(Single va…

tRNAscan-SE 软件可以根据输入的基因组序列,预测对应的tRNA的基因 在线的tRNAscan-SE的链接如下:http://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE/ 如下图所示,只需要输入fasta 格式的序列,选择对应的物种类型和其他的一些选项,点击运行按钮即可 结果界面如下: 首先是预测的tRNA基因 表头解释如下: Sequence Name : 输入的用于预测tRNA的序列名称 tRNA #              : 预测到的tRNA的个数 Predict…

近日在阅读Social GAN文献的实验代码,加深对模型的理解,发现源代码的工程化很强,也比较适合构建实验模型的学习,故细致阅读.下文是笔者阅读中一些要点总结,有关于pytorch,也有关于模型自身的. GPU -> CPU SGAN的实验代码在工程化方面考虑比较充分,考虑到了在CPU和GPU两种平台上模型的运行.原生平台是GPU,若要切换为CPU,需要做如下改动(目前只改动了训练过程所需的,测试评估还未进行,但估计类似): args.use_gpu需要置为0,以保证int_dtype和floa…