基因调控网络的概念在之前已经简要介绍过:https://www.cnblogs.com/pear-linzhu/p/12313951.html 沃丁顿表观遗传景观(The Waddington's epigenetic landscape) 是描述基因调控下细胞分化的动态性的一个经典的隐喻,是由沃丁顿在1957年提出的.他将细胞分化比喻作从高处沿山坡滚落下的小球,直到一个稳定的盆地 (basin),该盆地也就代表一定的分化状态.小球最开始能量较高,处于不稳定状态,对应干细胞等未分化的细胞状态,小…

本文为入门级的基因调控网络文章,主要介绍一些基本概念及常见的GRN模型. 概念:基因调控网络 (Gene Regulatory Network, GRN),简称调控网络,指细胞内或一个基因组内基因和基因之间的相互作用关系形成的网络,特指基因调控 (gene regulation) 导致基因之间的作用.GRN是生物体内控制基因表达的机制,基因表达的主要过程是转录+翻译 GRN构建方法:多数方法使用静态数据来分析基因网络,如基因表达矩阵,该矩阵是一个时刻的基因表达情况.实际上,我们需要考虑动态网络,…

易基因(羟)甲基化DNA免疫共沉淀测序(h)MeDIP-seq研究成果见刊<Journal of Clinical Investigation> 2022年5月2日,中南大学湘雅二医院赵明教授团队.中国医学科学院皮肤病医院陆前进教授团队合作在Journal of Clinical Investigation上发表了题为"Iron-dependent epigenetic modulation promotes pathogenic T cell differentiation in…

RNA-seq这个工具该什么时候用?ATAC-seq该什么时候用?有相当一部分项目设计不行,导致花大钱测了一些没有意义的数据. 还是在中心法则这个框架下来解释,这是生物信息的核心.打开华大科技服务官网梳理一下现在到底都有些什么测序技术: 全基因组测序和重测序 - 组装以及寻找变异 (外显子和目标区域测序) RNA-seq测序 - 基因表达 (smRNA,lncRNA,circRNA,PB全长,可变剪切) 甲基化测序 ChIP-seq和ATAC-seq 蛋白组 - 所有蛋白的变化 代谢组 - 植物…

简介 Hopfield Network (霍普菲尔德网络),是 Hopfield 在1982年提出的一种基于能量的模型,发表的文章是 Neural networks and physical systems with emergent collective computational abilities.基本结构如下图所示: 首先我们来看Hopfield Network的一句话定义: Hopfield Network is a model that can reconstruct data af…

[论文标题]Collaborative Memory Network for Recommendation Systems    (SIGIR'18) [论文作者]—Travis Ebesu (Santa Clara University).—Bin Shen (Google).—Yi Fang (Santa Clara University) [论文链接]Paper(10-pages // Double column) [摘要] 在现代网络平台上,推荐系统对于保持用户对个性化内容的关注起着至关…

一.简介 马上大四了,最近在暑期实习,在数据挖掘的主业之外,也帮助同事做了很多网络数据采集的内容,接下来的数篇文章就将一一罗列出来,来续写几个月前开的这个网络数据采集实战的坑. 二.马蜂窝评论数据采集实战 2.1 数据要求 这次我们需要采集的数据是知名旅游网站马蜂窝下重庆区域内所有景点的用户评论数据,如下图所示: 思路是,先获取所有景点的poi ID,即每一个景点主页url地址中的唯一数字: 这一步和(数据科学学习手札33)基于Python的网络数据采集实战(1)中做法类似,即在下述界面: 翻页…

Java - 网络编程(NetWork)   一.java.net包下的 InetAddress 类的使用:     > 一个 InetAddress 代表着一个IP地址     > 主要用来查看本机的IP和主机名   1.方法介绍:     > InetAddress inet = InetAddress.getByName("www.baidu.com");:调用静态方法创建一个对象     > getHostName();:返回IP地址的域名     &g…

在上一篇文章中,我们已使用Spring Cloud和Netflix OSS中的核心组件,如Eureka.Ribbon和Zuul,部分实现了操作模型(operations model),允许单独部署的微服务相互通信.在本文中,我们继续关注微服务环境中的故障处理,通过Hystrix(Netflix Circuit Breaker)提升服务弹性. 现在我们建立的系统开始出现故障,组合服务(composite service)依赖的部分核心服务突然没有反应,如果故障没有正确处理,将进一步损害组合服务.…

系列目录 概述 Kubernetes要求集群中所有pod,无论是节点内还是跨节点,都可以直接通信,或者说所有pod工作在同一跨节点网络,此网络一般是二层虚拟网络,称为pod网络.在安装引导kubernetes时,由选择并安装的network plugin实现.默认情况下,集群中所有pod之间.pod与节点之间可以互通. 网络主要解决两个问题,一个是连通性,实体之间能够通过网络互通.另一个是隔离性,出于安全.限制网络流量的目的,又要控制实体之间的连通性.Network Policy用来实现隔离性,…

一.Openfiler简介 Openfiler是一个操作系统,其提供基于文件的网络附加存储和基于块的存储区域网络功能. Openfiler支持的网络协议包括:NFS,SMB/CIFS,HTTP/WebDAV,FTP和iSCSI. Openfiler支持的网络目录包括:NIS,LDAP(支持SMB/CIFS密码加密),Active Directory(本地和混合模式),基于Windows NT的域控制器和Hesiod.认证协议包括Kerberos 5. Openfiler支持基于卷的分区技术:如本…

基于孪生卷积网络(Siamese CNN)和短时约束度量联合学习的tracklet association方法 Siamese CNN Temporally Constrained Metrics Tracklet Association MTT MOT 读 'B. Wang, L. Wang, et.al. Joint Learning of Siamese CNNs and Temporally Constrained Metrics for Tracklet Association[j],…

认真地做了一大摞一大摞的报表,老板没时间看?努力把能反馈的内容都融汇进图表里,老板嫌复杂?做了几个简单的报表,老板一眼就觉得信息不全面?每个报表都用了各种各样的图表,老板却毫无兴趣?明明很努力了,为什么依然得不到认可?<ignore_js_op> 讲师介绍:古金莹       现担任珠海奥威软件科技有限公司数据分析师一职,从事多年数据分析相关工作,专业性强,逻辑思维能力强:曾参与国家级.国际级数学建模竞赛,均荣获奖项:协助过政府统计局处理数据分析工作,在数据分析方面有着丰富的经验. 直播时间:…

基于Hadoop开发网络云盘系统客户端界面设计初稿 前言: 本文是<基于Hadoop开发网络云盘系统架构设计方案>的第二篇,针对界面原型原本考虑有两个方案:1.类windows模式,文件夹.文件方式,操作习惯完全按照Windows方式进行,提供右键菜单管理命令.2.浏览列表式,提供常规界面按钮式命令.本文采用的方式是文件清单列表式,至于第一种方式,另列专题进行说明. 一.界面原型 二.设计说明 连接管理:建立连接.断开连接.设置连接参数 文件操作:浏览文件.上传文件.下载文件.删除文件.导入文…

基于Hadoop开发网络云盘系统架构设计方案第一稿 引言 云计算技术的发展,各种网络云盘技术如雨后春笋,层出不穷,百度.新浪.网易都推出了自己的云盘系统,本文基于开源框架Hadoop设计实现了一套自己的网络云盘系统,方案为初步设计方案,不断完善中. 一.总体架构 二.方案说明 2.1 系统切分 从用户角度,整个系统划分为ECDisk客户端.ECDisk运营管理平台.HDFS分布式文件存储集群和账户数据应用平台四部分. 2.2 功能需求 文件管理:浏览.文件上传.文件下载.文件删除 用户管理:用户…

centos7 无法启动网络(service network restart)错误解决办法: (以下方法均为网上COPY,同时感谢原博主分享) systemctl status network.service 出现以下错误 "rtnetlink answers file exists" 的解决方法 第一种: 和 NetworkManager 服务有冲突,这个好解决,直接关闭 NetworkManger 服务就好了, service  NetworkManager stop,并且禁止开机…

一.背景: 项目中有一些特殊的需求,如个别渠道集成腾讯bugly,个别渠道集成易观统计,不同的渠道集成不同的推送策略(如Oppo渠道优先Opush推送),不同的渠道拥有不同的第三方登录集成等等.这些需求本身,往往都与外部集成进来的功能有关,且需求上,功能与渠道本身,有一定的映射关系,对于此类需求,具体项目构建时可以有如下几种策略: 1,不同的分支管理,以对应不同的差异化实现: 2,通过变体,实现不同的差异化构建: 3,通过Android Gradle参数化配置,实现差异化构建. 二.方案利弊分析…

爬虫+基于接口的网络爬虫 上一篇讲了[java爬虫]---爬虫+jsoup轻松爬博客,该方式有个很大的局限性,就是你通过jsoup爬虫只适合爬静态网页,所以只能爬当前页面的所有新闻.如果需要爬一个网站所有信息,就得通过接口,通过改变参数反复调该网站的接口,爬到该网站的所有数据信息. 本博客以爬金色财经新闻信息为对象,去爬取该网站从建站以来发表的所有新闻信息.下面会一步一步讲解.这里重点重点讲思路,最后我会提供完整源码. 第一步:找接口 你要获得该网站所有新闻数据,第一步当然是获得接口,通过接口来…

一..安装calico [root@k8s-master01 ~]# kubectl apply -f https://docs.projectcalico.org/v3.3/getting-started/kubernetes/installation/hosted/canal/rbac.yaml clusterrole.rbac.authorization.k8s.io "calico" created clusterrole.rbac.authorization.k8s.io &…

问题来源: 1 . 在测试fetch数据请求时,Xcode9.0以上的无法请求https, 需要在Xcode中加载项目后修改Info.plist的相关配置,具体如下参考 问题及解决方法一模一样,不再重新写了,直接转发前辈们的.只为了今后忘记操作而保存的笔记. 转发: 1 .  解决React Native使用Fetch API请求网络报Network request failed 2 . Mac上React Native的fetch请求报错Network request failed解决办法…

Java网络编程和NIO详解9:基于NIO的网络编程框架Netty 转自https://sylvanassun.github.io/2017/11/30/2017-11-30-netty_introduction/ netty是基于NIO实现的异步事件驱动的网络编程框架,学完NIO以后,应该看看netty的实现,netty框架涉及的内容特别多,这里只介绍netty的基本使用和实现原理,更多扩展的内容将在以后推出. 本系列文章首发于我的个人博客:https://h2pl.github.io/ 欢迎…

一.简介 接着几个月之前的(数据科学学习手札31)基于Python的网络数据采集(初级篇),在那篇文章中,我们介绍了关于网络爬虫的基础知识(基本的请求库,基本的解析库,CSS,正则表达式等),在那篇文章中我们只介绍了如何利用urllib.requests这样的请求库来将我们的程序模拟成一个请求网络服务的一端,来直接取得设置好的url地址中朴素的网页内容,再利用BeautifulSoup或pyspider这样的解析库来对获取的网页内容进行解析,在初级篇中我们也只了解到如何爬取静态网页,那是网络爬虫…

一.背景 1)梯度消失问题 我们发现很深的网络层,由于参数初始化一般更靠近0,这样在训练的过程中更新浅层网络的参数时,很容易随着网络的深入而导致梯度消失,浅层的参数无法更新. 可以看到,假设现在需要更新b1,w2,w3,w4参数因为随机初始化偏向于0,通过链式求导我们会发现,w1w2w3相乘会得到更加接近于0的数,那么所求的这个b1的梯度就接近于0,也就产生了梯度消失的现象. 2)网络退化问题 举个例子,假设已经有了一个最优化的网络结构,是18层.当我们设计网络结构的时候,我们并不知道具体多少层…

TP5_Splider 一个基于Thinkphp5+phpQuery 网络爬虫抓取数据接口 统一输出接口数据api.适合正在学习Vue,AngularJs框架学习 开发demo,需要接口并保证接口不跨域的问题,新闻分类(头条/军事/娱乐/体育/科技/艺术/教育/要闻)数据接口视频分类(精品视频/搞笑视频/美女视频/体育视频/新闻现场)接口,图片(cosplay)接口,花瓣相册接口,段子笑话接口.天气预报接口,IT资讯前端开发日报.知乎日报等 · 查看文档   https://ecitlm.git…

基于WebServices简易网络聊天工具的设计与实现 Copyright 朱向洋 Sunsea ALL Right Reserved 一.项目内容 本次课程实现一个类似QQ的网络聊天软件的功能:服务端采用WebServices提供技术支持,客户端采用Windows窗体,为用户提供网络聊天的简单功能. 二.项目目的与要求        掌握完整项目开发的流程: 掌握LINQto SQL类的使用: 掌握传递二进制文件的Web方法: 掌握Web服务中用户状态的管理: 三.项目环境 在win7系统下V…

基于ARP的网络扫描工具netdiscover   ARP是将IP地址转化物理地址的网络协议.通过该协议,可以判断某个IP地址是否被使用,从而发现网络中存活的主机.Kali Linux提供的netdiscover工具,就是借助该协议实施主机发现.它既可以以被动模式嗅探存活的主机,也可以以主动模式扫描主机.用户还可以根据网络稳定性,调整发包速度和数量.…

为什么需要网络拦截工具 通常我们会遇到这样的场景: 线上一个图片有异常,线下修正之后需要发布之前进行测试,有些情况下,QA同学有直接在线上环境测试的需求,只是链接本地资源,通常在windows下有一个很好的工具fiddler可以完成这个功能,当然mac下也有其对应的工具Charles,但是工具收费,在不付费的前提下,使用体验很差. 线上js资源出了bug,线下修复之后通过测试区不好还原场景,因为只有在线上的数据环境下才能重现bug,但是在线上的代码一般都是混淆过的,调试很不友好(这里不考虑生成s…

C++11:基于std::queue和std::mutex构建一个线程安全的队列 C++中的模板std::queue提供了一个队列容器,但这个容器并不是线程安全的,如果在多线程环境下使用队列,它是不能直接拿来用的. 基于它做一个线程安全的队列也并不复杂.基本的原理就是用std::mutext信号量对std::queue进行访问控制,以保证任何一个线程都是独占式访问,下面是完整的代码. /* * threadsafe_queue.h * * Created on: 2016年7月26日 * Aut…

基于GitLab CI搭建Golang自动构建环境 Golang发布遇到的问题 对于golang的发布,之前一直没有一套规范的发布流程,来看看之前发布流程: 方案一 开发者本地环境需要将环境变量文件改为正式环境配置 编译成可执行文件 发送给运维 (运维)将文件覆盖为线上 (运维)重启进程 (可谓“又臭又长”) 方案二 开发者讲代码commit到gitlab上交给运维同学 (运维)pull代码 (运维)编译成可执行文件 (运维)覆盖线上文件 (运维)重启进程 这种对于运维属于重度依赖,而运维同学又…

PDF 版本下载:抓住“新代码”的影子 —— 基于GoAhead系列网络摄像头多个漏洞分析 Author:知道创宇404实验室 Date:2017/03/19 一.漏洞背景 GoAhead作为世界上最受欢迎的嵌入式Web服务器被部署在数亿台设备中,是各种嵌入式设备与应用的理想选择.当然,各厂商也会根据不同产品需求对其进行一定程度的二次开发. 2017年3月7日,Seebug漏洞平台收录了一篇基于GoAhead系列摄像头的多个漏洞.该漏洞为Pierre Kim在博客上发表的一篇文章,披露了存在于1…