折腾这么多都是白瞎,STAR就有输出没有别对上的pair-end reads的功能 参见:How To Filter Mapped Reads With Samtools I had the same issue but with Paired End Reads, and I solved using samtools and bamToFastq. You can find bamToFastq here: https://code.google.com/p/hydra-sv/ If you…

在python语言中,用丰富的函数库来从文件中提取数据,这篇博客讲解怎么从csv, xls文件中得到想要的数据. 点击下载数据文件http://seanlahman.com/files/database/lahman-csv_2015-01-24.zip 这个一个美国棒球比赛的统计数据解压文件夹,我们选取AwardsManagers.csv来练习 #-*- coding:utf-8 -*- import csv DIR = 'data/' fname = 'AwardsManagers.csv'…

/************************ @HJ 2017/3/30 参考http://blog.sina.com.cn/s/blog_4b0020f301010qcz.html修改的代码 @主要调用opencv相关函数,从视频流中提取出图片序列 @需要注意的问题: cvReleaseImage(&pImg)释放内存出错的两种情况:具体可以参考http://www.cnblogs.com/grandyang/p/4615036.html 1)从摄像头获取的图片不能被修改和释放,所以如果…

总览 psfgettable 字体文件 [输出文件] 描述 psfgettable 命令从一个 .psf 格式的控制台字体中提取出嵌入的 Unicode字符表, 以易读格式输入到一个ASCII文件, 该文件的格式如同 psfaddtable(1) 所使用的. 若字体文件名是单个破折号(-), 则字体从标准输入读取.…

JSFinder介绍 JSFinder是一款用作快速在网站的js文件中提取URL,子域名的脚本工具. 支持用法 简单爬取 深度爬取 批量指定URL/指定JS 其他参数 以往我们子域名多数使用爆破或DNS中获得,这个脚本从JS文件中匹配出子域也算是添砖加瓦. 简单爬取示例 子域名清单 https://github.com/Threezh1/JSFinder 点个赞 (0)  …

前言 数据是数据科学中任何分析的关键,大多数分析中最常用的数据集类型是存储在逗号分隔值(csv)表中的干净数据.然而,由于可移植文档格式(pdf)文件是最常用的文件格式之一,因此每个数据科学家都应该了解如何从pdf文件中提取数据,并将数据转换为诸 很多人学习python,不知道从何学起.很多人学习python,掌握了基本语法过后,不知道在哪里寻找案例上手.很多已经做案例的人,却不知道如何去学习更加高深的知识.那么针对这三类人,我给大家提供一个好的学习平台,免费领取视频教程,电子书籍,以及课程的源…

提取音频,具体点来说就是提取音频帧.提取方法与从视频文件中提取图像的方法基本一样,这里仅列出其中的不同点: 1. 由于目的提取音频,因此在demux的时候需要指定的是提取audio stream AudioStream = av_find_best_stream(pFormatCtx, AVMEDIA_TYPE_AUDIO, -1, -1, NULL, 0); 2. 在decode时,解码音频与解码视频分别采用的是不同的API avcodec_decode_audio4(pCodecCtx, p…

bag文件是ROS常用的数据存储格式,因此要从bag文件中提取数据就需要了解一点ROS的背景知识. 1. 什么是ROS及其优势 ROS全称Robot Operating System,是BSD-licensed系统用于从PC上控制机器人组件.ROS系统由一系列的独立node组成,彼此间通过publish/subscribe消息传递模式相互沟通.比如某个传感器驱动由某个node执行,将该传感器数据用message stream的形式publish,而这些message则可以在数据处理或者日志节点被…

[流媒體]H264—MP4格式及在MP4文件中提取H264的SPS.PPS及码流 SkySeraph Apr 1st 2012  Email:skyseraph00@163.com 一.MP4格式基本概念 MP4格式对应标准MPEG-4标准(ISO/IEC14496) 二.MP4封装格式核心概念 1  MP4封装格式对应标准为 ISO/IEC 14496-12(信息技术 视听对象编码的第12部分: ISO 基本媒体文件格式/Information technology Coding of aud…

从ROS bag文件中提取图像 创建launch文件,如下: export.launch <launch> <node pkg="rosbag" type="play" name="rosbag" args="-d 2 $(find image_view)/test.bag"/> <node name="extract" pkg="image_view" t…