5.11线粒体和叶绿体是通过内共生进化而来的 初始细胞俘获有功能的真细菌(eubacteria)进入细胞内,该细菌逐渐演化为细胞器,这种现象称为内共生(endosymbiosis),所以该细胞器携带细菌的所有基因.依据基因序列比对,可知线粒体与叶绿体来源于不同世系(lineage)的不同真细菌.因为在演化过程中,真细菌环境发生了改变,所以真细菌的与独立生活有关的基因消失,同时基因被转移到细胞核内(因为部分编码细胞器基因来源于细胞核). 基于细胞器基因的转移,我们可以计算其转移速率,因为通常在细胞…

5.10叶绿体基因组编码多种蛋白质和RNA 叶绿体和线粒体的共同点:叶绿体和线粒体的大小,功能(编码区)大体一致,但叶绿体拥有更多基因,所以在编码tRNA时,也有内含子作为被剪切片段. 因为在原核生物仅拥有非断裂基因的时候,那时候没有叶绿体,此时发生共生事件(endosymbiosis),即一个有叶绿体功能的细菌进入了原核细胞,该细菌的原始intron是一个整体,一部分去做tRNA的反密码子环区了,一部分做编码蛋白质基因中的内含子,后来进化过程中基因断裂,逐步分化了. 叶绿体与线粒体的区别:因为…

想发好文章?先看好文献! 生物信息分析类的文章都有着比较明显的套路,如果你深刻的掌握了这些套路,相信有一天你也能发Nature(子刊). Extremotolerant tardigrade genome and improved radiotolerance of human cultured cells by tardigrade-unique protein 先了解基本背景: 水熊虫是一个非常值得研究的物种,虽然它不像主流作物的研究那么实用,但其近乎变态的耐受性确是人类梦寐以求的功能. 前…

DNA Sequence Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 19991   Accepted: 7603 Description It's well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it's very useful to analyze a segment of DNA Sequence,For ex…

生命组学 密码子使用偏向性是指同义密码子使用频率不同. 影响因素:1.GC2.横向基因转移3.selection 转录偏好于多的tRNA. 同种氨基酸但有密码子使用偏向. ====================== 发现密码子偏性的方法: 参考序列方法reference-based measure CAI:从0到1,0就是偏向性最小,1就是偏向性最大. Fop RSCU E(g) 问题:1.参考集定义不清楚 Distribution-based measure Nc Nc’:bias程度max…

目录 说明 1.前言 2.植物GS瓶颈 3.提高GS预测的准确性 4.GS与现代育种技术结合 5.GS开源育种网络 说明 Enhancing Genetic Gain through Genomic Selection: From Livestock to Plants 这篇是徐云碧老师2019年发表在<Plant Communications>上的综述.徐老师是农科院作科所以及CIMMYT的分子育种专家,著有<分子数量遗传学>和<分子植物育种>,提出环境型.遗传增益等…