大家好,本周分享的是发表在Molecular & Cellular Proteomics. 上的一篇关于蛋白质组学样本质谱分析前处理方法改进的文章,题目是Protein aggregation capture on microparticles enables multi- purpose proteomics sample preparation,通讯作者是丹麦哥本哈根大学的Jesper V. Olsen. 对于蛋白质组学研究人员来说,在进行质谱分析之前,一个良好的蛋白样本制备方法可以有效降低…

期刊:Mol Cell Proteomics 题目:Celastrol protects from cholestatic liver injury though modulation of SIRT1-FXR signaling 通讯作者及单位:Fei Li, State Key Laboratory of Phytochemistry and Plant Resources in West China,Kunming Institute of Botany, Chinese Academy…

题目:Associations of the Fecal Microbial Proteome Composition and Proneness to Diet-induced Obesity 期刊:Mol Cell Proteomics IF:5.236 发表日期:2019年9月 单位:乔治亚州立大学生物医学科学研究所,加州大学圣地亚哥分校等 物种:小鼠 技术:16S rRNA,TMT 10-plex宏蛋白质组 一. 研究背景 高脂肪低纤维饮食促进肥胖的发展,尽管遗传因素在决定对这种致肥胖饮…

文献名:Elevated Hexokinase II Expression Confers Acquired Resistance to 4-Hydroxytamoxifen in Breast Cancer Cells(升高的己糖激酶II表达使得乳腺癌细胞获得对他莫昔芬的抗性) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年9月) IF:4.828 单位: 加州大学河滨分校 研究对象:乳腺癌细胞 技术:靶向蛋白组学   一. 概述: 本文应用了基于并行反应监测(PRM)…

文献名:Integration and analysis of CPTAC proteomics data in the context of cancer genomics in the cBioPortal 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:2019年9月 IF:4.828 作者: Pamela Wu1,2,3, Zachary J Heins4, James T Muller3, Lizabeth Katsnelson3, Ino de Br…

大家好,本次分享的是发表在Molecular & Cellular Proteomics上的一篇关于糖蛋白基因组学的文章,题目是Glycoproteogenomics: A Frequent Gene Polymorphism Affects the Glycosylation Pattern of the Human Serum Fetuin/α-2-HS-Glycoprotein,通讯作者是乌特勒支大学的Vojtech Franc和Albert J. R. Heck. 人胎球蛋白,也叫α-2…

文献名:利用靶向质谱策略进行上皮性卵巢癌病例的蛋白质组生物标志物研究 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年7月) IF:5.41 单位: 苏黎世联邦理工学院 美国东北大学 隆德大学 苏黎世大学附属医院 普渡大学 巴塞尔大学附属医院 巴赛尔大学生物医学系 法兰克福大学附属医院 哈佛医学院 斯科讷大学附属医院 苏黎世大学 物种:小鼠卵巢组织,小鼠卵巢肿瘤组织,人类血浆,人类卵巢组织,人类良性卵巢肿瘤组织,人类上皮卵巢癌组织 技术:非靶糖蛋白质…

大家好,本周分享的是发表在Molecular & Cellular Proteomics 上的一篇关于人胃肠道间质瘤亚群蛋白质组图谱的文章,题目是Proteomic maps of human gastrointestinal stromal tumor subgroups,通讯作者是四川大学生物治疗国家重点实验室的戴伦治. 胃肠道间质瘤(Gastrointestinal stromal tumor, GIST)是一种起源于胃肠道间叶组织的肿瘤,也是最为常见的胃肠道肉瘤(Gastrointest…

期刊:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:June 16, 2019 通讯作者:Michel Salzet,Isabelle Fournier 一.  概述 作者在大鼠不同脑区域构建中度受控皮质损伤模型(CCI),并在受损后不同时间段使用 空间分辨的蛋白质组学检测技术来观测创伤性脑损伤(TBI)中蛋白的量和质的改变.发现了已知与帕金森病(PD)有关的主要蛋白质家族的过度表达,(例如同侧黑质中的GPR158,HGMB1,突触结合蛋白和谷氨酸脱羧酶),因此揭示了…

大家好,本周分享的是发表在MCP(MOLECULAR&CRLLULAR PROTEOMICS)上的一篇关于质谱数据处理和识别的文章,题目是psims - A Declarative Writer for mzML and mzIdentML for Python,通讯作者是波士顿大学的Joseph Zaia. 质谱中数据处理和识别方法的激增导致需要描述其结果的工具的复杂性不断增加. 在过去的十五年中,两种质谱数据mzML 和mzIdentML ,已成为计算方法开发的核心. 目前有基于C/C++的…