进行数据初步处理(perl) 统计amplicon的RC(read counts),并且相互overlap大于75%的amplicon合并起来 统计每个amplicon的GC含量,均值, 性别识别并校正,文库大小.长度.GC含量标准化 文库大小标准化 某个sample的文库大小(read counts * amplicon length) / 平均每个ampicon文库大小(sum(read counts * amplicon length) / amplicon size)) 标准化前 标准化…

前期处理 perl脚本统计RC(RC(read counts)) 读入control baseline 和 sigma(最后baseline 预测的mad值) 将gc < 0.28或gc > 0.68,sigma乘上1.5,后来又乘以6,对于小于0.01或者大于0.99分位数,sigma取0.01和0.99分位点的sigma 将sigma转化为权重,SigmaForWeights = 1/sigma^2/max(1/sigmaforWeithts^2) 根据mu值设置一些outlier的amp…

作业链接 个人作业--软件产品案例分析 评分细则 本次个人项目分数由两部分组成(课堂得分(老师/助教占比60%,学生占比40%)满分40分+博客分满分60分) 课堂得分和博客得分表 评分统计图 千帆竞发图 总结 旅法师:有针对与市面上其他产品做比较,设计功能较为合理,描述可以再充分一些. 拼应:格式规范,分点明确,内容详尽,bug数较多. 圆桌:找出的问题较多,PPT简洁明了. 七彩拼图: 内容较少,不够完善,答辩人声音不够洪亮. 高校:分析和调研的较为详尽,思路清晰,重点明确. 小鱼记账:将学…

本书基本信息 丛书名:安全技术大系 作者:王清(主编),张东辉.周浩.王继刚.赵双(编著) 出版社:电子工业出版社 出版时间:2011-6-1 ISBN:9787121133961 版次:1 页数:753 字数:780000 印刷时间:2011-6-1 开本:16开 纸张:胶版纸 印次:1 包装:平装 书籍封面 watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvaW9pb19qeQ==/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0J…

网上有很多解析laravel中间件的实现原理,但是不知道有没有读者在读的时候不明白,作者是怎么想到要用array_reduce函数的? 本文从自己的角度出发,模拟了如果我是作者,我是怎么实现这个中间件功能,又是怎么找到并使用对应的函数. 什么是laravel中间件 Laravel 中间件提供了一种机制在不修改逻辑代码的情况下,中断原本程序流程,通过中间件来处理一些事件,或者扩展一些功能.比如日志中间件可以方便的记录请求和响应日志,而不需要去更改逻辑代码. 那么我们简化一下软件执行过程,现在有一个…

软件案例分析--VS和VS Code 第一部分 调研,测评 一.使用10–30分钟这个软件的基本功能(请上传使用软件的照片) VS code Visual Studio 二.主要功能和目标用户有何不同,描述使用这个产品的过程,解决了用户的问题么? VS是个一系列开发套件,vscosde是一个编译器 VS是Microsoft 开发的一系列的开发套件,是一个完整的开发工具集,包含了软件开发中所需要的大多数工具,例如UML工具,代码管理工具,IDE等. vscode是一个单纯的编译器,专注于开发者最常…

软件产品案例分析--K米 第一部分 调研,评测 评测 个人第一次上手体验 使用的第一款点歌软件,以为就是个遥控而已,使用后发现功能还挺多,能点挺久.觉得很方便,不用挤成一堆点歌了.K米的脸蛋(UI)好看,格调我喜欢. BUG Bug1.微信授权登录,授权了非直接登录而是跳到输入手机号获取验证码,那这授权登陆就没有意义.其次不提交手机号和验证码就不让返回,感觉不是bug,但个人认为不合理. Bug2.在"模仿"菜单里面点歌,一直(刷新.重登)都是显示点播失败,但仍然出现在已点歌列表.有时…

软件改进分析 在此基础上,进行软件的改进. 首先,我们把这个软件理解成一个投入市场的.帮助小朋友进行算术运算练习的APP. 从质量保证的角度,有哪些需要改进的BUG? 从用户的角度(把自己当成小学生或真的请小学生帮忙),需要在哪些方面进行改进? 从产品的角度(软件的市场定位.推广方式.盈利模式等),我们要对现有软件做些什么手脚? 从开发者的角度,在架构.算法.技术实现.可扩展性.代码规范等方面可以怎样优化? ...... 参考但并不限于以上几条,列出你们觉得需要改进的地方及理由.(博客) 并尽可…

软件改进分析 在此基础上,进行软件的改进. 首先,我们把这个软件理解成一个投入市场的.帮助小朋友进行算术运算练习的APP. 从质量保证的角度,有哪些需要改进的BUG? 从用户的角度(把自己当成小学生或真的请小学生帮忙),需要在哪些方面进行改进? 从产品的角度(软件的市场定位.推广方式.盈利模式等),我们要对现有软件做些什么手脚? 从开发者的角度,在架构.算法.技术实现.可扩展性.代码规范等方面可以怎样优化? ...... 参考但并不限于以上几条,列出你们觉得需要改进的地方及理由.(博客) 并尽可…

鉴于我们寝室都热衷于手游,所以本次热门软件创新分析我就来分析一下几款热门的抽卡型手游.   阴阳师(后文简称YYS)——剧情画风唯美,配音引人入胜 作为网易公司研发的一款3D日式和风回合制游戏,YYS在2016年6月发布.作为一款不折不扣的抽卡型游戏,他以其唯美精致的画风和流畅感人的剧情引人入胜.我的室友们很快入了坑(指上手玩游戏),并且深深为之吸引.当时市面上的抽卡型手游在绘画和故事上总是不能得兼,YYS成为了几乎唯一一款能够同时满足玩家需求的游戏而风靡一时.并且为了吸引大量对日本动漫着迷的玩…

一.分类 1.内部排序和外部排序 内部排序:待排序记录存放在计算机随机存储器中(说简单点,就是内存)进行的排序过程. 外部排序:待排序记录的数量很大,以致于内存不能一次容纳全部记录,所以在排序过程中需要对外存进行访问的排序过程. 2.比较类排序和非比较排序 比较类排序:通过比较来决定元素间的相对次序,由于其时间复杂度不能突破O(nlogn),因此也称为非线性时间比较类排序. 非比较类排序:不通过比较来决定元素间的相对次序,它可以突破基于比较排序的时间下界,以线性时间运行,因此也称为线性时间非比较…

一.动图演示 二.思路分析 先来了解下堆的相关概念:堆是具有以下性质的完全二叉树:每个结点的值都大于或等于其左右孩子结点的值,称为大顶堆:或者每个结点的值都小于或等于其左右孩子结点的值,称为小顶堆.如下图: 同时,我们对堆中的结点按层进行编号,将这种逻辑结构映射到数组中就是下面这个样子 该数组从逻辑上讲就是一个堆结构,我们用简单的公式来描述一下堆的定义就是: 大顶堆:arr[i] >= arr[2i+1] && arr[i] >= arr[2i+2]   小顶堆:arr[i]…

一.动图演示 二.思路分析 希尔排序是把记录按下标的一定增量分组,对每组使用直接插入排序算法排序:随着增量逐渐减少,每组包含的关键词越来越多,当增量减至1时,整个文件恰被分成一组,算法便终止. 简单插入排序很循规蹈矩,不管数组分布是怎么样的,依然一步一步的对元素进行比较,移动,插入,比如[5,4,3,2,1,0]这种倒序序列,数组末端的0要回到首位置很是费劲,比较和移动元素均需n-1次. 而希尔排序在数组中采用跳跃式分组的策略,通过某个增量将数组元素划分为若干组,然后分组进行插入排序,随后逐步缩…

一.动图演 二.思路分析 基数排序第i趟将待排数组里的每个数的i位数放到tempj(j=1-10)队列中,然后再从这十个队列中取出数据,重新放到原数组里,直到i大于待排数的最大位数. 1.数组里的数最大位数是n位,就需要排n趟,例如数组里最大的数是3位数,则需要排3趟. 2.若数组里共有m个数,则需要十个长度为m的数组tempj(j=0-9)用来暂存i位上数为j的数,例如,第1趟,各位数为0的会被分配到temp0数组里,各位数为1的会被分配到temp1数组里...... 3.分配结束后,再依次从…

一.动图演示 二.思路分析 归并排序就是递归得将原始数组递归对半分隔,直到不能再分(只剩下一个元素)后,开始从最小的数组向上归并排序 1.  向上归并排序的时候,需要一个暂存数组用来排序, 2.  将待合并的两个数组,从第一位开始比较,小的放到暂存数组,指针向后移, 3.  直到一个数组空,这时,不用判断哪个数组空了,直接将两个数组剩下的元素追加到暂存数组里, 4.  再将暂存数组排序后的元素放到原数组里,两个数组合成一个,这一趟结束. 根据思路分析,每一趟的执行流程如下图所示: 三.负杂度分析…

一.动图演示 二.思路分析 快速排序的思想就是,选一个数作为基数(这里我选的是第一个数),大于这个基数的放到右边,小于这个基数的放到左边,等于这个基数的数可以放到左边或右边,看自己习惯,这里我是放到了左边, 一趟结束后,将基数放到中间分隔的位置,第二趟将数组从基数的位置分成两半,分割后的两个的数组继续重复以上步骤,选基数,将小数放在基数左边,将大数放到基数的右边,在分割数组,,,直到数组不能再分为止,排序结束. 例如从小到大排序: 1.  第一趟,第一个数为基数temp,设置两个指针left =…

一.简介 市面上的编辑器纷繁复杂各有优点,好用的编辑器能让你工作事半功倍,先简单介绍下本文主角Sublime Text编辑器,下面简称Sublime. 1.可用于 Windows.Mac OS X 和 Linux 系统(本文讲解均为windows平台). 2.免费试用,且免费时间没限制,它只会偶尔友好地弹个窗口,提醒我付费,当然你花个70美元买个完整的许可证就没事了. 3.优点:(很多人性化编辑器都有)随时保留文件的修改,智能选择.修改.搜索,自动补全等等,还有快捷键插件等之后更新. 二.安装…

2018-8-16JWTtoken用户登录认证思路分析9502751 JWT token在商城中的实现 class UserView(CreateAPIView): serializer_class = CreateUserSerializer 创建用户对象的视图函数,调用序列化器中的create方法来实现用户的保存 class CreateUserSerializer(serializers.ModelSerializer): """ 创建用户序列化器具 "&qu…

一.动图演示 二.思路分析 例如从小到大排序: 1.  从第二位开始遍历, 2.  当前数(第一趟是第二位数)与前面的数依次比较,如果前面的数大于当前数,则将这个数放在当前数的位置上,当前数的下标-1, 3.  重复以上步骤,直到当前数不大于前面的某一个数为止,这时,将当前数,放到这个位置, 1-3步就是保证当前数的前面的数都是有序的,内层循环的目的就是将当前数插入到前面的有序序列里 4.  重复以上3步,直到遍历到最后一位数,并将最后一位数插入到合适的位置,插入排序结束. 根据思路分析,每一趟…

一.动图演示 二.思路分析 1.  相邻两个数两两相比,n[i]跟n[j+1]比,如果n[i]>n[j+1],则将连个数进行交换, 2.  j++, 重复以上步骤,第一趟结束后,最大数就会被确定在最后一位,这就是冒泡排序又称大(小)数沉底, 3.  i++,重复以上步骤,直到i=n-1结束,排序完成. 三.负杂度分析 1.  不管原始数组是否有序,时间复杂度都是O(n2), 因为没一个数都要与其他数比较一次,(n-1)2次,分解:n2+2n-1,  去掉低次幂和常数,剩下n2,所以最后的时间复杂…

一.动图演示 二.思路分析 1.  第一个跟后面的所有数相比,如果小于(或小于)第一个数的时候,暂存较小数的下标,第一趟结束后,将第一个数,与暂存的那个最小数进行交换,第一个数就是最小(或最大的数) 2.  下标移到第二位,第二个数跟后面的所有数相比,一趟下来,确定第二小(或第二大)的数 重复以上步骤 直到指针移到倒数第二位,确定倒数第二小(或倒数第二大)的数,那么最后一位也就确定了,排序完成. 三.负杂度分析 1.  不管原始数组是否有序,时间复杂度都是O(n2), 因为没一个数都要与其他数比…

最近因为工作需要在看0day的软件漏洞分析,发现这本<0day安全软件漏洞分析技术(第2版)>真是本好书,唯一缺点就是书上的环境是Windows XP 32Bit的,基于现状难以进行实践,于是笔者打算使用紧跟潮流但又尽量满足书上的环境——Windows 10 Profession 32Bit,希望对大家学习有所帮助. 一.环境以及要用的软件 系统:Windows 10 Profession 软件:UltraEdit.LordPE.OllyDBG.VC++ 6.0.IDA Pro 下图作者的系统…

题目 There is a public bike service in Hangzhou City which provides great convenience to the tourists from all over the world. One may rent a bike at any station and return it to any other stations in the city. The Public Bike Management Center (PBMC)…

题目 Programming Ability Test (PAT) is organized by the College of Computer Science and Technology of Zhejiang University. Each test is supposed to run simultaneously in several places, and the ranklists will be merged immediately after the test. Now i…

本文主要阐述软件性能测试中的一些调优思想和技术,节选自作者新书<软件性能测试分析与调优实践之路>部分章节归纳. 在国内互联网公司中,Web中间件用的最多的就是Apache和Nginx这两款了,包括很多大型电商网站淘宝.京东.苏宁易购等,都在使用Nginx或者Apache作为Web中间件.而且很多编程语言在做Web开发时,会将Apache或者Nginx作为其绑定的固定组件,比如php语言做Web开发时,就经常和Apache联系在一起,使得apche成为了php在Web开发时的一个标配.而Ngin…

摘要:本文介绍了SCA技术的基本原理.应用场景,业界TOP SCA商用工具的分析说明以及技术发展趋势:让读者对SCA技术有一个基本初步的了解,能更好的准确的应用SCA工具来发现应用软件中一些安全问题,从而帮助提升软件安全质量. 1.什么是SCA SCA(Software Composition Analysis)软件成分分析,通俗的理解就是通过分析软件包含的一些信息和特征来实现对该软件的识别.管理.追踪的技术.我们知道在当今软件开发中,引入开源软件(注1)到你的项目中,避免重复造轮子是大家都再熟…

写在前面 项目 内容 所属课程 2020春季计算机学院软件工程(罗杰 任健) (北航) 作业要求 软件案例分析 课程目标 培养软件开发能力 本作业对实现目标的具体作用 对案例进行分析以学习软件开发的经验 本次作业,我分析的产品是博客园班级博客. 第一部分 调研,评测 1.基本功能使用体验 (1)由于之前一直以学生的身份来使用博客园班级博客的,故在此体验了一下以老师/助教身份来使用博客园班级博客功能. 创建班级 登陆后,无需教师认证等信息,就成功地创建了一个班级. 发布作业 这边比个人博客编辑要好…

项目 内容 课程:北航-2020-春-软件工程 博客园班级博客 要求:分析软件案例 个人博客作业-软件案例分析 班级 005 这个作业在哪个具体方面帮助我实现目标 分析对比一类软件,学会规划分析软件的步骤和设计衡量方式 前言 班级博客中提及了幸存者偏差 (Survivorship bias) ,指筛选信息的过程本身,而非筛选信息的方式造成了关键信息的丢失.旨在告诉我们那些"失败者"."淘汰者"往往比"幸存者"."成功者"提供更…

项目 内容 课程:2020春季软件工程课程博客作业(罗杰,任健) 博客园班级链接 作业:BUAA软件工程结对编程项目作业 作业要求 课程目标 学习大规模软件开发的技巧与方法,锻炼开发能力 作业目标 个人软件案例分析作业 教学班 周五上午006班 第一部分 安装并部署软件 visual studio code 安装 visual studio code 是一款轻量级的代码编辑IDE,安装十分简单,仅需要到官网选择下载对应的安装包,打开安装包后根据安装步骤一步一步操作即可.安装包需要选择对应系统,笔…

项目 内容 这个作业属于哪个课程 2020春季计算机学院软件工程(罗杰 任建) 这个作业的要求在哪里 个人博客作业-软件案例分析 我在这个课程的目标是 完成一次完整的软件开发经历并以博客的方式记录开发过程的心得掌握团队协作的技巧做出一个优秀的.持久的.具有实际意义的产品 这个作业在哪个具体方面帮助我实现目标 尝试着分析一个软件学会规划分析软件的步骤和设计衡量方式 教学班级 006 简介 本文主要介绍邹欣老师团队的一项OCR识别表单的开源工作,并与同类型的轻量级OCR文本识别软件进行对比测试和分析…