fastq-to-fasta转换及fasta拆分、合并】的更多相关文章

不会真的有人会去下载那些广告免费,实则要收会员费的黑心软件来进行PDF的拆分合并吧??? 在下载两个均不能免费实现PDF自由拆分.合并,以及PDF打印方式会增加文件大小的情况下,一个合格的程序员肯定不能向不良商家低头,所以使用PyPDF2实现这些功能,并给大家分享一个简单.易用.易懂的python小程序. from PyPDF2 import PdfFileReader, PdfFileMerger, PdfFileWriter def merge(input1,input2,output):…
格式转换: use awk :awk 'BEGIN{P=1}{if(P==1||P==2){gsub(/^[@]/,">");print}; if(P==4)P=0; P++}' input.fastq > output.fasta FASTA文件拆分: 1. 从a.fasta中提取第10至第20个序列存到b.fasta中 - awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=20{print ">&…
Union All : 与sql语言 Union All 一样,不用排序,上下合并多个表.Union All转换替代合并转换:输入输出无需排序,合并超过两个表 合并联接 : 有左连接.内连接.完全连接,只能关联两个表,连接前先排序. 合并 : 与sql语言 Union 一样,合并前先排序,上下合并两个表 在数据库中创建一个表.并创建3个TXT文件,分别用于保存结果. 姓名  课程 分数 张三 语文 90 张三 数学 83 李四 语文 74 李四 数学 84 李四 物理 94 在项目中创建一个[数…
1. 将大文件拆分为小文件 I 通过二进制的方式将大文件读取出来,将其拆分存,以不同的文件方式存放在一个目录下面 II 提供两种操作方式交互式和命令行模式 #! usr/bin/python # -*- coding:utf-8 -*- import sys, os megebytes = 1024 * 1000 chunksize = int(1.4 * megebytes) def clear_dir(target_dir): """ 清空目录 :param target…
import java.io.FileInputStream; import java.io.IOException; import java.io.InputStream; import java.io.RandomAccessFile; import java.io.SequenceInputStream; import java.util.Vector; public class RandonFileAccessTest { public static void main(String[]…
今天是12月1号,前期用kettle做了月报自动报表的转换和作业,今天运行时候发现一个报表的程序跑起来失败,心里很纳闷,上过月刚跑的没问题,怎么会无缘无故的失败. 通过看kettle运行日志,发现一个错误,c盘left no space 也就是在系统盘上没有足够的空间存储临时表,这时候才考虑到可能是在转换的步骤里设置的步骤过多,有很多个表输入, 由于kettle输出执行顺序是自上而下,但是输入是无序的,在很多步骤同时输入的时候就会占用很大的内存,性能就会很慢. 打开那个出问题的kettle转换文…
本文实例总结了php常用数组array函数.分享给大家供大家参考,具体如下: array_combine 功能:用一个数组的值作为新数组的键名,另一个数组的值作为新数组的值 案例: <?php $a = array("one","two","three"); $b = array("一","二","三"); $c = array_combine($a,$b); print_r($c…
fai示例: Sc0000003 2774837 10024730 60 61 Sc0000004 2768176 12845826 60 61 Sc0000005 2756750 15660150 60 61 Sc0000006 2627294 18462857 60 61 Sc0000007 2472379 21133951 60 61 Sc0000008 2452568 23647548 60 61 NAME Name of this reference sequence LENGTH T…
如果像上图那样将一单元格内拆分成同等大小的字词,可用如下步骤: 1.将该单元格的宽度缩至拆分词的大小: 2.选择同列的适当的单元格,用于填充拆分的字符: 3.点击“开始”-->填充-->两端对齐. 如果反过来将拆分的词合并成一个,则可以这么做: 1.将同列的单元格宽度拉伸至可以填充所有字词的宽度: 2.再使用“填充”-->两端对齐即可.…
metalink文档:1320133.1和1512633.1 map scott.emp1, target scott.emp1 ,FILTER(@RANGE(1,3));  --拆分 map scott.emp1, target scott.emp1 ,FILTER(@RANGE(2,3)); map scott.emp1, target scott.emp1 ,FILTER(@RANGE(3,3)); add replicat reptab02, exttrail ./dirdat/tl,e…