我们的云平台上的GO富集分析工具,需要输入的文件表格和参数很简单,但很多同学都不明白其中的原理与结果解读,这个帖子就跟大家详细解释~ 一.GO富集介绍:       Gene Ontology(简称GO)是一个国际标准化的基因功能分类体系,提供了一套动态更新的标准词汇表(controlled vocabulary)来全面描述生物体中基因和基因产物的属性.GO总共有三个ontology(本体),分别描述基因的分子功能(molecular function).细胞组分(cellular compon…

目录 前言 VisualVM 安装与配置 本地使用 远程监控 MAT 使用场景 安装与配置 获得堆转储文件 分析堆转储文件 窥探对象内存值 堆转储文件对比分析 总结 前言 本文将简要介绍Java线程与内存分析工具VisualVM和MAT的使用,进一步的学习可参考官网或工具帮助(例如MAT:Help -> Welcome -> Tutorials),并在实际工作中融会贯通. VisualVM Java VisualVM是JDK1.6后自带的可视化工具,提供图形界面以实时监控应用程序的线程状态.C…

简介 https://www.sourceinsight.com/ Source Insight是一个面向项目开发的程序编辑器和代码浏览器,可以分析C/C++.C#.Java.Python等语言源代码. 在分析源代码的同时,可以动态维护它自己的符号数据库,并自动显示有用的上下文信息. Source Insight基本使用和快捷键 SourceInsight4完美破解 Source Insight Documentation 001 - SourceInsight建立工程添加文件 菜单栏--->P…

https://www.jianshu.com/p/cd4abc9889b6 前期准备 原版Win7系统ISO映像文件 PE启动U盘或系统光盘(本教程以纯净无捆绑的优启通PE为示例) 优启通v3.3下载(复制地址下载): 百度网盘链接: 链接:https://pan.baidu.com/s/1ShzBVQEXyb3ruuKZrNPvtg 提取码:wu9b 操作步骤 1.先把原版Win7系统ISO映像文件下载好   2.运行下载好的优启通,并在电脑插入空U盘按如下图顺序制作一个U盘PE启动盘  …

GO的主要用途之一是对基因组进行富集分析.例如,给定一组在特定条件下上调的基因,富集分析将使用该基因组的注释发现哪些GO术语被过度表示(或未充分表示). 富集分析工具    用户可以直接从GOC网站的主页进行浓缩分析.此服务连接到PANTHER分类系统的分析工具,该分类系统使用GO注释进行最新维护.PANTHER分类系统在Mi H等人,PMID:23868073中有详细说明.支持基因ID的列表可以从PANTHER网站获得. 使用GO富集分析工具 1.粘贴或键入要分析的基因的名称,每行一个或用逗号…

分析工具 1.叠加分析 # Process: 交集取反 arcpy.SymDiff_analysis("", "", 输出要素类, "ALL", "") # Process: 擦除 arcpy.Erase_analysis("", "", 输出要素类__2_, "") # Process: 更新 arcpy.Update_analysis("",…

Linux资源分析工具杂谈 开篇之前请大家先思考一个问题:        磁盘的平均I/O响应时间是1 ms,这个指标是好,还是差? 众所周知,计算机科学是客观的,也就是说对于一个给定的问题,我们总是能给出明确的答案,比如我们网上购物买了两件100元的衣服,我们应该付款200元,但是系统给我们计算出的金额确是300元,我们可以明确的告诉商家,结果算错了.与此不同,性能却常常是主观的,甚至对性能问题的判断都可能是不准确的,比如我们刚刚提到的1ms,一定有人认为是好的,也有人认为是差的,要客观的回答…

一.awstats 是什么 官方网站:AWStats is a free powerful and featureful tool that generates advanced web, streaming, ftp or mail server statistics, graphically. This log analyzer works as a CGI or from command line and shows you all possible information your lo…

1 lint简介 1.1 概述 lint是随Android SDK自带的一个静态代码分析工具.它用来对Android工程的源文件进行检查,找出在正确性.安全.性能.可使用性.可访问性及国际化等方面可能的bugs和可优化提升的地方. 1.2 lint工作流程 针对我们的项目,通过lint.xml配置lint分析的选项,执行检查后,会针对要分析的issue生成报告. 2 lint使用 有关lint的使用,有以下地方需要理解: 2.1 分析的范围 要对Android项目进行静态分析,首先就是指定要分析…

性能测试排查定位问题,分析调优过程中,会遇到要分析gc日志,人肉分析gc日志有时比较困难,相关图形化或命令行工具可以有效地帮助辅助分析. Gc日志参数 通过在tomcat启动脚本中添加相关参数生成gc日志 -verbose.gc开关可显示GC的操作内容.打开它,可以显示最忙和最空闲收集行为发生的时间.收集前后的内存大小.收集需要的时间等. 打开-xx:+ printGCdetails开关,可以详细了解GC中的变化. 打开-XX: + PrintGCTimeStamps开关,可以了解这些垃圾收集发…