Ensembl突变数据描述之（一）——突变物种数据库及预测工具

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Ensembl突变数据描述之（一）——突变物种数据库及预测工具

以下是对Ensembl突变数据库中储存的数据的描述,对于Ensembl数据库中不同的物种,我们从各种来源(例如,dbSNP数据库)导入突变数据(SNP.CNV.等位基因频率.基因型等),导入的突变数据和等位基因经过质量控制过程来标记可疑数据. 我们将突变分成几个不同的类,并计算突变的预测结果,并且我们还创建了突变集以帮助人们从特定数据集中检索特定突变体组. 我们计算了人类每个突变在种群中的连锁不平衡. 突变数据类型 Ensembl突变数据库储存了从外部导入的数据以及就算得来的数据. 外部导入的数…

Python数据描述与分析

在进行数据分析之前,我们需要做的事情是对数据有初步的了解,比如对数据本身的敏感程度,通俗来说就是对数据的分布有大概的理解,此时我们需要工具进行数据的描述,观测数据的形状等:而后才是对数据进行建模分析,挖掘数据中隐藏的位置信息.怒气按在数据描述和简单分析方面做得比较好的是Pandas库.当然,它还需要结合Numpy.Scipy等科学计算相关库才能发挥功效. Pandas数据结构在进行Pandas相关介绍时,我们首先需要知道的是Pandas的两个数据结构(即对象)Series和DataFrame,…

python - 数据描述符(class 内置 get/set/delete方法 )

数据描述符(class 内置 get/set/del方法 ): # 什么是描述符 # 官方的定义:描述符是一种具有“捆绑行为”的对象属性.访问(获取.设置和删除)它的属性时,实际是调用特殊的方法(_get_(), # _set_(),_delete_()).也就是说,如果一个对象定义了这三种方法的任何一种,它就是一个描述符. # 更多的理解: # 通常情况下,访问一个对象的搜索链是怎样的?比如a.x,首先,应该是查询 a._dict_[‘x’],然后是type(a)._dict_[‘x’],一直…

python小知识-属性查询优先级（如果有同名类属性、数据描述符、实例属性存在的话，实例>类>数据描述符）

https://www.cnblogs.com/Jimmy1988/p/6808237.html https://segmentfault.com/a/1190000006660339 https://blog.csdn.net/u013679490/article/details/54767152 1.getattribute() 无条件调用 2.数据描述符(定义了__get__\__set__方法的类的实例) --由1的getattribute()调用[注,会将数据描述符转换成:当前类名._…

[py]数据描述符优先级

实例查找属性的顺序: 类属性 > 数据描述符 > 实例属性 > 非数据描述符 > __getattr__ 类属性>数据描述符>实例属性 class Str: def __get__(self, instance, owner): print("执行: __get__") def __set__(self, instance, value): print("执行: __set__") def __delete__(self, ins…

python数据描述符

Python的描述符是接触到Python核心编程中一个比较难以理解的内容,自己在学习的过程中也遇到过很多的疑惑,通过google和阅读源码,现将自己的理解和心得记录下来,也为正在为了该问题苦恼的朋友提供一个思考问题的参考,由于个人能力有限,文中如有笔误.逻辑错误甚至概念性错误,还请提出并指正. 2.什么是描述符 Python 2.2 引进了 Python 描述符,同时还引进了一些新的样式类,但是它们并没有得到广泛使用.Python 描述符是一种创建托管属性的方法.描述符具有诸多优点,诸如:保护属…