如何划窗统计测序数据的reads数(depth):https://blog.csdn.net/shenshenwu666/article/details/80936374 方法1,用samtools depth.但是这个方法仅仅局限于对单个位点进行depth进行统计 samtools depth -b bed_file sample.bam > sample.depth bed 用来指定统计区间,运行后输出指定区间每一个碱基的测序深度(由于涉及所有碱基,因此文件很大) 方法2,用samtools…

POJ 1330 Nearest Common Ancestors / UVALive 2525 Nearest Common Ancestors (最近公共祖先LCA) Description A rooted tree is a well-known data structure in computer science and engineering. An example is shown below: In the figure, each node is labeled with an…

点此看题面 大致题意: 有\(n\)棵树,初始各有\(1\)个编号为\(1\)的节点,且其为生长节点.\(3\)种操作:将\([l,r]\)区间内的树增加一个新的编号的节点,修改\([l,r]\)区间内的树生长节点(没有该节点的树忽略此操作),询问某一棵树上两点的距离(保证存在). 考虑离线 不难发现,无论什么操作,都不会改变原有树的形态,因此,询问的答案是不会变的. 因此,就不难想到离线,从\(1\)到\(n\)枚举每棵树,每次只考虑相邻两棵树之间的差异,然后修改并进行询问. 这也是做这道题的…

[题目链接] 点击打开链接 [算法] 考虑求lca(x,y)的深度 我们可以将从根到x路径上的点都打上标记,然后,询问y到根上路径的权值和 那么,求sigma(depth(lca(i,z)))(l <= i <= r ),我们可以将区间[l,r]中的点依次打上标记,然后,询问点z到根路径 上的权值和 因为此题有多组询问,显然在线很难做,因此,我们考虑离线计算答案 求sigma(depth(lca(i,z))) (l <= i <= r),我们可以转化为 sigma(depth(lc…

傻逼线段树,傻逼数剖 线段树 定义: 线段树是一种二叉搜索树,与区间树相似,它将一个区间划分成一些单元区间,每个单元区间对应线段树中的一个叶结点. 使用线段树可以快速的查找某一个节点在若干条线段中出现的次数,时间复杂度为O(logN).而未优化的空间复杂度为2N,实际应用时一般还要开4N的数组以免越界,因此有时需要离散化让空间压缩. 有什么用? 线段树功能强大,支持区间求和,区间最大值,区间修改,单点修改等操作.线段树的思想和分治思想很相像.线段树的每一个节点都储存着一段区间[L-R]的信息,其…

瘋耔C++笔记 欢迎关注瘋耔新浪微博:http://weibo.com/cpjphone 参考:C++程序设计(谭浩强) 参考:http://c.biancheng.net/cpp/biancheng/cpp/rumen_8/ 博客原文:http://www.cnblogs.com/Ph-one/p/3974707.html 一.C++初步认识 1.C++输入.输出.头文件解释 #include<iostream> using namespace std ; int mian() { cout…

求二叉树的最大深度 /** * Definition for a binary tree node. * struct TreeNode { * int val; * TreeNode *left; * TreeNode *right; * TreeNode(int x) : val(x), left(NULL), right(NULL) {} * }; */ class Solution { public: int maxDepth(TreeNode* root) { int l,r; ; l…

题意:给一棵二叉树,求其深度. 思路:递归比较简洁,先求左子树深度,再求右子树深度,比较其结果,返回:max_one+1. /** * Definition for a binary tree node. * struct TreeNode { * int val; * TreeNode *left; * TreeNode *right; * TreeNode(int x) : val(x), left(NULL), right(NULL) {} * }; */ class Solution {…

Maximum Depth of Binary Tree Total Accepted: 63668 Total Submissions: 141121 My Submissions Question Solution Given a binary tree, find its maximum depth. The maximum depth is the number of nodes along the longest path from the root node down to the…

求二叉树的最小深度: /** * Definition for a binary tree node. * struct TreeNode { * int val; * TreeNode *left; * TreeNode *right; * TreeNode(int x) : val(x), left(NULL), right(NULL) {} * }; */ class Solution { public: int minDepth(TreeNode* root) { ; int l = m…