增强采样软件PLUMED的安装与使用】的更多相关文章

技术背景 增强采样(Enhanced Sampling)是一种在分子动力学模拟中常用的技术,其作用是帮助我们更加快速的在时间轴上找到尽可能多的体系结构及其对应的能量.比如一个氢气的燃烧反应,在中间过程中会产生众多的反应产物,但是我们光从结果来看的话,就是从\(H_2\)加\(O_2\),经过燃烧以后变成了\(H_2O\),那么中间的过程就被我们全部忽略了.实际上化学反应是一个整体的过程,是非常复杂的,如果要控制一个化学反应的过程,或者制备某个中间态的产物,或者需要提升最终预期产物的占比,我们不得…
用 Ubuntu 安装输入法软件包时提示"需要安装不能信任的软件包","这个动作需要从没有授权的软件源来安装软件包",赋予权限执行仍然无法安装,上网查了一下,只需要升级一下软件源列表(在终端下执行 sudo apt-get update ,需要保持联网)再执行安装即OK…
PfSense基于BSD的软件防火墙的安装.配置与应用 PfSense是一个FreeBSD下的免费开源的防火墙和路由器软件,他为了在X86平台上面建立一个高集成性的防火墙项目,下面就为大家展示如何配置应用. 安装:http://video.sina.com.cn/v/b/73333887-1443650204.html 配置:http://you.video.sina.com.cn/b/73331652-1443650204.html 应用:http://video.sina.com.cn/v/…
打包的时候,经常需要安装一些其它的环境库,而又不想让用户繁锁的去选择,这时就需要静默安装,而不同的文件所加的参数了不一致,比如VS的环境库vcredist_x86.exe(这是32位的环境库)后面加/q即可完成静默安装,而NSIS打包的文件使用/q是不行的,查了相关的资料得使用/S(这里要大写),其它格式的文件参考下面的转载内容: --------------------------------------------------华丽的分割线---------------------------…
网络运维必回的模拟器-GNS软件下载和安装 作者:尹正杰  版权声明:原创作品,谢绝转载!否则将追究法律责任. 一.GNS简介 1>.什么是GNS GNS3是一款具有图形化界面可以运行在多平台(包括Windows, Linux, and MacOS等)的网络虚拟软件.Cisco网络设备管理员或是想要通过CCNA,CCNP,CCIE等Cisco认证考试的相关人士可以通过它来完成相关的实验模拟操作.同时它也可以用于虚拟体验Cisco网际操作系统IOS或者是检验将要在真实的路由器上部署实施的相关配置.…
RAMPS1.4 3D打印控制板:软件下载\连接\安装\测试 特别说明: 电源接反,电机驱动板接反将有可能烧毁芯片和电路,请再三确认后再进行通电. 如何使用: 1.需要用到的模块或器件: Arduino Mega2560 主控板(该套件包含):这是3d打印机的大脑,负责控制整个打印机来完成特定的动作,如打印特定的文件等: RAMPS1.4 (该套件包含):这是上面主控板的拓展板,有它是为了更好的与其它硬件进行连接和控制的,起到过渡桥梁的作用: A4988步进电机驱动板(该套件包含):这是用来连接…
今天来说下在CentOS下下载软件,不安装的方法: 方法一:通过yum自带一个工具:yumdownloader[root@web1 ~]#  rpm -qa |grep yum-utils[root@web1 ~]# yum -y install yum-utils*[root@web1 ~]# rpm -ql yum-utils/usr/bin/debuginfo-install/usr/bin/package-cleanup/usr/bin/repo-graph/usr/bin/repo-r…
第一步:拆机改装 最近想换个固态硬盘提提速度,就买了个,然后拧下后盖螺丝,将键盘盖拿下,中间有两个根线连着把扣打开就可以了,将新的固态硬盘装到原本的机械硬盘的地方,又买了个光驱托盘改装位将光驱位装上了原本的那个机械.改装完成. 第二步:重装系统 做启动U盘:下载一个类似老毛桃的安装程序和系统文件在U盘里,然后开机进入F2(我的是华硕,其他笔记本可能不一样)进入BIOS,将开机启动设置为U盘启动,再按F10保存退出即可进入安装程序系统.如图 选择分区工具对硬盘进行分区,我分了100G给C盘当系统盘…
Ubuntu下查看软件版本及安装位置 查看软件版本:     aptitude show xxx 也可用apt-show-versions (要先安装sudo apt-get install apt-show-versions) 查看软件安装位置:dpkg -L xxxx 查看软件是否安装:dpkg -l | grep filename…
EPEL (Extra Packages for Enterprise Linux)是基于Fedora的一个项目,为“红帽系”的操作系统提供额外的软件包,适用于RHEL.CentOS和Scientific Linux. CentOS默认自带CentOS-Base.repo源,但官方源中去除了很多有版权争议的软件,而且安装的软件也不是最新的稳定版.Fedora自带的源中也找不到很多多媒体软件,如果需要安装,必需先添加其他源. EPEL源 EPEL,即Extra Packages for Enter…
系统安装 + WinScp客户端连接 + 防火墙端口号iptables + Nginx编译安装 + MySQL编译安装 + Redis编译安装 + MongoDB编译安装 + ActiveMQ/RocketMQ/RabbitMQ编译安装 + ...各类常用生产环境软件的编译安装 ...Spring Boot项目手动部署 + Jenkins自动化持续构建 + Docker部署 说明:本篇将记录日常开发工作所用到的Linux操作技能,可定义为速成版的<九阴真经>…
   西门子软件sinutrain-for-sinumerik-operate-v4.8安装报错的处理 安装时报错提示: 原因: 可能缺少某些文件 处理: 安装 海康ivms-4200后,可直接安装西门子软件 再次处理:  按以上方法安装后,菜单灰色,有些无法使用, 后用虚拟机重装安装win7 64位后,再安装SIEMENS完全正常. 正常界面如下:…
关闭页面特效     linux中安装python   1.首先切换目录 大型的软件一定要安装在/ opt中  规范 cd /opt 2.下载python3的源码 wget https://www.python.org/ftp/python/3.6.2/Python-3.6.2.tgz 3.安装依赖包很重要,以后在用python的时候会出现的各种问题基本上都是依赖包没有安装全 yum install gcc patch libffi-devel python-devel zlib-devel b…
Websoft9 在进行开源软件的集成与自动化安装研究过程中发现有些软件有CLI安装模式,例如Gitlab CLI版本.Ghost CLI.PHP CLI等,CLI安装是什么意思? CLI(Command-Line Interface),即命令行界面,与之对应的是图形化用户界面,就是通过命令跟系统(软件)进行交互,例如Linux 和Windows的PowerShell. 软件的CLI安装,就是软件提供了一套自己的执行命,通过命令实现某些操作. 本文由Websoft9原创发布,转载请注明出处.…
一.简介 最近一直在测试使用域组策略自动部署软件,效果并不理想.首先,主机必须加入域才能让策略生效.其实是Windows Server 2012 R2只支持.msi格式的安装包,所以部署前需将软件重新封装:使用“已分配”选项,软件没有创建快捷方式,只能在“控制面板—程序”里面添加. 静默安装又称为无人值守安装,软件以默认值自动进行安装.将软件包放在共享,编写批处理可批量自动安装网络上的软件,重装系统后一键装机!实现原理很简单,就是软件打包程序预留了安装参数,安装时可加上.当查不到或没预留静默安装…
上面简单列出了源码安装的sls文件书写思路. 涉及到一些固定的思路:如, 1,拷贝 解压安装时候需要依赖tar.gz存在 如果已安装则无需再次安装. 2,启动脚本 加入chk时候需要文件存在,如果已添加,则无需再次添加 3,服务管理 除了有启动脚本,还要watch配置文件.   晚上睡前早上起来多撸几遍基本的软件安装就可以自己写了.下面是源码安装nginx.涉及到基础依赖包安装(yum安装),以及pcre安装(源码安装)和nginx(源码安装) 其中有些坑,调整了老半天才搞好,甚是蛋疼,要注意图…
最近在处理遥感影像的时候遇见了MODIS影像数据,从中MOD13中提取NDVI是相当的重要.在一番的百度之中找到了处理modis影像的神器------MRT 接下来我来说明一下MRT的具体安装,如果之前没有接触过这个软件的话学学是相当的必要的. 第一步:就是MRT的下载,网络上很多,大多数能用.我使用的的是:http://pc6.com//softview/SoftView_96098.html. 第二步:进行解压,MRT使用的前提是必须有Java的jre包,如果之前开发过Android或者安装…
查看软件版本:aptitude show xxx 也可用apt-show-versions (要先安装sudo apt-get install apt-show-versions) 查看软件安装位置:dpkg -L xxxx 查看软件是否安装:dpkg -l | grep filename…
1.rpm包安装的,可以用rpm -qa看到,如果要查找某软件包是否安装,用 rpm -qa | grep “软件或者包的名字”. [root@hexuweb102 ~] rpm -qa | grep ruby 2.以deb包安装的,可以用dpkg -l能看到.如果是查找指定软件包,用dpkg -l | grep “软件或者包的名字”: [root@hexuweb102~]dpkg-l|grepruby 3.yum方法安装的,可以用yum list installed查找,如果是查找指定包,命令…
一.缘由 想在centos6.6上安装zabbix-agent,可是yum search 之后没有,又不想二进制安装,所以就找各种在线安装方法. 二.解决办法 思路: 1.尝试更新对应版本最新的yum源,并重新缓存yum仓库.(一般没用,因为163等源基本和官方一样,只是提供更快的下载速度) 2.用rpm添加一个该软件官方的yum源. 3.安装第三方yum源,如EPEL源.RPM Fusion源.RepoForge源(有很多软件包可用,比如QQ,sougoupinyin.sublime等). 对…
目录: 0.相关基本命令    1.安装软件    2.卸载软件    3.打开软件  0.相关基本命令 与软件操作相关的主要命令有:dpkg  和 apt-get . dpkg   : “dpkg ”是“Debian Packager ”的简写.为 “Debian” 专门开发的套件管理系统,方便软件的安装.更新及移除.所有源自“Debian”的“Linux ”发行版都使用 “dpkg”,例如 “Ubuntu”.“Knoppix ”等 . apt-get:适用于deb包管理式的操作系统,主要用于…
http://support.microsoft.com/kb/976832/zh-cn http://support.microsoft.com/kb/976832/zh-tw 症状 当智能卡插入智能卡阅读器后时,Windows 尝试下载并安装智能卡 minidrivers 通过插服务卡.如果自定义的加密服务提供程序未在系统上安装智能卡的驱动程序在任一预配置位置,如 Windows 更新. WSUS 或 intranet 路径不可用,在通知区域中将收到以下错误消息: 未能成功安装设备驱动程序软…
重装linux后 软件都没了. 这些是要做的: (1):升级软件源 sudo gedit  /etc/apt/source.list 打开后ctrl c 下面的源 ##网易的源(163源,无论是不是教育网,速度都很快)deb http://mirrors.163.com/ubuntu/ raring main universe restricted multiversedeb-src http://mirrors.163.com/ubuntu/ raring main universe rest…
1.下载MACS软件安装包(作者的系统为Ubuntu) 网址链接:http://liulab.dfci.harvard.edu/MACS/ 2.解压文件: tar -zxvf MACS**.tar.gz 3.更改文件夹的名字(个人习惯) mv MACS1.1-4 MACS 4.进入到MACS软件包 cd MACS 5.利用超级权限进行安装(这样做的话,好像不用自己再添加环境变量) sudo python setup.py install 6.验证安装的结果 macs14 -h 如果返回帮助信息,…
下文仅针对TASKCTL4.5有效,在执行安装程序后,会看到安装程序有4个选项,其中,1和2是需要了解的. 1, 典型安装: 这个选项是单机部署,在第一次使用TASKCTL的时候,我用的是这种安装方式,安装起来非常省心.后来了解到它会自动的把一个Server节点和字符界面客户端安装好,这样我们就能够快速体验软件,同时,也会提示用户安装TASKCTL制作的一些范例,很多在文档没有描述清楚的技术细节,这里都有说明. 2, 产品自定义安装: 这个选项在联机部署时会用到,当然,也可以用作单机部署.它需要…
Web开发入门 软件的结构: C/S (Client - Server  客户端-服务器端) 典型应用:QQ软件 ,飞秋,红蜘蛛. 特点: 1)必须下载特定的客户端程序. 2)服务器端升级,客户端升级. B/S (Broswer -Server 浏览器端- 服务器端) 典型应用: 腾讯官方(www.qq.com)  163新闻网站,(俗称:网站) 特点: 1)不需要安装特定的客户端(只需要安装浏览器即可!!) 2)服务器端升级,浏览器不需要升级!!!! javaweb的程序就是b/s软件结构!!…
感谢燕十八,的Linux的基础进阶视频 来哥:应该是装的wineQQ,它用的12年的国际版,ubuntu的这个版本应该比较好用! [3]apt-get 用Linux apt-get命令的第一步就是引入必需的软件库,Debian的软件库也就是所有Debian软件包的集合,它们存在互联网上的一些公共站点上.把它们的地址加入,apt-get就能搜索到我们想要的软件./etc/apt/sources.list是存放这些地址列表的配置文件,其格式如下: deb [web或ftp地址] [发行版名字][ma…
  因为linux安装软件的方式比较多,所以没有一个通用的办法能查到某些软件是否安装了.总结起来就是这样几类: 1.rpm包安装的,可以用rpm -qa看到,如果要查找某软件包是否安装,用 rpm -qa | grep “软件或者包的名字”. 1 [root@hexuweb102 ~] rpm -qa | grep ruby 2.以deb包安装的,可以用dpkg -l能看到.如果是查找指定软件包,用dpkg -l | grep “软件或者包的名字”: 1 [root@hexuweb102~]dp…
hackbar是Firefox的经典插件之一.介绍如下(懒得翻译了) This toolbar will help you in testing sql injections, XSS holes and site security. It is NOT a tool for executing standard exploits and it will NOT teach you how to hack a site. Its main purpose is to help a develop…
软件安装 1.如何上传安装包到服务器**可以使用图形化工具,如: filezilla**可以使用sftp工具: alt+p 调出后,用put命令上传上传(如果不cd指定目录,则上传到当前用户的主目录):sftp> cd /home/ sftp> put D:\All_Downloads\BaiduYunDownload\chuanzhiboke大数据\视频\day02\day02\soft\jdk-7u45-linux-x64.tar.gz下载(lcd指定下载到本地的目标路径)sftp>…