16S基因作为mark gene在微生物群落结构的研究中发挥中重要作用, 但是候选的mark gene 肯定不止16S 一种,最新比较火热的功能基因,也可以作为mark gene.利用功能基因作为mark  gene, 相比16S有什么优势呢? 在功能基因的文献中指出了两点: 1) 不同物种的16S基因序列可能完全相同,尤其是在二代测序中,我们通常指扩增16S的部分序列,这样不同物种扩增出来的序列完全相同的概率大大增加,这样不同有效的区分物种,所以说利用16S基因做的species 水平的注释,…

一.MongoDB数据库简介 简介 MongoDB是一个高性能,开源,无模式的,基于分布式文件存储的文档型数据库,由C++语言编写,其名称来源取自"humongous",是一种开源的文档数据库──NoSql数据库的一种.NoSql,全称是 Not Only Sql,指的是非关系型的数据库. 特点 MongoDB数据库的特点是高性能.易部署.易使用,存储数据非常方便.主要功能特性有: * 面向集合存储,易存储对象类型的数据. * 模式自由. * 支持动态查询. * 支持完全索引,包含内部…

Oracle数据库简介 一.介绍 Oracle数据库系统是美国Oracle(甲骨文)公司提供的以分布式数据库为核心的一组软件产品,是目前最流行的客户/服务器(Client/Server,C/S)或浏览器/服务器(Browser/Server,B/S)体系结构的数据库之一. Oracle数据库是目前世界上使用最为广泛的数据库管理系统,作为一个通用的数据库系统,它具有完整的数据管理功能:作为一个关系数据库,它是一个完备关系的产品:作为分布式数据库它实现了分布式处理功能. 截止至2015年06月,Or…

Markdown版本笔记 我的GitHub首页 我的博客 我的微信 我的邮箱 MyAndroidBlogs baiqiantao baiqiantao bqt20094 baiqiantao@sina.com 数据库 升级 SQLite onUpgrade 总结 MD 目录 目录SQLite数据库简介SQLite数据库升级单级升级跨级升级案例第一版需求第二版需求第三版需求 SQLite数据库简介 官方网站 Android使用开源的.与操作系统无关的SQL数据库SQLite. SQLite第一个A…

MongoDB的名字源自一个形容词humongous(巨大无比的),在向上扩展和快速处理大数据量方面,它会损失一些精度,在旧金山举行的MondoDB大会上,Merriman说:“你不适宜用它来处理复杂的金融事务,如证券交易,数据的一致性可能无法得到保证”.若想了解更多关于MongoDB的信息,请看51CTO数据库频道推荐<MongoDB,无模式文档型数据库简介>. NoSQL数据库都被贴上不同用途的标签,如MongoDB和CouchDB都是面向文档的数据库,但这并不意味着它们可以象JSON(J…

1.3 数据库简介 每一个独立核算的企业都有一套相互关联的账簿体系, 把这一套完整的账簿体系建立在计算机系统中就称为一个数据库. 一般一个企业只用一个数据库. 如果企业有几个下属的独立核算的实体,也可以为每个实体单独创建数据库.数据库之间是相对独立的,也就是说:建立.删除或修改一个数据库中的数据,不会对其它数据库有任何影响. 1.3.1 创建数据库 在真正开始使用Odoo之前,你首先需要创建一个数据库. 在登录窗口上选择“数据库管理”. 主控密码:也叫超级管理员密码,拥有这个密码的用户可以对数据…

PHI是一个致病菌的数据库,截止到2017年8月1号为止,最新的版本是4.3,数据库中收录了实验验证过的致病菌的信息,其中有176个来自动物的致病菌,227个来自植物的致病菌,3个来自真菌的致病菌; 4.3版本中数据库的具体信息如下: 共收录了4775个基因, 相互作用有8610条, 致病菌有264种, 宿主有173种,疾病有428种,References 参考文献有2330种 数据库网址如下: http://www.phi-base.org/index.jsp 在数据库的记录中,包含以下几个比…

KEGG, 简称京都基因组百科全书,包含了许多的数据库,对于研究基因功能来说,KEGG orthology 数据库是最基本的一个数据库: KEGG Orthology 简称KO, 对于每个功能已知的基因,会把和其同源的基因所有基因都归为一类,就是每一个KO, 并赋予一个K number, 用该基因的功能作为这个KO的功能: 基于同源基因具有相似功能的假设,把每个基因的功能进行了扩充,对于某个物种中功能研究的很清楚的基因,在不同的物种间搜寻该基因的同源基因,将这些同源基因定义为一个ortholog…

MySql数据库简介: 众所周知,MySql数据库是一款开源的关系型数据库,在Web应用方面,MySql是最好的.最流行的RDBMS(Relational Database Management System,关系型数据库管理系统)应用软件. MySql的4大特点: 1.MySql是开源的,免费的. 2.MySql支持带星的数据库,可以处理上千万条数据. 3.MySql使用标准的SQL数据语言. 4.MySql跨平台性极强,可以安装在不同的操作系统,并且提供了多种变成语言的接口. MySql数据…

ScienceDirect数据库1. Elsevier简介荷兰Elsevier 是全球最大的科学文献出版发行商,已有180多年的历史.其产品涵盖科学.技术和医学等各个领域,包括1800多种学术期刊(大部分被SCI.SSCI.EI收录,是世界上公认的高品位学术期刊), 5000多种书籍以及电子版全文和文摘数据库.2. ScienceDirect数据库简介Science Direct数据库是Elsevier公司的核心产品,也是全球最大的科学文献全文数据库,涵盖了科学.技术以及医学领域的21个学科(数…