pacbio 采用hdf5文件格式保存原始的下机数据,对于RS 测序系统而言,会产生一个 bas.h5 的文件; 以bas.h5 文件为例,看一下有下机数据中保存了那些信息 h5dump 工具可以用来查看h5 文件的内容: 我从HGAP的wiki 页面下载了一个测试用的h5文件,文件名为 m120729_040044_42134_c100384402550000001523033010171256_s1_p0.bas.h5 运行下面命令: h5dump -n m120729_040044_421…

h5文件是层次格式的第5代版本,用于存储科学数据的一种文件格式和库文件,由美国超级计算中心与应用中心研发的文件格式,用以存储和组织大规模数据. H5将文件结构简化成两个主要的对象类型: 1 数据集dataset,就是同一类型数据的多维数组 2 组group,是一种容器结构,可以包含数据集和其他组,若一个文件中存放了不同种类的数据集,这些数据集的管理就用到了group 直观的理解,可以参考我们的文件系统,不同的文件存放在不同的目录下: 目录就是hdf5文件中的group,描述了数据集DataSet…

今天被人问起如何看懂三代的下机数据,虽然解决了别人的问题,但感觉自己还是没有搞透. 基本的目录结构: |-- HG002new_O1l_BP_P6_021315b_MB_100pM | |-- D01_1.c60e446d-f276-41fc--ffa937e22683.tar.gz | |-- D01_2.19ee4f13-c420---cb1da56beccd.tar.gz | |-- D01_3.94e34f0a-eef3-4b71-8f1b-c9790dec647e.tar.gz | |…

一开始拿到三代测序的下机数据时,蒙了,readme ?三代测序的下机数据都有哪些,以及他们具体的格式是怎么样的(以sequel 平台为主). 测序过程 SMRTbell A adapter通用接头,两端的接头可以一样也可以不一样    B barcode(客户自己设计)    I insert 插入片段,即我们测序的目的片段    由于SMRTbell是环状的,测序过程是边合成边测序,因此可以沿着新链合成的方向不停地读取序列,读取一圈又一圈,直到聚合酶累趴下了… 测序结果 根据SMRTbell的…

转载:http://www.cnblogs.com/jinhh/p/8328818.html 三代测序的下机数据都有哪些,以及他们具体的格式是怎么样的(以sequel 平台为主). 测序过程 SMRTbell A adapter通用接头,两端的接头可以一样也可以不一样    B barcode(客户自己设计)    I insert 插入片段,即我们测序的目的片段    由于SMRTbell是环状的,测序过程是边合成边测序,因此可以沿着新链合成的方向不停地读取序列,读取一圈又一圈,直到聚合酶累趴…

sa命令从/var/account/pacct原始记账数据文件读取信息并汇总…

Rhel6.5 Django1.10 Python3.5 Django框架-目录文件简介 1.介绍Django Django:一个可以使Web开发工作愉快并且高效的Web开发框架. 使用Django,使你能够以最小的代价构建和维护高质量的Web应用. 遵循模式:模型-视图-控制器(MVC)模式.简单的说, MVC 是一种软件开发的方法,它把代码的定义和数据访问的方法(模型)与请求逻辑 (控制器)还有用户接口(视图)分开来.这种设计模式关键的优势在于各种组件都是 松散结合 的.这样,每个由 Dja…

我们知道,一般的文件读写函数是不接受直接将cell内容(非数值)直接写入文件的, 例如:dlmwrite('o.txt', C, 'delimiter', '\t');%C 为cell类型数据,会报错 C=: 'tim' 'space' 'ss''ddsa' 'sd' 'as''as' 'w' 'r' 那么假如我们只想写入C的第一列和第二列的数据到文件中,怎么办? 下面用比较原始(ben)的方法来实现: clc clear all %这里换成源文件路径 fname = 'E:\r.xls'; […

1.AndroidManifest.xml文件简介: 每个应用程序在它的根目录中都必须要有一个AndroidManifest.xml(名字须精确一致)文件.这个清单把应用程序的基本信息提交给Android系统,在应用程序的代码能够运行之前,这个信息系统必须建立.以下项目是清单文件所需要完成的工作: [注]:这个文件是需要程序员手动配置的,所以了解它的作用和结构很有必要. 1. 用Java包给应用程序命名.这个包名是应用程序的唯一标识: 2. 描述应用程序的组件---组成应用程序的Activity…

原文:IOS之Info.plist文件简介 http://www.apkbus.com/android-130240-1-1.html (出处: Android开发论坛 - 安卓开发论坛 - Android开发 - 安卓论坛 - 移动互联网门户) 元信息简介    为了提供更好的用户体验,IOS 和 OS X的每个app或bundle都依赖于特殊的元信息(meta Information).     元信息有多种用途,包括 直接向用户展示信息 系统内部用来标识你的app或其支持的文档类型 系统框…

iOS中常用的四种数据持久化方法简介 iOS中的数据持久化方式,基本上有以下四种:属性列表.对象归档.SQLite3和Core Data 1.属性列表涉及到的主要类:NSUserDefaults,一般 [NSUserDefaults standardUserDefaults]就够用了 @interface User : NSObject <NSCoding>@property (nonatomic, assign) NSInteger userID;@property (nonatomic,…

h5文件格式,HDF 的版本 5(HDF 版本 5不与 HDF 版本 4 及早期版本兼容)．HDF是什么呢?就是Hierarchical Data Format,可以存储不同类型的图像和数码数据的文件格式,并且可以在不同类型的机器上传输,同时还有统一处理这种文件格式的函数库.大多数普通计算机都支持这种文件格式.美国国家高级计算应用中心(National Center for Supercomputing Application,NCSA)为了满足各种领域研究需求而研制的一种能高效存储和分发科学数…

HDF5 (.h5, .hdf5) HDF 是 Hierarchical Data Format(分层数据格式)的缩写 HDF 版本 5不与 HDF 版本 4 及早期版本兼容. HDF5 (.h5, .hdf5)—Wolfram 语言参考资料 https://reference.wolfram.com/language/ref/format/HDF5.html 利用matlab读取.h5文件内容 - doublechenchenchen的博客 - CSDN博客 https://blog.csdn…

存放目录: 用 whereis my.cnf 查看mysql配置文件的目录,查看my.cnf的datadir参数可找到mysql数据库文件的存放目录. 本机存放的目录为/var/lib/mysql,进入该目录可以看到以数据库名命名的文件夹.文件夹里便存放着该数据库的所有数据库文件. 数据库文件简介: 数据库文件分为 : mysql所建的数据库文件.mysql所用引擎创建的数据库文件. .frm 保存与之同名的表的原数据信息,包含表结构定义等.与引擎无关.该文件可用来恢复或修改表结构. MyISA…

Atitit .h5文件上传 v3 1. 上传原理1 2. V3版新特性1 3. Html1 4. Js2 5. uploadV2.js2 6. upServlet & FileUploadService {3 7. 注意::去除struts的干扰3 8. 参考4 1. 上传原理 FormData  + apache  io 2. V3版新特性 组件化 ,使用了obj_selector 修正v2版bug 范例 person_info_edit .html用户信息头像修改 3. Html <s…

Atitit .h5文件上传 1. 上传原理1 2. Html1 3. Js2 4. uploadV2.js2 5. upServlet & FileUploadService {3 6. 注意::去除struts的干扰3 7. 参考3 1. 上传原理 FormData  + apache  io 2. Html <script type="text/javascript" src="../com.attilax/io/uploadV2.js">…

PYC文件简介¶ 不说废话,这里说的pyc文件就是 Python 程序编译后得到的字节码文件 (py->pyc). 基本格式¶ pyc文件一般由3个部分组成: 最开始4个字节是一个Maigc int, 标识此pyc的版本信息, 不同的版本的 Magic 都在 Python/import.c 内定义 接下来四个字节还是个int,是pyc产生的时间(1970.01.01到产生pyc时候的秒数) 接下来是个序列化了的 PyCodeObject(此结构在 Include/code.h 内定义),序列化方…

<!-- 数据和文件一次性提交 --> <form class="form_meren" id="mainForm" name="mainForm" action="${ctx}/shahescenicinfo/insertShaheScenicinfo.do" method="post" enctype="multipart/form-data"> <in…

1.简介 Adapter是用来帮助填充数据的中间桥梁,简单点说就是:将各种数据以合适的形式显示到view上,在常见的View(List View,Grid View)等地方都需要用到Adapter! 初次接触感觉和OC中TableView的cell功能一样! 继承关系: BaseAdapter:抽象类,实际开发中我们会继承这个类并且重写相关方法,用得最多的一个Adapter! ArrayAdapter:支持泛型操作,最简单的一个Adapter,只能展现一行文字~ SimpleAdapter:同样…

本文主要分享一个案例: 10分钟使用消息路由将原始设备数据记录存档 B站视频讲解:https://www.bilibili.com/video/av90223893/ 本文主要有如下内容: 1.理解什么是消息路由,为什么要用消息路由 2.消息路由的类型 3.配置一个到Storage的消息路由,将原始设备消息存储到blob 4.配置一个到Storage的消息路由,当温度>30°C时,才存储下来 图文讲解: 本文参照官网:https://docs.azure.cn/zh-cn/iot-hub/tut…

1.先说oracle表分区是什么吧,这样吧我们来举个桃子,栗子太小,我们就不举了,我们来举个桃子. 你有500万份文件,你要把他存在磁盘上,好嘛,我们就一个文件夹,500万分文件在那儿杵着,我们想找到要的那个打开,嘿嘿,我们得找到什么时候. 这时候,有个人告诉你,你把文件按照特定的规律存在不同的文件夹中,这样的话你就会好找很多. 哇,突然你开窍了,你说,对啊,你好牛逼啊,我怎么没想到呢?分开之后我在找的话就会快很多啊,所以你很高兴,也很服他.于是你就开始做了. --这个不同的文件夹就是不同的分区…

Android资源文件简介 1. Android应用资源的作用 (1) Android项目中文件分类 在Android工程中, 文件主要分为下面几类 : 界面布局文件, Java src源文件, 资源文件; -- 界面布局文件 : 在res/layout目录下定义, 用于定义Android中界面的显示样式; -- Java源码文件 : Android程序的逻辑实现, 程序主体; -- 资源文件 : 各种XML文件, 可以定义图片等资源, 以及各种图片, 音频, 视频, 3d模型等资源; (2)…

navigator:封装浏览器配置信息的对象 cookieEnabled:判断浏览器是否启用cookie cookie是什么:cookie是客户端本地,持久存储用户私密数据的文件 plugins:包含了所有插件的信息 <!DOCTYPE html> <html> <head lang="en"> <meta charset="UTF-8"> <title></title> </head&g…

一.预备知识 1.Android中的MVC设计模式 MVC (Model-View-Controller):M是指逻辑模型,V是指视图模型,C则是控制器.一个逻辑模型可以对于多种视图模型,比如一批统计数据你可以分别用柱状图.饼图来表示.一种视图模型也可以对于多种逻辑模型.使用MVC的目的是将M和V的实现代码分离,从而使同一个程序可以使用不同的表现形式,而C存在的目的则是确保M和V的同步,一旦M改变,V应该同步更新,这与<设计模式>中的观察者模式是完全一样. MVC好处:从用户的角度出发,用户可…

数据泵文件 expdp介绍 EXPDP命令行选项1. ATTACH该选项用于在客户会话与已存在导出作用之间建立关联.语法如下ATTACH=[schema_name.]job_nameSchema_name用于指定方案名,job_name用于指定导出作业名.注意,如果使用ATTACH选项,在命令行除了连接字符串和ATTACH选项外,不能指定任何其他选项,示例如下:Expdp scott/tiger ATTACH=scott.export_job 2. CONTENT该选项用于指定要导出的内容.默认…

一.properties文件简介 java中的properties文件是一种配置文件,主要用于表达配置信息,文件类型为*.properties,格式为文本文件,文件的内容是格式是"键=值"(推荐)或"键:值"的格式,在properties文件中,可以用"#"(推荐)或者"//"来作注释,properties文件在Java编程中用到的地方很多,操作很方便.(注意:其实properties文件相当于只是定义了一种文件格式,在实际应…

在android中的文件放在不同位置,它们的读取方式也有一些不同. 本文对android中对资源文件的读取.数据区文件的读取.SD卡文件的读取及RandomAccessFile的方式和方法进行了整理.供参考. 一.资源文件的读取:apk中资源文件 1) 从resource的raw中读取文件数据: try{ //得到资源中的Raw数据流 InputStream in = getResources().openRawResource(R.raw.test); //得到数据的大小 int length…

本文档为iOS VideoToolbox硬编H.265(HEVC)H.264(AVC):1 概述续篇,主要描述: CMSampleBufferRef读取实际数据 序列参数集(Sequence Parameter Set, SPS) 图像序列参数(Picture Parameter Set, PPS) 等内容. 1.视频实际内容数据持久化 1.1.可攻可受的CMSampleBufferRef 文档1 概述中回调函数 static void compressionOutputCallback(  …

原文:[ASP.NET Web API教程]5.3 发送HTML表单数据:文件上传与多部分MIME 注:本文是[ASP.NET Web API系列教程]的一部分,如果您是第一次看本系列教程,请先看前面的内容. 5.3 Sending HTML Form Data 5.3 发送HTML表单数据(2) 本文引自:http://www.asp.net/web-api/overview/working-with-http/sending-html-form-data,-part-2 By Mike Wa…

此文章对开放数据接口 API 之「全国天气预报信息数据 API」进行了功能介绍.使用场景介绍以及调用方法的说明,供用户在使用数据接口时参考之用,并对实战开发进行了视频演示. 1. 产品功能 接口开放了全国天气预报信息数据,你可以通过关键字查询任意市或者区级别的位置代码,通过位置代码查询最详细的天气预报数据. 全国天气预报每隔 6 小时更新数据: 精确到行政区级别的天气预报数据: 提供最长 7 天的天气预报数据: 提供每日小时级别的天气预报数据: 提供本地日出日落.当日历史温度等附加数据: 提供紫…