MPI.NET是用于Microsoft.NET环境的高性能.易于使用的消息传递接口(MPI)实现.mpi是编写在分布式内存系统(如计算集群)上运行的并行程序的事实上的标准,并且得到了广泛的实现.大多数MPI实现为在C.C++和FORTRAN中编写MPI程序提供了支持.mpi.net提供了对所有.net语言(尤其是c)的支持,并包含重要的扩展(例如对象的自动序列化),使构建在群集上运行的并行程序更加容易. MPI.NET 作者的Github:https://github.com/jmp75/MPI…

第五章:高性能并行计算 一个反复被提及的反对使用Python进行高性能数值计算的言论是这种语言是动态解释型的,速度太慢.一种编译型低级语言,如C,能提供比它快几个数量级的运算速度.我们在第三章--使用IPython进行数值计算中已经引入了向量化这一概念表示了对这种观点的反对.NumPy 数组的运算速度甚至可以和C一样快,因为低速的Python循环可以使用快速的C循环替代.尽管有时会出现一些复杂的算法不能进行向量化或很难向量化,幸运的是我们还有其他的解决方案而不用丢弃所有的Python代码用C重写…

转载:https://zhuanlan.zhihu.com/p/25332041 前言 在高性能计算的项目中我们通常都会使用效率更高的编译型的语言例如C.C++.Fortran等,但是由于Python的灵活性和易用性使得它在发展和验证算法方面备受人们的青睐于是在高性能计算领域也经常能看到Python的身影了.本文简单介绍在Python环境下使用MPI接口在集群上进行多进程并行计算的方法. MPI(Message Passing Interface) 这里我先对MPI进行一下简单的介绍,MPI的全…

这里的内容主要是都志辉老师<高性能计算之并行编程技术——MPI并行程序设计> 书上有一些代码是FORTAN的,我在学习的过程中,将其都转换成C的代码,便于统一记录. 这章内容分为两个部分:MPI对等模式程序例子 & MPI主从模式程序例子 1. 对等模式MPI程序设计 1.1 问题背景 这部分以Jacobi迭代为具体问题,列举了三个求解Jacobi迭代问题的MPI对等模式程序. 这里需要阐明一下,书上的Jacobi迭代具体的背景可以参考这个内容:http://www.mcs.anl.g…

一.MPI 知识点 1.MPI是什么 MPI是一个跨平台的通信协议,用于编写并行计算机,支持点对点和广播.MPI是一个信息传递应用程序接口,包括协议和语义说明,他们指明其如何在各种实现中发挥其特性.MPI的目标是高性能,大规模性和可移植性.MPI在今天仍为高性能计算的主要模型. 2.MPI 基本框架函数 MPI_Init 调用MPI_Init 是为了告知系统进行所必要的初始化设置.参数argc_p个argv_p是指向参数argc和argv的指针.当不需要的时候设置为NULL. int MPI_I…

高性能计算     ubantu下集群搭建 参考博客:https://blog.csdn.net/u012304016/article/details/52423738(尊重别人的知识产权),一些细节地方我做了标注 废话不多说,直接开始讲解 ============================================================== 1.安装MPICH 在安装mpich之前,为了避免在安装中出错,需要安装gcc.g++以及gfortran三个编译器. 首先更新ap…

思路: 只保留奇数 (1)由输入的整数n确定存储奇数(不包括1)的数组大小: n=(n%2==0)?(n/2-1):((n-1)/2);//n为存储奇数的数组大小,不包括基数1 (2)由数组大小n.进程号id和进程数p,确定每个进程负责的基数数组的第一个数.最后一个数和数组维度: low_value = 3 + 2*(id*(n)/p);//进程的第一个数 high_value = 3 + 2*((id+1)*(n)/p-1);//进程的最后一个数 size = (high_value - lo…

用c语言写了kmeans算法的串行程序,再用mpi来写并行版的,貌似参照着串行版来写并行版,效果不是很赏心悦目~ 并行化思路: 使用主从模式.由一个节点充当主节点负责数据的划分与分配,其他节点完成本地数据的计算,并将结果返回给主节点.大致过程如下: 1.进程0为主节点,先从文件中读取数据集,然后将数据集划分并传给其他进程: 2.进程0选择每个聚类的中心点,并发送给其他进程: 3.其他进程计算数据块中每个点到中心点的距离,然后标出每个点所属的聚类,并计算每个聚类所有点到其中心点的距离之和,最后将这…

C#的优雅,强大IDE的支持,.net下各语言的二进制兼容,自从第一眼看到C#就被其良好的设计吸引.一直希望将其应用于高性能计算领域,长时间努力却效果却不尽如人意. 对于小的测试代码用例而言,C#用20-30%的性能损耗换取良好的开发维护体验倒是非常值得. 但FEM/CFD/SPH求解器的实际开发中,作为典型的运算密集型项目,对性能极其敏感.即使是单线程,未作充分优化前提下,运算耗时: C#:ASC C 未优化= 2:1 C#:ASC C 充分优化= 4:1   如手工循环展开,内联优化等 AS…

Time Limit: 1000MS Memory Limit: 10000K Description BIT has recently taken delivery of their new supercomputer, a 32 processor Apollo Odyssey distributed shared memory machine with a hierarchical communication subsystem. Valentine McKee's research ad…