Nr,GenBank, RefSeq, UniProt 数据库的异同 有的文章在做DEG分析时,会把reads比对到RefSeq的转录组上.我也没搞清楚这和直接比对到常规转录组上有什么区别. 文章:Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Dynamic Changes in lncRNA Expression during Reprogramming 方法:For differential expression analysis, we aligne…

Uniprot数据库是Universal Protein的英文缩写,是信息最丰富.资源最广的蛋白质数据库. UniprotKB由两部分组成: UniProtKB/Swiss-Prot 高质量的.手工注释的.非冗余的数据集,这些数据都是由质量保证的. UniProtKB/TrEMBL 该数据集包含高质量的计算分析结果,需要我们手工注释.     当我们搜索蛋白质时,就会如下显示多个蛋白质的信息:   Entry:是Uniprot给每个蛋白质赋予的独一无二的ID Entry name:是蛋白ID的简…

Uniprot 数据库是收录信息最全面的蛋白质数据库,包含swissport, uniparc, TrEMBL 3个子数据库: 其中swiss-prot 是手工核对过的 ,非冗余, 有详细注释信息的蛋白数据库,也是最常用的数据库: 该数据库收录了不同物种的蛋白信息,以人类为例, 数据库中可以看到如下的信息: http://www.uniprot.org/uniprot/?query=*&fil=organism%3A%22Homo+sapiens+%28Human%29+%5B9606%5D%2…

一.Hive简介 Hive是基于Hadoop的一个数据仓库工具,可以将结构化的数据文件映射为一张数据库表,并提供完整的sql查询功能,可以将sql语句转换为MapReduce任务进行运行.其优点是学习成本低,可以通过类SQL语句快速实现简单的MapReduce统计,不必开发专门的MapReduce应用,十分适合数据仓库的统计分析. Hvie是建立在Hadoop上的数据仓库基础架构.它提供了一系列的工具,可以用来进行数据提取转化加载(ETL),这是一种可以存储.查询和分析存储在Hadoop中的大规…

达梦数据库(DM6)和ORACLE 10g的异同点    https://bbs.aliyun.com/detail/351337.html   花花浪子 级别: 小白 发帖 0 云币 -41 加关注 写私信   只看楼主 更多操作楼主  发表于: 2017-03-24     比较惭愧,在当上本版版主后一直没有贡献一篇有营养的帖子,由于手上正好有达梦数据 DM6的版本,加上对ORACLE 10G比较熟悉,所以就这2种数据库的异同点做一个对比,也请大家不吝赐教. 对于达梦数据库,因为目前的工作是…

Peptide Sequence Databases蛋白序列的数据库 nrAll non-redundant GenBank CDS translations + RefSeq Proteins + PDB + SwissProt + PIR + PRF所有非冗余的的GenBank CDS区的翻译序列 + 参考序列的蛋白 + PDB数据库 + SwissProt蛋白数据库 + PRF蛋白数据库 refseqRefSeq protein sequences from NCBI’s Referenc…

NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国国家生物技术信息中心)除了维护GenBank核酸序列数据库外,还提供数据分析和检索资源.NCBI资源包括Entrez.Entrez编程组件.MyNCBI.PubMed.PudMed Central.PubReader.Gene.the NCBI Taxonomy Browser.BLAST.Pimer-Blast.COBALT.RefSeq.UniGene.HomoloGene.ProtES…

当我们一台电脑上创建了数据库想要转移到另外一台电脑上时,由于数据库处于联机状态,不能够对数据库文件进行复制和迁移,所以我们可以将数据库从服务器上分离出去,这样我们就可以复制数据库文件了.然后将数据库文件复制到另外一台电脑上,再将数据库文件附加进去. 1.分离与附加数据库的方式 (1)在试图下分离与附加数据库 分离数据库: 右击想要分离的数据库--->任务--->分离 选中红框位置,然后点击确定,刷新数据库,可以看到在数据库的对象资源管理器下已经看不到分离的数据库了. 附加数据库: 选中对象资源…

HGNC 全称为HUGO Gene Nomenclature Committee, 叫做 HUGO基因命名委员会,负责对人类基因组上包括蛋白编码基因, ncRNA基因,甲基因和其他基因在内的所有基因提供一个唯一的,标准的,可以广泛传播的symbol; 数据库的主页为 http://www.genenames.org/ 对于每个human的基因来说,在HGNC数据库中会有一个数字标识的唯一ID, 也会有一个唯一的symbol, HCNC数据库提供了免费下载的功能: 下载对应的链接,命令为 lftp…

为了更好的理解非关系型数据库,我又深入的度娘了下 原文地址:https://baijiahao.baidu.com/po/feed/share?wfr=spider&for=pc&context=%7B"sourceFrom"%3A"bjh"%2C"nid"%3A"news_3690540158463624329"%7D 本文共11000字,阅读全文约需30分钟. 本文为大家解析非关系型数据库(NoSQL).…