central nervous system (CNS) peripheral nervous system (PNS) enteric nervous system (ENS) 做这部分的科研必须要把这个问题搞得一清二楚,当前到底研究到什么地步了? 从胚胎发育的起源到成熟个体大脑中各种subtype的细胞类型的作用. entoderm 内 mesoderm 中 ectoderm 外 分清两个发育过程: 生命发育,就是个体的其他器官的发育 智能发育,特指神经系统地发育 The single-ce…

The single-cell transcriptional landscape of mammalian organogenesis 老板已经提了无数遍的文章,确实很nb,这个工作是之前我们无法想象得,想想如何把我们的数据和他们的数据整合到一起. 文献阅读 | Molecular Architecture of the Mouse Nervous System 这篇侧重强调的是神经系统的单细胞发育过程测序. Mouse Organogenesis Cell Atlas (MOCA) - 所有…

------------------------------- Long noncoding RNAs are rarely translated in two human cell lines. (蛋白,多肽) Bánfai B, Jia H, Khatun J, Wood E, Risk B, Gundling WE Jr, Kundaje A, Gunawardena HP, Yu Y, Xie L, Krajewski K, Strahl BD, Chen X, Bickel P, Gi…

在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意思是取log2,这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距. Let's say there are 50 read counts in control and 100 read counts in treatment for gene A. This means gene A is…

近日,Neuromation 团队在 Medium 上撰文介绍其最新研究成果:利用卷积神经网络(CNN)评估儿童骨龄,这一自动骨龄评估系统可以得到与放射科专家相似或更好的结果.该团队评估了手骨不同区域,发现仅对掌骨和近端指骨进行评估,得到的结果与对整个手骨进行评估的结果相差无几.为了克服放射图像的质量和多样性问题,该团队引入了严格的清理和标准化过程,以增强模型的鲁棒性和准确率,提升骨龄评估的准确率.提高结果的可复现性以及临床医生的效率. Alexander 的论文<Pediatric Bone…

CHAPTER 5 ‘The Master of Those Who know’ Aristotle 第5章 “有识之士的大师” 亚里士多德 ‘All men by nature desire to know’, said Aristotle. You have probably met someone like this, always keen to learn more. Perhaps you've also come across know-it-alls who have lost…

RNA -seq RNA-seq目的.用处::可以帮助我们了解,各种比较条件下,所有基因的表达情况的差异. 比如:正常组织和肿瘤组织的之间的差异:检测药物治疗前后,基因表达的差异:检测发育过程中,不同的发育阶段,不同的组织之间的基因表达差异 等 在所有检测的差异类型中,最常用的一种检测就是:检测所有mRNA的表达量的差异. 还可以检测 RNA 的结构上的差异.例如:mRNA的剪接方式的差异,即“可变剪接”:还可以检测“融合基因”,同时还可以检测基因单点突变导致的SNP. 测序方法.步骤:人的细胞…

 人类全基因组测序06 SNP(single nucleotide polymorphism):有了10倍以上的覆盖深度以后,来确认SNP信息,就相当可靠了. 一个普通黄种人的基因组,与hg19这个参考基因组序列相比,会有350万个左右的SNP.又有大概2万个是落在外显子上的,而非同义的SNP有大概9千个. 所谓非同义的SNP,就是这些SNP是会引起蛋白质的序列变化的. indel:(insertion & deletion)是指小于50个bp以内的微小的插入.和缺失突变.一个普通黄种人的基因组…

对生长自动机的研究由来已久,并在计算机科学等众多学科中,使用元胞自动机的概念,用于生长模拟.而复杂花纹的生成,则可以通过重写一定的生长规则,使用生成式来模拟自然纹理.当然,很多纹理是由人本身设计的,其形成过程本身就是在人脑中进行"原胞生成"的过程. 基础理论抄自于基础百科. 来自于百度百科:L-系统是匈牙利生物学家Aristid LinderMayer于1968年提出的..L-系统的本质是一个重写系统,通过对植物对象生长过程的经验式概括和抽象,初始状态与描述规则,进行有限次迭代,生成字…

1. 两件事伴随发生,不代表他们之间有因果关系 - 从一些荒诞相关性案例说起 在日常生活和数据分析中,我们可以得到大量相关性的结论,例如: 输入X变量,有98%置信度得到Y变量 只要努力,就能成功 只要到了下班时间出公司大门,天就一定黑了 深圳交警表示,天秤.处女.天蝎座的人更喜欢违章 肿瘤发生率随着最近二十年手机的推广逐年上升,证明了手机辐射致癌 屁股大容易生儿子 世界上不吃猪肉的人群中,人自爆的概率最大 据观察统计,消防车数量越多的火灾中,伤亡人数越多 工业革命以来,女人穿的裙子越来越短,全…