Trim Galore用法及参数考量

【Trim Galore用法及参数考量】的更多相关文章

Trim Galore用法及参数考量

Trim Galore是一个非常流行的用于「去接头序列」的软件,用于处理高通量测序得到的原始数据.通常我们从测序公司拿到数据后,第一步就是评估数据的质量以及对raw data去接头处理.公司拿来的数据通常附带了clean data以及去接头的说明文件,我自己重新实现了一下trim的过程.参数都是根据公司的说明文件来设定的. 软件说明版本信息 Trim Galore version: 0.4.1 Cutadapt version: 1.11 FastQC version:0.11.3 依赖环境…

Wget用法、参数解释

wget功能的强大就不用多说了,在高手手里,它就像是个无往不利的杀人利器,下面是转载的一篇Wget用法.参数解释的比较好的一个文章,当然最好的老师还是man wget 是一个从网络上自动下载文件的自由工具.它支持HTTP,HTTPS和FTP协议,可以使用HTTP代理. 所谓的自动下载是指,wget可以在用户退出系统的之后在后台执行.这意味这你可以登录系统,启动一个wget下载任务,然后退出系统,wget将在后台执行直到任务完成,相对于其它大部分浏览器在下载大量数据时需要用户一直的参与,这省去了…

linux命令名用法及参数功能注解

命令名用法及参数功能注解 1 文件管理 # ls ls -a 列出当前目录下的所有文件,包括以.头的隐含文件文件管理 # ls ls -l或ll 列出当前目录下文件的详细信息文件管理 # pwd pwd 查看当前所在目录的绝对路经文件管理 # cd cd .. 回当前目录的上一级目录文件管理 # cd …

JS基础篇--sort()方法的用法，参数以及排序原理

JS基础篇--sort()方法的用法,参数以及排序原理 sort() 方法用于对数组的元素进行排序,并返回数组.默认排序顺序是根据字符串Unicode码点.语法:arrayObject.sort(sortby):参数sortby可选.规定排序顺序.必须是函数.注:如果调用该方法时没有使用参数,将按字母顺序对数组中的元素进行排序,说得更精确点,是按照字符编码的顺序进行排序.要实现这一点,首先应把数组的元素都转换成字符串(如有必要),以便进行比较. 如果想按照其他标准进行排序,就需要提供比较函数…

setsockopt()用法及参数详解

setsockopt()用法(参数详细说明) int setsockopt(SOCKET s,int level,int optname,const char* optval,int optlen); s(套接字): 指向一个打开的套接口描述字level:(级别): 指定选项代码的类型.SOL_SOCKET: 基本套接口IPPROTO_IP: IPv4套接口IPPROTO_IPV6: IPv6套接口IPPROTO_TCP: TCP套接口optname(选项名): 选项名称optval(选项值):…

WordPress分类列表函数:wp_list_categories用法及参数详解举例

http://www.511yj.com/wordpress-wp-categories.html 注意: 1. wp_list_categories() 和 list_cats() 以及 wp_list_cats() 的使用类似,但是后面 2 个已经弃用. 2.如果你希望不格式化输出分类,请使用 get_categories() 3.因为 WordPress 中内置扩展的小工具功能,所以我们不经任何函数就可以在边栏或是其他我们想要的位置显示一个分类列表,所以wp_list_categories…

oracle trim函数用法详解

在oracle数据库中,trim一般都是用在删除字符串两边的空格.实际上,trim也可以用来删除字符串两边的指定字符.并且trim指定删除的字符串只能是单个字符Oracle TRIM函数是很常见的函数,下面对Oracle TRIM函数的语法作了详尽的阐述说明,希望可以让您对Oracle TRIM函数有更深的认识. 如果提到Oracle TRIM函数,最简单的功能就是使用它来去除字符串的行首和行尾的空格,这个功能也是大家使用频率最高的一种.然而Oracle TRIM函数其实是具有删除“任意指定”字…