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search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: 核酸序列vs核酸库 $blastn -query file-in  -db database  -out file_out  -evalue 0.00001 -max_target_seqs 5  -num_threads 4  -outfmt format "7 qacc sacc evalue…
最近一段时间工作重心都将放在Linux下Desktop search(桌面搜索)框架的研发上.因此对desktop search进行了初步的调研.本文将从下面三个方面展开: Linux桌面环境(Desktop Environment on Linux) 现有的桌面搜索工具(Desktop Search tools) 学术界对Desktop search的研究情况 Linux桌面环境(Desktop Environment on Linux) 首先来说说桌面环境.所谓桌面环境,就是在原来命令行时代…
Elasticsearch 6.x版本全文检索学习之Search API. 1).Search API,实现对es中存储的数据进行查询分析,endpoind为_search,如下所示. 方式一.GET /_search,对es中所有的数据进行查询. 方式二.GET /my_index/_search,针对单个索引的数据进行查询. 方式三.GET /my_index1,my_index2/_search,针对两个索引的数据进行查询. 方式四.GET /my_*/_search,指定索引查询,可以一…
使用velocity后,原来的很多标签无法使用了,必须借助velocity tools来完成,目前velocity tools最新版本是2.0,下面是velocity tools的一些注意事项: 1. 与Spring MVC 3.x/4.x的集成问题 Spring 3.x/4.x只支持1.3.x的velocity tools,要使用2.0必须自己扩展VelocityToolboxView类 package org.springframework.web.servlet.view.velocity…
1. 概念: Binary-search tree(BST)是一颗二叉树,每个树上的节点都有<=1个父亲节点,ROOT节点没有父亲节点.同时每个树上的节点都有[0,2]个孩子节点(left child AND right child).每个节点都包含有各自的KEY值以及相应的satellite data.其中KEY是几种BST基本操作的主要操作对象. 2. BST的特别性质: BST任何一颗子树上的三个节点left, parent, right. 满足条件left.key<parent.key…
原文网址:http://blog.csdn.net/xukai871105/article/details/15029843 1.安装     I2C驱动载入和速率修改请查看博文[树莓派学习笔记——I2C设备载入和速率设置]. 2.I2C总线扫描     通过i2cdetect -l指令可以查看树莓派上的I2C总线,从返回的结果来看树莓派含有两个I2C总线,通过阅读相关的资料,树莓派1代使用I2C0,而树莓派2代使用I2C1. pi@raspberrypi:~$ i2cdetect -l i2c…
from: https://secure.clcbio.com/helpspot/index.php?pg=kb.page&id=113 Can I run a local BLAST search again multiple blast databases simultaneously? (blast, blastn, blastp, blastx, serveral databases)By default, you will be offered single BLAST databas…
前言 最近开始尝试学习Elastic Search,因此决定做一些简单的整理,以供后续参考,快速上手使用ES. 简介 ElasticSearch是一个基于Lucene的搜索服务器.它提供了一个分布式多用户能力的全文搜索引擎,基于RESTful web接口.Elasticsearch是用Java开发的,并作为Apache许可条款下的开放源码发布,是当前流行的企业级搜索引擎.设计用于云计算中,能够达到实时搜索,稳定,可靠,快速,安装使用方便. 我们建立一个网站或应用程序,并要添加搜索功能,但是想要完…
原文网址:http://blog.csdn.net/xukai871105/article/details/18234075 1.载入设备 方法1——临时载入设备 sudo modprobe -r i2c_bcm2708  #卸载设备 -r代表remove sudo modprobe i2c_bcm2708     #重新载入设备 方法2——永久载入设备     打开配置文件,进行修改 sudo nano /etc/modules                # 使用nano打开文件     …
与 Selective Search 初次见面是在著名的物体检测论文 「Rich feature hierarchies for accurate object detection and semantic segmentation」,因此,这篇论文算是阅读 R-CNN 的准备. 这篇论文的标题虽然也提到了 Object Recognition ,但就创新点而言,其实在 Selective Search .所以,这里只简单介绍 Selective Search 的思想和算法过程,对于 Objec…