由于基因组数据过大,想进一步用R语言处理担心系统内存不够,因此想着将文件按染色体拆分,发现python,awk,R 语言都能够非常简单快捷的实现,那么速度是否有差距呢,因此在跑几个50G的大文件之前,先用了244MB的数据对各个脚本进行测试,并且将其速度进行对比. 首先是awk处理,awk进行的是逐行处理,具有自己的语法,具有很大的灵活性,一行代码解决,用时24S, #!/usr/bin/sh function main() { start_tm=date start_h=`$start_tm…

package dom4j_write; import java.io.File; import java.io.FileOutputStream; import java.io.OutputStream; import org.dom4j.Document; import org.dom4j.io.SAXReader; import org.dom4j.io.XMLWriter; /** * 输出写出一个xml文件: * XMLWriter. * * 利用XMLWriter实现: * 1)读取…

Map map = getSearchValue(); File excelFile = orderService.getexportexcel(id,map); InputStream is = null; OutputStream os = null; BufferedInputStream bis = null; BufferedOutputStream bos = null; //以流的形式输出文件 try { if (excelFile.exists()) { String fileN…

最近在工作中,进行大量的数据处理,使用的是mysql5.7.22,发现当数据量级达到几十万之后,SQL执行速度明显变慢.尤其是当多个表join时,于是就尝试用python pandas进行数据处理,发现运行速度明显比SQL运行速度快.于是,决定比较一下千万数据量级之下,SQL.pandas.shell在数据处理上的优劣势. 配置:ubuntu系统64位,8G内存,intel i7处理器 软件环境:mysql5.7.22  , python3下的pandas ,  shell 测试数据: 数据是使…

在数据分析的过程中,外部数据的导入和数据的导出是非常关键的部分,而Python和R在这方面大同小异,且针对不同的包或模块,对应着不同的函数来完成这部分功能: Python 1.TXT文件 导入: 以某证券软件导出的txt格式股票数据为例: 方式1: with open(r'C:\Users\windows\Desktop\test\input\SH#600216.txt','r') as s: data_raw = s.readlines() data_raw 可以看到,通过readlines(…

使用中常用到Perl,Python,AWK,R, 虽然Java,C,C++,Vala也学过但是就是不喜欢,你说怎么办. 看来一辈子脚本的命. Perl @rray = split /PATTERN/, STRING, LIMIT 可以看出split由2部分(STRING,PATTERN)和可选的LIMIT部分构成,反正split么,万变不离其宗,都要有 你要split的String,split的界定,split的保存,其他的可以外加 我们举一个简单的例子: > cat test.txt (为了对…

如果需要使用Python写Excel文件,首先下载或者安装xlwt. pip install xlwt 下面的这些demo应该可以帮助开发者快速上手使用xlwt写Excel文件: 创建工作簿(workbook)和工作表(sheet): import xlwt workbook = xlwt.Workbook() sheet = workbook.add_sheet("Sheet Name") 写单元格(cell): sheet.write(0, 0, 'foobar') # row,…

至少很长一段时间内,我个人用的一直是pycharm,也感觉挺好用的,也没啥大毛病 但是pycharm确实有点笨重,啥功能都有,但是有很多可能这辈子我也不会用到,并且pycharm打开的速度确实不敢恭维,即使固态硬盘也只能快了那么一丢丢.所以就尝试了很多IDE工具,最终选择了Sublime我也相信,通过我的介绍,你也会爱上它的. 首先其他语言有的sublime也必须得有,并且更好用,主要有: 集成代码分析 代码的自动补全 git功能的集成 Sublime command-line 工具 不过上述的…

https://blog.csdn.net/weixin_36604953/article/details/78592943 Python新手写出漂亮的爬虫代码2——从json获取信息好久没有写关于爬虫的东西了,如果正在读这篇博客的你看过我的另一篇<Python新手写出漂亮的爬虫代码1——从html获取信息>想必已经对一些写在html中的信息进行过爬取了,今天给大家介绍一下另一种爬虫——动态爬虫. 1.静态爬虫与动态爬虫何为动态爬虫,html中的信息是静态的,或者说是通过html语言生成了网页…

如何用PYTHON代码写出音乐 什么是MIDI 博主本人虽然五音不全,而且唱歌还很难听,但是还是非常喜欢听歌的.我一直在做这样的尝试,就是通过人工智能算法实现机器自动的作词和编曲(在这里预告下,通过深度学习写歌词已经实现了,之后会分享给大家),本文我们主要聊下如何写曲. 说到用代码写曲子,有一个东西大家一定要了解就是MIDI.MIDI是一种乐器数字接口,是编曲界最广泛的音乐标准格式.MIDI并不是真正意义上的音乐文件,大家可以把它理解成乐谱,需要有环境编译MIDI文件,才可以生成音乐.这个关系有…