PSSM特征-从生成到处理】的更多相关文章

以下代码均为个人原创,如有疑问,欢迎交流.新浪微博:拾毅者 本节内容: pssm生成 pssm简化 标准的pssm构建 滑动pssm生成 在基于蛋白质序列的相关预測中.使用PSSM打分矩阵会得将预測效果大大提高,同一时候,假设使用滑动的PSSM,效果又会进一步提高.这里主要以分享代码为主,以下介绍下PSSM从生成到处理的全过程. 1.PSSM的生成 PSSM的生成有多种方式,这里使用的psiblast软件.ncbi-blast-2.2.28+/bin/psiblast.下载地址:http://b…
二维码扫描 前言: 最近的项目中使用到了二维码,二维码这个模块功能也完成:觉得还是有必要总结一下用来做记录.好长时间没有写二维码了都忘记在差不多了,重新拾起来还是挻快的. 二维码使用场景: 生活中有很多的地方都在使用,比如把它分享给朋友,通过扫描来关注平台.它的功能有生成二维码.扫描二维码.从相册中读取二维码.主要从这几个方面来讲二维码的使用,最后会封装一个方便快捷使用的库,供想快速集成的使用者. 1.生成二维码 效果图: 1. 创建二维码滤镜--CIFilter 1.1 恢复滤镜的默认属性 1…
前一阵子写过一个arff的随笔,但是写完后发现有些啰嗦.其实如果使用weka自带的api,生成arff文件将变成一件很简单的事儿. 首先,可以先把特征文件生成csv格式的.csv格式就是每列数据都用逗号分隔的一种格式.(还有不清楚的googling一下就知道了) 一.首先看下特征文件怎么保存成csv格式. 1.首行为特征名,以逗号分隔. 2.除首行外的行都为数据行,每列数据都是首行对应的值.(可以是字符串,数字) 例: 二.通过weka的api把上面的csv转化成arff格式文件 1.weka代…
读聪明人的笔记,是不是也能变聪明呢? Image Caption是一个融合计算机视觉.自然语言处理和机器学习的综合问题,它类似于翻译一副图片为一段描述文字. Image Caption问题可以定义为二元组(I,S)的形式, 其中I表示图,S为目标单词序列,其中S={S1,S2,-},其中St为来自于数据集提取的单词.训练的目标是使最大似然p(S|I)取得最大值,即使生成的语句和目标语句更加匹配,也可以表达为用尽可能准确的用语句去描述图像. Image Caption主要研究分为以下几个方向: 1…
我在学习条件随机场的时候经常有这样的疑问,crf预测当前节点label如何利用其他节点的信息.crf的训练样本与其他的分类器有什么不同.crf的公式中特征函数是什么以及这些特征函数是如何表示的.在这一章中,我将在CRF++源码中寻找答案. 输入过程 CRF++训练的入口在crf_learn.cpp文件的main函数中,在该函数中调用了encoder.cpp的crfpp_learn(int argc, char **argv)函数.在CRF++中,训练被称为encoder,显然预测就称为decod…
一.RPN锚框信息生成 上文的最后,我们生成了用于计算锚框信息的特征(源代码在inference模式中不进行锚框生成,而是外部生成好feed进网络,training模式下在向前传播时直接生成锚框,不过实际上没什么区别,锚框生成的讲解见『计算机视觉』Mask-RCNN_锚框生成): rpn_feature_maps = [P2, P3, P4, P5, P6] 接下来,我们基于上述特征首先生成锚框的信息,包含每个锚框的前景/背景得分信息及每个锚框的坐标修正信息. 接前文主函数,我们初始化rpn m…
一.什么是arff格式文件 1.arff是Attribute-Relation File Format缩写,从英文字面也能大概看出什么意思.它是weka数据挖掘开源程序使用的一种文件模式.由于weka是个很出色的数据挖掘开源项目,所以使用的比较广,这也无形中推广了它的数据存储格式. 2.下面是weka自带的一个arff文件例子(weather.arff) @relation weather @attribute outlook {sunny, overcast, rainy} @attribut…
Momenta详解ImageNet 2017夺冠架构SENet 转自机器之心专栏 作者:胡杰 本届 CVPR 2017大会上出现了很多值得关注的精彩论文,国内自动驾驶创业公司 Momenta 联合机器之心推出 CVPR 2017 精彩论文解读专栏.除此之外,Momenta 还受邀在 CVPR 2017 的 ImageNet Workshop 中发表演讲,介绍 Momenta 在ImageNet 2017 挑战赛中夺冠的网络架构SENet.本文作者为 Momenta 高级研发工程师胡杰. 我是 M…
配置文件 配置文件yolov3.cfg定义了网络的结构 .... [convolutional] batch_normalize=1 filters=64 size=3 stride=2 pad=1 activation=leaky [convolutional] batch_normalize=1 filters=32 size=1 stride=1 pad=1 activation=leaky [convolutional] batch_normalize=1 filters=64 size…
原文:https://blog.csdn.net/xunwei0303/article/details/53213130 目前,比较常用的实现Java导入.导出Excel的技术有两种Jakarta POI和Java Excel当前B/S模式已成为应用开发的主流,而在企业办公系统中,常常有客户这样子要求:你要把我们的报表直接用Excel打开(电信系统.银行系统).或者是:我们已经习惯用Excel打印.这样在我们实际的开发中,很多时候需要实现导入.导出Excel的应用. 下面我就分别讲解一下如何使用…