为什么需要做meta分析 群体分层是GWAS研究中一个比较常见的假阳性来源. 也就是说,如果数据存在群体分层,却不加以控制,那么很容易得到一堆假阳性位点. 当群体出现分层时,常规手段就是将分层的群体独立分析,最后再做meta分析. 1.如何判断群体是否分层 先用plink计算PCA,具体方法详见链接:GWAS群体分层 (Population stratification):利用plink对基因型进行PCA 随后画出PC1和PC2在不同群体的散点图,观察群体之间是否明显分开,如果明显分开,说明群体…

IDispatch* pDisp = NULL; IDispatch* pDisp2 = NULL; IHTMLDocument2 *pHtmlDoc2 = NULL; IHTMLElementCollection* pCol; IHTMLMetaElement *pMeta = NULL; BSTR bUrl = NULL; BSTR bstr = NULL; try { if ((pDisp = m_WebBrowser.get_Document()) && SUCCEEDED(pDi…

从前面的章节<Robotium源代码分析之Instrumentation进阶>中我们了解到了Robotium所基于的Instrumentation的一些进阶基础.比方它注入事件的原理等,但Robotium作为一个測试框架.其功能远不止于仅仅是方便我们注入事件,其应该还包括其它高级的功能,參照我们前面其它框架如MonkeyRunner,UiAutomator和Appium的源代码分析,我们知道一个移动平台自己主动化測试框架的基本功能除了事件注入外起码还应该有控件获取的功能. 所以,这篇文章我们主…

从上一章<Robotium源码分析之Instrumentation进阶>中我们了解到了Robotium所基于的Instrumentation的一些进阶基础,比如它注入事件的原理等,但Robotium作为一个测试框架,其功能远不止于只是方便我们注入事件,其应该还包含其他高级的功能,参照我们前面其他框架如MonkeyRunner,UiAutomator和Appium的源码分析,我们知道一个移动平台自动化测试框架的基本功能除了事件注入外起码还应该有控件获取的功能.所以,这篇文章我们主要是围绕Robo…

苏宁易购WAP的meta分析 响应式 meta设置 媒体查询时读的width为viewport的宽度.viewport宽度为手机分辨率.比如note2 1280*720.需要重置为设备 640*360 方式 类型 css javascript 原理 媒体查询宽.高范围.设置html的font-size基准值 (window.innerWidth/psd的初始化宽度)*psd的初始font-size.算出当前网页的font-size.赋给html 特征 优点: 纯css解决 缺点: 需要在页面渲染…

现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp,大多数都找到了很多的snp,而且snp都落在非编码区了,这就导致对这些snp的解读非常的困难. 目前,已经有非常傻瓜式的GWAS pipeline了,比如:A tutorial on conducting genome‐wide association studies: Quality contr…

本文首发于“生信补给站”微信公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w 更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号,给您干货. Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见,其实COX生存分析也能用森林图展示. 之前分享过绘制KM曲线R|生存分析(1),诺莫图展示COX结果Nomogram(诺莫图) | Logistic.Cox生存分析结果可视化,本文将简单的介绍如何使用R-survminer包绘制Cox生…

使用Kafka最新版本0.9 Kafka 配置 1. 安装 首先需要安装Java,推荐安装Java8,不然会出现一些莫名其妙的错误 kafka_2.11-0.9.0.0.tgz tar -xzf kafka_2.11-0.9.0.0.tgz 为了方便,更改一下目录名 mv kafka_2.11-0.9.0.0.tgz kafka 2.配置Kafka服务端属性 安装的是单节点,集群的配置非常简单,可以看看其他的资料 cd config vim server.properties 有2个关键属性需要…

该文献纳入了EGG(Early Growth Genetics Consortium)和UK biobank两大数据库,分为欧洲祖先和非欧洲祖先群体.这两个数据用到的样本量分别如下: Early Growth Genetics Consortium(网址:http://egg-consortium.org/) » 30 studies (European ancestry) N=75,891 » 6 studies (Non-European ancestry), N=10,104 UK Bio…

meta-analysis是用统计的概念与方法,去收集.整理与分析之前学者专家针对某个主题所做的众多实证研究,希望能够找出该问题或所关切的变量之间的明确关系模式,可弥补传统的Review Articles(文献综述)的不足. 根据统计假设的不同可将Meta 分析方法分为两类:固定效应模型和随机效应模型,前者假设所有研究享有共同的真实效应大小,后者假设所有研究的真实效应大小不同,具体体现在计算所有研究平均效应的权重上.由于随机效应模型比较符合实际,得到了Meta分析家们的认可,正被广泛应用开来.…