[loj3526]修改DNA】的更多相关文章

如果$a[x..y]$和$b[x..y]$的某种字符数量不同,显然无解 考虑一个$[x,y]$的排列$p[x..y]$,使得$\forall x\le i\le y,a_{i}=b_{p_{i}}$,即最终要让$i$到$p_{i}$的位置 建有向边$(i,p_{i})$,由于每一个点入度和出度都为1,即构成若干个环,而一个大小为$l$的环仅需要交换$l-1$次即可,那么总交换次数为$(y-x+1)-$环数 问题即构造$p_{i}$并最小化交换次数,也即最大化环数 对于$a_{i}=b_{i}$的…
DNA Sequence Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 9889   Accepted: 3712 Description It's well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it's very useful to analyze a segment of DNA Sequence,For exa…
                       Blender的修改器(modifier)模块,默认界面右下块(Property)面板的扳手,分类(修改.生成.形变.模拟)列出所有的修改器.也可以空格键输入modifier,出现"Add Modifier"后点击即可.我参与翻译了官方的修改器文档,也跟着制作双螺旋结构的DNA教程走了一遍,算是对修改器有个大致的了解.制作很简单,用上细分表面(Subsurf).镜像(Mirror).阵列(Array).曲线(Curve)四个修改器.首先添加…
题目链接 题意: 给n串有疾病的DNA序列,现有一串DNA序列,问最少修改几个DNA,能使新的DNA序列不含有疾病的DNA序列. 思路: 构建AC自动机,设定end结点,dp[i][j]表示长度i的前缀串走到自动机的j点最少需要修改几个DNA.状态转移方程.那么只要转移到下一个的DNA不是end结点就能转移,如果下一个DNA不和原序列不一样就+1. #include <bits/stdc++.h> const int N = 50 + 5; const int M = 1000 + 5; co…
题意: 生物课上我们学到,DNA序列中只有A, C, T和G四种片段. 经科学发现,DNA序列中,包含某些片段会产生不好的基因,如片段"ATC"是不好片段,则"AGATCC", "CATCAA", "ATCATC"都是不好的DNA序列,这些不好片段我们可以称为病毒片段. 现在已知m个病毒片段, 然后给定一个DNA串,问如果使用最少的修改(将DNA中的某个字母,变为其他字母,比如A变T,但变的字母也只能是"ACTG&q…
问题:Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a DNA is represented as a string containing characters 'A', 'G' , 'C' and 'T'. The repairing techniques a…
题目一串DNA最少需要修改几个基因使其不包含一些致病DNA片段. 这道题应该是AC自动机+DP的入门题了,有POJ2778基础不难写出来. dp[i][j]表示原DNA前i位(在AC自动机上转移i步)且后缀状态为AC自动机结点j的最少需要修改的基因数 转移我为人人型,从dp[i][j]向ATCG四个方向转移到dp[i+1][j'],如果结点被标记包含致病基因就不能转移. #include<cstdio> #include<cstring> #include<queue>…
[编程题](满分27分) 脱氧核糖核酸即常说的DNA,是一类带有遗传信息的生物大分子.它由4种主要的脱氧核苷酸(dAMP.dGMP.dCMT和dTMP)通过磷酸二酯键连接而成.这4种核苷酸可以分别记为:A.G.C.T. DNA携带的遗传信息可以用形如:AGGTCGACTCCA.... 的串来表示.DNA在转录复制的过程中可能会发生随机的偏差,这才最终造就了生物的多样性. 为了简化问题,我们假设,DNA在复制的时候可能出现的偏差是(理论上,对每个碱基被复制时,都可能出现偏差): 1. 漏掉某个脱氧…
题目大意:给你N个DNA的串,也就是至包含'A','T','G','C'四种碱基的,这些给定的串都是带有遗传病的,然后给你一个不会超过1000的串,问你至少几个地方才能让这个串不包含遗传病,如果不论怎么修改都没用,输出'-1'   分析:用dp[Ni][nNode],表示长度为i时候到达第n个节点修改的最小次数,然后统计最后一层次最小次数就行了.   代码如下: ===================================================================…
生物信息原理作业第三弹:DNA序列局部比对,利用Smith–Waterman算法,python3.6代码实现. 实例以及原理均来自https://en.wikipedia.org/wiki/Smith%E2%80%93Waterman_algorithm. DNA序列局部比对 转载请保留出处! import numpy as np import pandas as pd sequence1 = 'TGTTACGG' sequence2 = 'GGTTGACTA' s1 = '' s2 = ''…
生物信息学原理作业第二弹:利用Needleman–Wunsch算法进行DNA序列全局比对. 具体原理:https://en.wikipedia.org/wiki/Needleman%E2%80%93Wunsch_algorithm. 利用Needleman–Wunsch算法进行DNA序列全局比对 转载请保留出处! 贴上python代码: # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Sat Nov 25 18:20:01 2017 @autho…
洛克菲勒说:“如果把我剥得一文不名丢在沙漠的中央,只要一行驼队经过——我就可以重建整个王朝.”这话反过来可以这样说,方法不对路,也不肯干的人,哪怕给一笔财富(比如人生小目标一个亿),最好的结果是跑赢CPI,让钱不贬值,如果方法错误,甚至能烧光. 我理直气壮地说,我平时专研技术,加班吃苦,最终是为了挣钱,我相信大家内心深处一定能认可这点.不过在很多忙天忙地的时候,我是不是偏离了挣钱这个大目标? 之前我写过篇博文,在上海软件行业,我见到的年入50万的众生相——我们该如何努力从而达到这个目标.在这篇博…
bzoj4892 [TJOI2017]DNA 给定一个匹配串和一个模式串,求模式串有多少个连续子串能够修改不超过 \(3\) 个字符变成匹配串 \(len\leq10^5\) hash 枚举子串左端点,hash 求 lcp 枚举断点,接着跳过断点,记作一次修改,最多修改 \(3\) 次.特判修改 \(3\) 次后剩余部分是否相等. 时间复杂度 \(O(n\log n)\) 代码 #include <bits/stdc++.h> using namespace std; typedef unsi…
All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACGAATTCCG". When studying DNA, it is sometimes useful to identify repeated sequences within the DNA. Write a function to find all the 10-letter-long seq…
Description 加里敦大学的生物研究所,发现了决定人喜不喜欢吃藕的基因序列S,有这个序列的碱基序列就会表现出喜欢吃藕的性状,但是研究人员发现对碱基序列S,任意修改其中不超过3个碱基,依然能够表现出吃藕的性状.现在研究人员想知道这个基因在DNA链S0上的位置.所以你需要统计在一个表现出吃藕性状的人的DNA序列S0上,有多少个连续子串可能是该基因,即有多少个S0的连续子串修改小于等于三个字母能够变成S. Input 第一行有一个数T,表示有几组数据 每组数据第一行一个长度不超过10^5的碱基…
DNA repair Time Limit: 2000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 4815   Accepted: 2237 Description Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a…
题意:给你几个模式串,问你主串最少改几个字符能够使主串不包含模式串 思路:从昨天中午开始研究,研究到现在终于看懂了.既然是多模匹配,我们是要用到AC自动机的.我们把主串放到AC自动机上跑,并保证不出现模式串,这里对AC自动机的创建有所改动,我们需要修改不存在但是符合要求的节点,如果某节点的某一子节点不存在,我们就把这个子节点指向他父辈节点存在的该节点(比如k->next[1]不存在,k->fail->next[1]存在,我们就把他改为k->next[1] = k->fail-…
[TJOI2017]DNA 题目描述 加里敦大学的生物研究所,发现了决定人喜不喜欢吃藕的基因序列S, 有这个序列的碱基序列就会表现出喜欢吃藕的性状,但是研究人员发现对碱基序列S,任意修改其中不超过3个碱基,依然能够表现出吃藕的性状. 现在研究人员想知道这个基因在DNA链\(S_{0}\)上的位置. 所以你需要统计在一个表现出吃藕性状的人的DNA序列\(S_{0}\)上,有多少个子串可能是该基因, 即有多少个\(S_{0}\)的子串修改小于等于三个字母能够变成S. 输入输出格式 输入格式: 第一行…
题目描述 加里敦大学的生物研究所,发现了决定人喜不喜欢吃藕的基因序列S,有这个序列的碱基序列就会表现出喜欢吃藕的性状,但是研究人员发现对碱基序列S,任意修改其中不超过3个碱基,依然能够表现出吃藕的性状.现在研究人员想知道这个基因在DNA链S0上的位置.所以你需要统计在一个表现出吃藕性状的人的DNA序列S0上,有多少个连续子串可能是该基因,即有多少个S0的连续子串修改小于等于三个字母能够变成S. 输入输出格式 输入格式: 第一行有一个数T,表示有几组数据 每组数据第一行一个长度不超过10^5的碱基…
题目描述 脱氧核糖核酸即常说的DNA,是一类带有遗传信息的生物大分子.它由4种主要的脱氧核苷酸(dAMP.dGMP.dCMT和dTMP)通过磷酸二酯键连接而成.这4种核苷酸可以分别记为:A.G.C.T. DNA携带的遗传信息可以用形如:AGGTCGACTCCA.... 的串来表示.DNA在转录复制的过程中可能会发生随机的偏差,这才最终造就了生物的多样性. 为了简化问题,我们假设,DNA在复制的时候可能出现的偏差是(理论上,对每个碱基被复制时,都可能出现偏差): 1. 漏掉某个脱氧核苷酸.例如把…
https://www.luogu.org/problemnew/show/P3763 加里敦大学的生物研究所,发现了决定人喜不喜欢吃藕的基因序列S,有这个序列的碱基序列就会表现出喜欢吃藕的性状,但是研究人员发现对碱基序列S,任意修改其中不超过3个碱基,依然能够表现出吃藕的性状.现在研究人员想知道这个基因在DNA链S0上的位置.所以你需要统计在一个表现出吃藕性状的人的DNA序列S0上,有多少个连续子串可能是该基因,即有多少个S0的连续子串修改小于等于三个字母能够变成S. 是的这篇代码过不了BZO…
洛谷题目链接:[TJOI2017]DNA 题目描述 加里敦大学的生物研究所,发现了决定人喜不喜欢吃藕的基因序列S,有这个序列的碱基序列就会表现出喜欢吃藕的性状,但是研究人员发现对碱基序列S,任意修改其中不超过3个碱基,依然能够表现出吃藕的性状.现在研究人员想知道这个基因在DNA链S0上的位置.所以你需要统计在一个表现出吃藕性状的人的DNA序列S0上,有多少个连续子串可能是该基因,即有多少个S0的连续子串修改小于等于三个字母能够变成S. 输入输出格式 输入格式: 第一行有一个数T,表示有几组数据…
经过一个月的学习,对pf_ring DNA的内核部分有了一些认识,本文侧重pf_ring对ixgbe的改动分析. 先说一说接收流程吧,流程如下: 其中,硬中断处理函数是ixgbe_msix_clean_rings( );软中断处理函数是net_rx_action( ). pf_ring对ixgbe的改动主要在ixgbe_poll()和ixgbe_clean_rx_irq()中. 在ixgbe_poll( )中遍历每个队列并轮询处理数据包,代码如下. int ixgbe_poll(struct n…
题目链接:https://vjudge.net/problem/HDU-2457 DNA repair Time Limit: 5000/2000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Others)Total Submission(s): 3126    Accepted Submission(s): 1661 Problem Description Biologists finally invent techniques…
题意:给出一些不合法的模式DNA串,给出一个原串,问最少需要修改多少个字符,使得原串中不包含非法串. 解题关键:多模式串匹配->AC自动机,求最优值->dp,注意在AC自动机上dp的套路. AC自动机上的每个节点其实就是一种状态,进行模式匹配其实就是进行边的匹配 令$dp[i][j]$表示字符串长度为$i$时到达AC自动机上某个状态所需要修改的最小值. 转移方程:$dp[i + 1][Next[j][k]] = \min (dp[i][j] + (k! = str[i]),dp[i + 1][…
DNA repair Problem Description   Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a DNA is represented as a string containing characters 'A', 'G' , 'C' and '…
Web.config的读取 对于Web.config的读取大家都很属性了.平时我们用得比较多的就是appSettings节点下配置.如: 我们对应的代码是: = ConfigurationManager.AppSettings[“OAuth_QQ_ClientId”]; = ConfigurationManager.AppSettings[“OAuth_QQ_CallbackUrl”]; = ConfigurationManager.AppSettings[“OAuth_QQ_ClientScr…
读完本文你会知道,如何在没有源码的情况下,直接修改一个 DLL 以去除 DLL 上的强命名限制,并在该程序集上直接添加你的“友元程序集(一种特殊的 Attribute,将它应用在程序集上,使得程序集内的 internal 类型能够被其它程序集直接调用)”.以此类推,你可以用此方法,直接修改程序集,达到想要的目的. 银行的一个项目,客户要求使用他们现有的的  Teradata 数据库,项目组第一个想到的是 NHibernate ,但是几乎没有找到关于 NHibernate 支持 Teradata…
因为长时间没有使用数据库了,或者把密码改完之后就忘了数据库密码,不能正常进入数据库,也无法修改密码,有一个简单的常用修改密码方式: 1.首先找到和打开mysql.exe和mysqld.exe所在的文件夹(在你所安装的Mysql的bin文件夹下),复制路径地址. 2.Windows+R打开cmd命令提示符,进入上一步mysql.exe所在的文件夹. 3.输入命令  mysqld --skip-grant-tables  回车,此时就跳过了mysql的用户验证.注意输入此命令之后命令行就无法操作了,…
在SQL Server中,使用Create Database创建数据库,使用Alter Database命令,能够修改数据库的数据文件和日志文件. 一,创建数据库 1,在创建数据库时,最佳实践是: 创建一个或多个文件组,并设置默认文件组 每个文件组中的数据文件和CPU的内核数据相同,将文件均匀分布在不同的物理硬盘上,使IO均匀分布在不同的物理磁盘上: 数据文件的初始大小,文件增长和最大大小保持一致,这样,能够使每个文件的IO次数相对均匀: 日志文件分配在性能最好的物理硬盘上,写日志的性能直接影响…