Python学习笔记(十四): Json and Pickle模块 shelve模块 1. Json and Pickle模块 之前我们学习过用eval内置方法可以将一个字符串转成python对象,不过,eval方法是有局限性的,对于普通的数据类型,json.loads和eval都能用,但遇到特殊类型的时候,eval就不管用了,所以eval的重点还是通常用来执行一个字符串表达式,并返回表达式的值. 1. 什么是序列化 我们把对象(变量)从内存中变成可存储或传输的过程称之为序列化,在Python中…
接上一节  python学习笔记--Django入门四 管理站点 设置字段可选 编辑Book模块在email字段上加上blank=True,指定email字段为可选,代码如下: class Author(models.Model): first_name = models.CharField(max_length=) last_name = models.CharField(max_length=) email = models.EmailField(blank=True ) 所有字段都默认bl…
以Mark Lutz著的<Python学习手册>为教程,每天花1个小时左右时间学习,争取两周完成. --- 写在前面的话 2013-7-23 21:30 学习笔记 1,包导入是把计算机上的目录变成Python的命名空间.包导入时也可以使用import和from语句.目录路径只能以点号.间隔.例如有这样一个目录结构: dir0/dir1/dir2/mod.py 则导入语句如下: import dir1.dir2.mod 导入时必须遵循如下规则: dir1和dir2目录中必须含有一个__init_…
# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = {'chr1':10,'chr2':20,'chr3':30,'chr4':40,'chr5':15} # 求和 total_len = sum(chr_len.values()) # 获取键用keys for chr in chr_len.keys(): print(chr) # 获取值用values for len in chr_len.values(): print(len) # 获取键值对用items for [chr,le…
# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = [10,20,30,40,50] # 求和 # 方法一:通过循环 total_len = 0 #定义total_len的初始长度 for len in chr_len: # 从列表chr_len中每次取一个值交给len total_len += len # 或者total_len = total_len + len # 方法二:通过函数sum() total_len = sum(chr_len) # 求最长染色体编号 max_len…
读取fasta文件genome_test.fa,并计算染色体总长,同时输出最长染色体编号.序列以及长度 fasta文件genom_test.fa的内容如下: >chr1ATATATATAT>chr2ATATATATATCGCGCGCGCG>chr3ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT>chr4ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG>chr5ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCG…
含有染色体长的文件chr_len.txt chr1 10chr2 20chr3 30chr4 40chr5 50 python脚本 #传递命令行参数 import sys # 导入模块 # 从命令行获取文件名称 f_chr_len = sys.argv[1] # 定义命令行参数,1表示变量1 # 打开文件 open('文件路径') f = open(f_chr_len) # 逐行读取 total_len = 0 lines = f.readlines() # 是一个列表 for line in…
# 传递命令行参数 # 导入sys模块 import sys print(sys.argv)   命令行操作 python argv.py 10 20 30 40 50 回车输出 ['argv.py', '10', '20', '30', '40', '50']   # 方法一,删掉第0个元素 del(sys.argv[0]) print(sys.argv)   命令行操作 python argv.py 10 20 30 40 50 回车输出 ['10', '20', '30', '40', '…
# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_seq = 'ATATATATAT' chr2_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCG' chr3_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT' chr4_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG' chr5_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT' # 求和 tot…
# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_len = 10 chr2_len = 20 chr3_len = 30 chr4_len = 40 chr5_len = 50 # 求和 total_len = chr1_len + chr2_len + chr3_len + chr4_len + chr5_len # 输出结果 print(total_len)…